8esw

Structure of mitochondrial complex I from Drosophila melanogaster, Flexible-class 1

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 213.5 Å Quality: EXCELLENT

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id	8esw
沉积日期 deposition_date	2022-10-15
结构标题 title	Structure of mitochondrial complex I from Drosophila melanogaster, Flexible-class 1
关键词 keywords	NADH:ubiquinone oxidoreductase, TRANSLOCASE, OXIDOREDUCTASE; OXIDOREDUCTASE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	79.72 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	79.64 Å
零角强度 I(0) i0	11282400000.00
分子量 molecular_weight	948160.0 kDa
排除体积 excluded_volume	1203600 Å³
包络体积 envelope_volume	1647900 Å³
水化壳体积 shell_volume	176290 Å³
包络直径 envelope_diameter	293.6 Å
壳层 Rg shell_rg	73.48 Å
包络 Rg envelope_rg	79.29 Å
形状 Rg shape_rg	79.62 Å
总 Rg total_rg	79.63 Å
总原子数 total_atoms	66555
残基数 n_residues	8063
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	213.5 Å
Rg (实空间) rg_real	75.42 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.87 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.0850e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.0790e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal	77.55 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	11220000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9127
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	74.7 Å
偏度 Skewness skewness	0.338
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.696
角度范围 angular_range	— – 0.1000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.3163
最高正则化参数 α highest_alpha	700800000.0000
实空间数据点数 n_real_points	21
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.001; Oscil: 0.979; Stabil: 0.987; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.998; Smooth: 0.001

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合体信息 (52)

Entity 1 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12
分子量 formula_weight	16848.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AN
原子数 atom_count	66555

MAKFLGINRLTKLFQMVREAGGLKQAYLKLYRNDDLKIGTLVGIDKYGNKYFENPYYFYGRNRWIEFAPHVNMDYDGSMIPAEWYGWMHYKTDLPPIRDGCRPKYKWIADHSENLSGTKEAYYPYSTTPNKVEAWEPKAKKQ

Entity 2 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial
分子量 formula_weight	14383.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S6

MASKQLVNNLSKLGLPRQNWMSPLASVRHSSCRGDIEKVTHTGQVFDKEDYRNARFVNAKRYVNENWGIKLIEEVPPKECTERVVFCDGGDGPLGHPKVYINLDKPGNHICGYCGLRFVKKDDHHH

Entity 3 polymer

描述 description	NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial
分子量 formula_weight	78724.2 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S1

MIRAPLVKALGALGSPTHQMASRAVRTSAMVAQTPAKAPEKIEVFVDDIPVQVVPGTTVLQAAAQIGVEIPRFCYHERLAVAGNCRMCLVEVEKSPKPVAACAMPVMKGWRIKTNSDLTRKAREGVMEFLLMNHPLDCPICDQGGECDLQDQAMAFGSDRSRFTDINYTGKRAVEDKDIGPLVKTIMTRCIHCTRCVRFASEIAGVDDLGTTGRGNDMQIGTYVEKLFLTELSGNVIDLCPVGALTNKPYSFVARPWEIRKVSSIDVLDAVGSNIVVSTRTNEVLRILPRENEDVNEEWLADKSRFACDGLKRQRLVAPMVRMPNGELQAVEWEGALIAVAKAIKAAGGQIAGISGQLADLEAQVALKDLLNRLGSEVVATEQGFIAGGTDNRANYLLNSTIAGLEEADAVLLVGTNPRYEAPLVNTRLRKAYVHNELQIASIGPKIDLSYDHENLGADAALVKDVCSGAHAFSKVLEGAKKPAIIIGADLLERADGAAIHATVAEYCKKLKKPNWNPFNVLQTNAAQVGALDVGYKAGAQTAVKAQPKVLFLLNADAGKVTREQLPKDCFVVYIGSHGDNGASIADAVLPGAAYTEKQGIYVNTEGRPQQTLPGVSPPGMAREDWKILRALSEVVGKPLPYDNLDELRNRLEDVAPHLTRLGQLEPAGDAGAAGTISKSIGGGAIDIKLKELRDYFMTDAISRASPTMAKCISAVNKQQRENEAKQSVAI

