23mi

Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease M49T mutant in complex with leritrelvir

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 82.7 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 23mi

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 23mi
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id23mi
沉积日期 deposition_date2026-02-11
最后修订 last_revision2026-06-03
结构标题 titleCrystal structure of SARS-CoV-2 main protease M49T mutant in complex with leritrelvir
关键词 keywords;SARS-CoV-2, NSP5, main protease, coronavirus, protease inhibitor, alpha-ketoamide inhibitor, peptidomimetic inhibitor, VIRAL PROTEIN ;; VIRAL PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier26.16
回转半径 Rg (电子) rg_electron25.30
零角强度 I(0) i0150588000.00
分子量 molecular_weight64835.0 kDa
排除体积 excluded_volume62638 ų
包络体积 envelope_volume102740 ų
水化壳体积 shell_volume33231 ų
包络直径 envelope_diameter88.5
壳层 Rg shell_rg33.19
包络 Rg envelope_rg25.41
形状 Rg shape_rg25.30
总 Rg total_rg25.90
总原子数 total_atoms4885
残基数 n_residues622
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax82.7
Rg (实空间) rg_real26.02
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.54
I(0) (实空间) i0_real1.5060e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.2970e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal26.06
I(0) (倒空间) i0_reciprocal150600000.0000
解质量估计 total_estimate0.8272
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary33.9
偏度 Skewness skewness0.147
峰度 Kurtosis kurtosis-0.538
角度范围 angular_range— – 0.3050 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha49420000.0000
实空间数据点数 n_real_points62
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.917; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.998; Smooth: 0.000

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (4)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)