Entity 4 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial
分子量 formula_weight	30013.2 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S3

MAALIRNLGARAAVAALSAKHVVPAAGSTALRMASTTPVEPKKADKPTVRQPDAVARSHLSDFGRYVAECLPKYVQKVQLTAGDELEVLIAPEGVVPVLQFLKDHHQAQFTNLVDIAGVDVPCRKNRFEVVYNLLSLRYNSRIRVKTYTDELTPLDSACEVHKAANWYEREIWDMYGVFFANHPDLRRILTDYGFEGHPQRRDFPLSGYVELRYDDEKKRVVCEPLELAQEFRKFDLSAPWEQFPNFRNANPPAEVVPPQAPAKK

Entity 5 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase (Ubiquinone) 24 kDa subunit, isoform A
分子量 formula_weight	26814.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	V2

MLTNCASKTLAAVRANIRAIATSSARASDNLFVHRDTPEDNPNIPFEFTAENKKRVEAILSIYPEGHKRGAMIPLLDLAQRQYGWLPISAMHKVAEILQLPNMRVYEVATFYTMFMRKPTGKYHIQVCTTTPCWLRGSDDILETCKKQLGIGVGDTTKDRKFTISEVECLGACVNAPMVAINDDYYEDLTSKDMQDILNDLKADKISPPGPRNGRFASEPKGEPTSLSEEPKGPGFGLQAGL

Entity 6 polymer

描述 description	LD31474p
分子量 formula_weight	24622.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S7

MLRSAMMSSTLSRALQKATQTPNASISALPALNLALVRQQQTLPVAEVAQNLPKKGYSPFGTKQSSVAEWSLARLDDLLNWGRKGSIWPLTFGLACCAVEMMHIAAPRYDMDRYGVVFRASPRQADVIIVAGTLTNKMAPALRKVYDQMPEPRWVISMGSCANGGGYYHYSYSVVRGCDRIIPVDIYVPGCPPTAEALMYGVLQLQKKVKRMKTLQMWYRK

Entity 7 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase (ubiquinone) 23 kDa subunit
分子量 formula_weight	24610.0 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S8

MSLTMRIFTASRNGQRLFGSHGARLLAAQRAEPKDIVEVPKGYVYVNNKELSMEFADITDRAASTMFFGELLRGFAVTLAHIFKEPATINYPFEKGPLSPRFRGEHALRRYPSGEERCIACKLCEAICPAQAITIEAEERADGSRRTTRYDIDMTKCIYCGFCQEACPVDAIVEGPNFEFSTETHEELLYNKEKLLCNGDKWESEIASNLQADHLYR

Entity 8 polymer

描述 description	NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3
分子量 formula_weight	13572.5 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	3

MFSIIFIALLILLITTIVMFLASILSKKALIDREKSSPFECGFDPKSSSRLPFSLRFFLITIIFLIFDVEIALILPMIIIMKYSNIMIWTITSIIFILILLIGLYHEWNQGMLNWSN

Entity 9 polymer

描述 description	NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1
分子量 formula_weight	36383.5 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	1

MFYMEFILSLIGSLLLIICVLVSVAFLTLLERKVLGYIQIRKGPNKVGLMGIPQPFCDAIKLFTKEQTYPLLSNYLSYYISPIFSLFLSLFVWMCMPFFVKLYSFNLGGLFFLCCTSLGVYTVMVAGWSSNSNYALLGGLRAVAQTISYEVSLALILLSFIFLIGSYNMIYFFFYQVYMWFLIILFPMALVWVSISLAETNRTPFDFAEGESELVSGFNVEYSSGGFALIFMAEYASILFMSMLFCVIFLGCDVFNLLFYMKLTFISFVFIWVRGTLPRFRYDKLMYLAWKCFLSFSLNYLLFFIGFKILLFSLL

Entity 10 polymer

描述 description	NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4
分子量 formula_weight	51383.0 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	4

MLKIIFFLLFLIPFCFINNMYWMVQIMMFFISFIFLLMNNFMNYWSEISYFLGCDMLSYGLILLSLWICSLMLLASEMINKHNNYKNLFLLNIIILLLLLILTFSSMSLFMFYLFFESSLIPTLFLILGWGYQPERLQAGLYLLFYTLLVSLPMLIGIFYVMNKIGSMNFYLMNNFMFNYDLLYFCLLCAFLVKMPMFLVHLWLPKAHVEAPVSGSMILAGIMLKLGGYGMLRVISFLQLMNLKYSFVWISISLVGGVLVSLVCLRQTDLKALIAYSSVAHMGIVLSGLLTMTYWGLCGSYTLMIAHGLCSSGLFCLANVSYERLGSRSMLINKGLLNFMPSMTLWWFLLSSANMAAPPTLNLLGEISLLNSIVSWSWISMILLSFLSFFSAAYTLYLYSFSQHGKLFSGVYSFSSGKIREYLLMLLHWLPLNLLILKSESFMLWL

Entity 11 polymer

描述 description	NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5
分子量 formula_weight	65777.9 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	5

MKYLSICSISFVNLISMSLSCFLLSLYFLLNDMIYFIEWELVSLNSMSIVMTFLFDWMSLLFMSFVLMISSLVIFYSKEYMMNDNHINRFIMLVLMFVLSMMLLIISPNLISILLGWDGLGLVSYCLVIYFQNIKSYNAGMLTALSNRIGDVALLLSIAWMLNYGSWNYIFYLEIMQNEFEMLMIGSLVMLAAMTKSAQIPFSSWLPAAMAAPTPVSALVHSSTLVTAGVYLLIRFNIILSTSWLGQLMLLLSGLTMFMAGLGANFEFDLKKIIALSTLSQLGLMMSILSMGFLKLAMFHLLTHALFKALLFMCAGAIIHNMNNSQDIRLMGGLSIHMPLTSACFNVSNLALCGMPFLAGFYSKDMILEIVSISNVNMFSFFLYYFSTGLTVSYSFRLVYYSMTGDLNCGSLNMLNDESWIMLRGMMGLLIMSIIGGSMLNWLIFPFPYMICLPIYMKLLTLFVCIVGGLFGYLISLSNLFFLNKSLFMYNLSTFLGSMWFMPYISTYGMIFYPLNYGQLVVKSFDQGWSEYFGGQHLYQKLSMYSKTLFLMHNNSLKIYLLLFVFWILILLILLFL

Entity 12 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8
分子量 formula_weight	19873.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A8

MVITNNTTLPEESELNVQELNLSSAALRAGAFHLGKQCEQANNEFMLCRQELDDPRACLAEGKAVTSCALDFFRKVKKTCHEEFTQYATCLDKSSGTMAFSHCRKTQGVFDKCIKDNFDWDRPSYGYFSRAKVIQSAREAPKKEEKVSYPDATPGLPEDYPKPPAKYGSRFHWLE

Entity 13 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1
分子量 formula_weight	14878.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A1

MWFEILPGAVIITTLLSVPIYAMYGLDKLMIGNAFRRNMDERFSRVMYQRDFRLTDNPYKMNGLEQIPDEEVKKEEKDPNEDSDDPAIVKKREKERKLREKQLKKEEKLREKQLKEEEKQKKN

Entity 14 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13
分子量 formula_weight	17773.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AO

MATAVPHCPPKQDLPPPGGYKKIPFARVPPKSYFTGFTTIGTYVVVTAVGLGIYYLTAKKVKRDEIEMRSAQNVIFPILVAERDREFLRQLRRNRDEEAELMKNVPGWEVGTWYGEPVFKTLPEDTLVTPIFKEFYAHSDWKSYAKRAHLKLWS

Entity 15 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5
分子量 formula_weight	12016.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S5

MSLTPFLRLPLTDLTGCLINHQTYDKCGKFEMKMMECFEAYGLERGKRECADLISDFQECVGMQKQLMRFHAMRNERYKQWLKGERKGQEFFADPPRVDAY

Entity 16 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11
分子量 formula_weight	18433.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AM

MSLLRSKYYDHPDGEDAFGKIVATNKYAVSAGVAWSMFDVLTLSKPQGYLPTLGRFAYNTGPLMGMATAFTLTTLVATNARGKDDKINYLIGGFAAGGVFGAWKHNHVAGLCAGLFLGIAGVIKKMSIEQGWEFFPNTPIKQYGGLNIAGNDWTIMADPPKNWTTEKPKE

Entity 17 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10
分子量 formula_weight	18946.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	BL

MPEPRSPMASFAESVLNVIDGPITWFRESIVEPNQQKQNWYHQRFRRVPTIDQCYTDDAVCRFEADQQFRRDRMVDNEIVNILRQRFEDCTLYEAPDHMVKCRPLMDQYEKATENWFIKYGDLGGYANAKTAYMKQKHRLIWERRHGPVGSGMKEEAAH

Entity 18 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 6
分子量 formula_weight	19025.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B6

MVAGGASETGGVKPMVIAGRMVRERERLIGMSPEERAWRKQWLKDQELHHGPRKVPALELELNNPIKRFYRAPLDKVCNVLEPVLGFQRAYTVRFWTGKALLALTGIYAGAYYFKYNQNDWTRKGGWRVIHSRKQCVPGDEGYPKVSDRSAPSDYAARGFNESPLKA

Entity 19 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4
分子量 formula_weight	13157.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B4

MVLSNEEQEFIKRKHEATLKLRQEFLKQSSNPYRHATGEGGTVFDAGLARFQAMRVSNYEHFKPTGKSFRTGLFAVVLPIALYAWALKAERDGREEKYRTGQVAYKDRQFKFI

Entity 20 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7
分子量 formula_weight	13905.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B7

MGNALTHYMKPDVMPGPDVVPTFDPLLGFKSRKERVMIATQEEMESAKLPLEFRDYCAHLAIAYQACRSDTFPFVYKCAHQKHEYLTCEYEDYVLRMKEFERERRLLERQKRLNKAA

Entity 21 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial
分子量 formula_weight	22065.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B5

MVGWSRLLSPAAKFASYRAVLQEPACRNALHQQLRRMGGDHGHHQMIIKPSRFQWDKFKDLLHFYVMLGVIPVTALVLYANIFVGPAQLAEIPEGYEPKHWEYEKHPISRFISRYILNSDQQNYEKSLHYLYEENEKAQIRLLEDEVRRKMSERNDYQAYYYRPSVAKYHRISKEAADELEALRGD

Entity 22 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9
分子量 formula_weight	17416.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B9

MAQVPLAIVSHKRQVCSLYKRALRNLESWYDRRNVYRYRAVQLRARFDENRSKDLGEGIRLLACGQRELFETRHFQPRNFANSAGGCAFEREVIPPDWVLDYWHPLEKAQYPEYFAKREQRKKEFVTWWEKQYGKPDPKDLGHH

Entity 23 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial
分子量 formula_weight	16988.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	BM

MSALFRLTNRAVALQRSLVANQAAVVRAINTSPKKDETITAPTSLTTEDFANPSPKNWQSYGFDYKDQVEDRKATKSTFFVTVTLCLVWGSFYWAYLPDTQFRNWAQREGFLELRRRELAGVDLVSPNYVDPASITLPSDEDLGDTEIII

Entity 24 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial
分子量 formula_weight	20229.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B8

MSAFVKTVCLAQKLCAANPVVARQAIRSMAGWNKDYKPGPYPQTEKERLAAAKKYYLLPEEYKPYADDGLGYGDYPKLGYGLGVEAKDSYYPWDYPEHKRNQHEPISADHDLYSEDRWSQAEPPRYSNAYYFACFLGVMSGCLALYYWLDDKKMYRPVAAKQYPSPGVKHYTFEK

Entity 25 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3
分子量 formula_weight	12113.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B3

MGGHHGEPYTVPHASTYKVESVPQLVEVKEALGRQGLKDPWLRNEVWRYEPKAFGTHRSRLNTFLFRGLGVGFCAFLATVAVEYALGIGKGQGGHGHGHGHEEHGDKGHH

Entity 26 polymer

描述 description	Acyl carrier protein, mitochondrial
分子量 formula_weight	17258.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AC,AB

MSFTQIARSCSRLAATLAPRRVASGILIQSQASRMMHRIAVPSMTSQLSQECRGRWQTQLVRKYSAKPPLSLKLINERVLLVLKLYDKIDPSKLNVESHFINDLGLDSLDHVEVIMAMEDEFGFEIPDSDAEKLLKPADIIKYVADKEDVYE

Entity 27 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2
分子量 formula_weight	12925.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C2

MSAVNDPLELLTNKGTHEPSFLSPIWNPIACGVAGVGAAIFINWGFRKPVFSGIQKHIAFGAIGVGAGAYFDQKRNEYLAKRDAVLRHYIELHPDDFPVKERKTYGQVLESWVPVR

Entity 28 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1
分子量 formula_weight	6232.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B1

MVLGLDKRALWGALPLLGFAIGHFLDKKETERMTMFRDKSALYGRPAGSEGKAPSW

Entity 29 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial
分子量 formula_weight	20710.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S4

MSALRQVMCRSTASLQLYQANRAAAARWASTATDGGPLDPKTALARPEELEQRNKLSGKITVPTAVNLSPISGVPEEHIRERRVRIHIPPKNAMQSGTDNVNTWQIEFDNRERWENPLMGWASSGDPLSNMNVQFGSPEEAITFCERNGWRWYVDGAAKPKKERVKNYGINFAWNKRTRVSTK

Entity 30 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase (Ubiquinone) 39 kDa subunit, isoform A
分子量 formula_weight	46891.7 kDa
EC 编号 ec_number	1.6.99.3
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A9

MAAIVLTRNLQLAKHHGSGVVGVLCLRGYSAAAAPPEDGPRPLKTTNPAAMKRGTGGRSSFNGIVATVFGATGFVGRYVCNKLGKSGTQMILPYRGDDSDVIRLKVTGDLGQVLFHFYNLEDPASIRDAVKHSNVVINLVGRDFETKNFKFKDVHVNGAERIARIAREAGVERLIHLSSLNVEANPKDLYVKGGSEWLKSKYEGELRVRDAFPNATIIRPADIYGSEDRFLRYYAHIWRRQFRSMPLWHKGEKTVKQPVYVSDVAQAIINAAKDPDSAGRIYQAVGPKRYQLSELVDWFHRLMRKDQKRWGYMRYDMRWDPTFLLKAKLNSFICPGTPIGGLHPARIEREAVTDKVLTGVPTLEDLGVTLTTMEQQVPWELRPYRAALYYDAELGEFETPSPPKCIEARDELRLFA

Entity 31 polymer

描述 description	GEO11417p1
分子量 formula_weight	10758.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B2

MSFALRLGSSIGCFHRTILGRDIIQRKSHVVSYRNGPPPHSKATKIGALTVGGAMWWWVIWHLWHEPDHITGEFDYPNSRKWSNTELGVPKDGF

Entity 32 polymer

描述 description	Complex I-49kD
分子量 formula_weight	52986.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S2

MANIMRRTLIPGLSHLRLRPQLVAAGSAALTSQETRRGAAKWYPDPEFMKQFSGPVMYPDEVTSLWTVPPWNSKVTPVEKSVRNLTLNFGPQHPAAHGVLRLVLELDGETVMRADPHIGLLHRGTEKLIEYKTYTQALPYFDRLDYVSMMCNEQCYSLAVEKLLNIDVPLRAKYIRTLFAEITRILNHIMAVGTHALDVGALTPFFWLFEEREKMMEFYERVSGARMHAAYIRPGGVSLDMPLGLMDDIYEFASKFAERLDEVEDVLTTNRIWVQRTEDIGIVTAEEALNYGFSGVMLRGSGIKWDLRKQQPYDAYNLVNFDVPIGTKGDCYDRYLCRVEEMRQSLRIIDQCLNQMPAGEIKTDDAKVAPPSRSEMKTSMEALIHHFKLFTQGYQVPPGATYTAIEAPKGEFGVYLISDGSSRPYRCKIKAPGFAHLAALEKIGKQHMLADVVAIIGTLDVVFGEIDR

Entity 33 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3
分子量 formula_weight	2315.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	V3

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

Entity 34 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial
分子量 formula_weight	51898.7 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	V1

MAAIVRFNLLTKPQIVATLPASLHVQRFQSTQAPPPGTPPPQTKTKFGPLADEDRIFTNLYGRHDWRLKGALKRGDWYKTKEIVLKGADWIVNEIKTSGLRGRGGAGFPSGMKWSFMNKPGDGRPKYLVVNADEGEPGTCKDREIMRHDPHKLVEGCLIAGRAMGAQAAYIYIRGEFYNEASNMQLAIAEAYQAGLIGKNACGTGYDFDVFMHRGAGAYICGEETALIESLEGKQGKPRLKPPFPADVGVFGCPTTVTNVETVAVAPTICRRGGVWFASFGRTRNSGTKLFNISGHVNRPCTVEEEMSIPLKELIERHCGGVTGGWDNLLGVIPGGSSTPIIPKNVCDDVIMDFDGLIAAQTSLGTAAIIVMDKSTDVIKAIARLISFYKHESCGQCTPCREGIGWMNKIMTRFVKGDAQPAEIDMLWEISKQIEGHTICALGDGAAWPVQGLIRHFRPEIEKRMQLHAKRVSN

Entity 35 polymer

描述 description	NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2
分子量 formula_weight	39839.9 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	2

MFNNSSKILFITIMIIGTLITVTSNSWLGAWMGLEINLLSFIPLLSDNNNLMSTEASLKYFLTQVLASTVLLFSSILLMLKNNMNNEINESFTSMIIMSALLLKSGAAPFHFWFPNMMEGLTWMNALMLMTWQKIAPLMLISYLNIKYLLLISVILSVIIGAIGGLNQTSLRKLMAFSSINHLGWMLSSLMISESIWLIYFFFYSFLSFVLTFMFNIFKLFHLNQLFSWFVNSKILKFTLFMNFLSLGGLPPFLGFLPKWLVIQQLTLCNQYFMLTLMMMSTLITLFFYLRICYSAFMMNYFENNWIMKMNMNSINYNMYMIMTFFSIFGLFLISLFYFMF

Entity 36 polymer

描述 description	NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L
分子量 formula_weight	11363.9 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	4L

MIMILYWSLPMILFILGLFCFVSNRKHLLSMLLSLEFIVLMLFFMLFIYLNMLNYESYFSMMFLTFSVCEGALGLSILVSMIRTHGNDYFQSFSIM

Entity 37 polymer

描述 description	NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6
分子量 formula_weight	20083.6 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	6

MIQLMLYSLIITTSIIFLNMIHPLALGLTLLIQTIFVCLLTGLMTKSFWYSYILFLIFLGGMLVLFIYVTSLASNEMFNLSMKLTLFSSLILIFMLILSFIMDKTSSSLFLMNNDMQSIINMNSYFMENSLSLNKLYNFPTNFITILLMNYLLITLIVIVKITKLFKGPIRMMS

Entity 38 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7
分子量 formula_weight	11562.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A7

MSALRRDVSPLIQRIRAFLLGREHNLALRFEDGLADRTQPQPEIPDGPSHLLSANYYCQRDGRREVLPPIDLVEQQKQLAAEGEAAKAPSSKLPTPGKVYAWD

Entity 39 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase (Ubiquinone) 13 kDa B subunit
分子量 formula_weight	13808.1 kDa
EC 编号 ec_number	1.6.99.3
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A5

MAKIIKASTGLTGLAVSTNPHHTLSALYGKILRAVSKMPQDASYRKYTEQLVKQRADSVAQHKDITALEKAVGCGQVEELIVQAENELILARKMLGWKPWEKLVQAAPAKQWDWPPAQIMEPKV

Entity 40 polymer

描述 description	RH45008p
分子量 formula_weight	8412.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A3

MSASAARGSTSLLKRAWNEIPDIVGGSALALAGIVMATIGVANYYAKDGDNRRYKLGYVVYRHDDPRALKVRNDEDD

Entity 41 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6
分子量 formula_weight	14921.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A6

MAGREAVKRAVQQVRPILSVDREEARKRALNLYKAWYRQIPYIVMDYDIPMTVEQCRDKLREEFVKHRNVTDIRVIDMLVIKGQMELKESVEIWKQKGHIMRYWKESQDPKPTDFLSKFIQGVN

Entity 42 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial
分子量 formula_weight	46955.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AL

MTAVFRVGLVRLVSRATQSPNLLQAQTNALPAAFQQRCSISGKTMRGGPRVPKAAPYPYKTKKYSVFNAIFDKTSKRFDENSKVICVEGPIAAGKSKFAKELAEELDMEYYPAVDLDLIYINSYGYDMRKLDPQLPPSCRSYDVRNFCLDPSHDLAAQFQIRMYMLRYSQYIDALQHVLSTGQGVVLERSPYSDFVFMEAMFRQGYLSRGARSVYNELRQNTIGELLKPHLVIYLDLPVDAVKKQIKARNVDYEVQSKVFSDAYLSDLEQLYKQQYLKDISTHAELLIYDWTAGGETEVVVEDIERIDFNQFEADIHNKKMLDWRFPLEAEWCEARIKYCHEKPDLMNYFNVPRFDVPELVRSADDGKVWRDVWFNAPGMKYRPGYNADMGDEGLLTKTKIGINQGI

Entity 43 non-polymer

描述 description	CARDIOLIPIN
分子量 formula_weight	1464.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

Entity 44 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

Entity 45 non-polymer

描述 description	IRON/SULFUR CLUSTER
分子量 formula_weight	351.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

Entity 46 non-polymer

描述 description	FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER
分子量 formula_weight	175.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

Entity 47 non-polymer

描述 description	1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE
分子量 formula_weight	790.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	14

Entity 48 non-polymer

描述 description	1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine
分子量 formula_weight	748.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	13

Entity 49 non-polymer

描述 description	S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] tetradecanethioate
分子量 formula_weight	568.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

Entity 50 non-polymer

描述 description	NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE
分子量 formula_weight	745.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

Entity 51 non-polymer

描述 description	FLAVIN MONONUCLEOTIDE
分子量 formula_weight	456.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

Entity 52 non-polymer

描述 description	2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	507.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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7. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.30 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	293389

fit	/app/data/saxs_computation/es/8esw/8esw.fit
pddf	/app/data/pr_computation/es/8esw/8esw.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/es/8esw/8esw.dat

Structure of mitochondrial complex I from Drosophila melanogaster, Flexible-class 1

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

1. 结构基本信息 1. Structure Basics

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合体信息 (52)

Entity 1 polymer

聚合体 Polymer

Entity 2 polymer

聚合体 Polymer

Entity 3 polymer

聚合体 Polymer

Entity 4 polymer

聚合体 Polymer

Entity 5 polymer

聚合体 Polymer

Entity 6 polymer

聚合体 Polymer

Entity 7 polymer

聚合体 Polymer

Entity 8 polymer

聚合体 Polymer

Entity 9 polymer

聚合体 Polymer

Entity 10 polymer

聚合体 Polymer

Entity 11 polymer

聚合体 Polymer

Entity 12 polymer

聚合体 Polymer

Entity 13 polymer

聚合体 Polymer

Entity 14 polymer

聚合体 Polymer

Entity 15 polymer

聚合体 Polymer

Entity 16 polymer

聚合体 Polymer

Entity 17 polymer

聚合体 Polymer

Entity 18 polymer

聚合体 Polymer

Entity 19 polymer

聚合体 Polymer

Entity 20 polymer

聚合体 Polymer

Entity 21 polymer

聚合体 Polymer

Entity 22 polymer

聚合体 Polymer

Entity 23 polymer

聚合体 Polymer

Entity 24 polymer

聚合体 Polymer

Entity 25 polymer

聚合体 Polymer

Entity 26 polymer

聚合体 Polymer

Entity 27 polymer

聚合体 Polymer

Entity 28 polymer

聚合体 Polymer

Entity 29 polymer

聚合体 Polymer

Entity 30 polymer

聚合体 Polymer

Entity 31 polymer

聚合体 Polymer

Entity 32 polymer

聚合体 Polymer

Entity 33 polymer

聚合体 Polymer

Entity 34 polymer

聚合体 Polymer

Entity 35 polymer