8g4i

40S ribosomal subunit of the 80S Giardia intestinalis assemblage A ribosome with Emetine bound in V1 conformation

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 265.6 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id	8g4i
沉积日期 deposition_date	2023-02-09
结构标题 title	40S ribosomal subunit of the 80S Giardia intestinalis assemblage A ribosome with Emetine bound in V1 conformation
关键词 keywords	Giardia lamblia, Ribosome structure, Translation, parasite, RIBOSOME; RIBOSOME
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	71.27 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	73.19 Å
零角强度 I(0) i0	25406900000.00
分子量 molecular_weight	976350.0 kDa
排除体积 excluded_volume	1066700 Å³
包络体积 envelope_volume	1772700 Å³
水化壳体积 shell_volume	196580 Å³
包络直径 envelope_diameter	244.0 Å
壳层 Rg shell_rg	74.63 Å
包络 Rg envelope_rg	72.26 Å
形状 Rg shape_rg	73.27 Å
总 Rg total_rg	73.04 Å
总原子数 total_atoms	117725
残基数 n_residues	5788
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	265.6 Å
Rg (实空间) rg_real	75.37 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.93 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.5600e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	5.8730e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal	71.05 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	25390000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8783
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	72.4 Å
偏度 Skewness skewness	0.573
峰度 Kurtosis kurtosis	0.019
角度范围 angular_range	— – 0.1100 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.9969
最高正则化参数 α highest_alpha	2293000000.0000
实空间数据点数 n_real_points	23
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.742; Stabil: 0.848; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.988; Smooth: 0.703

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合体信息 (38)

Entity 1 polymer

描述 description	18S rRNA
分子量 formula_weight	470516.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	2
原子数 atom_count	118402

CAUCCGGUCGAUCCUGCCGGAGCGCGACGCUCUCCCCAAGGACGAAGCCAUGCAUGCCCGCUCACCCGGGACGCGGCGGACGGCUCAGGACAACGGUUGCACCCCCCGCGGCGGUCCCUGCUAGCCGGACACCGCUGGCAACCCGGCGCCAAGACGUGCGCGCAAGGGCGGGCGCCCGCGGGCGAGCAGCGUGACGCAGCGACGGCCCGCCCGGGCUUCCGGGGCAUCACCCGGUCGGCGCGGUCGCGGCGCGCCGAGGGCCCGACGCCUGGCGGAGAAUCAGGGUUCGACUCCGGAGAGCGGGCCUGCGAGACGGCCCGCACAUCCAAGGACGGCAGCAGGCGCGGAACUUGCCCAAUGCGCGGCGCGCGAGGCAGCGACGGGGAGCGCGCGAGCGAGGCGGGCCCACAGCCCCCGCCGCGGAGCCGAGGGCAAGGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCGGCGAGCGUCGCGCGGCGCUGCUGCAGUUGAAACGCCCGUAGUUGGCCCCCCGCCGCCACGAGGAAACGGGAGCGCUCCAGGCAGGCCCGUUGGACCCGCCGCGUGGGACCGCGCAGCGGGCGCGGCGCGCCGCGGCAGCCCCGAGGAGAGCGGGCGGGGGCACCGGUACCGGCCGGGGACGGGUGAAACAGGAUGAUCCCGCCGAGACCGCCGGCCGCGCAGGCGCCUGCCAAGACCGCCUCUGUCAAUCAAGGGCGAAGGCCGGGGGCUAGAAGGCGAUCAGACACCACCGUAUUCCCGGCCGUAAACGGUGCCGCCCCGCGGCCGGCGCGCGCGUCCCGCCGGCCGCCCAGGGAAACCGGGAGGCUCCGGGCUCUGGGGGGAGUAUGGCCGCAAGGCUGAAACUUGAAGGCAUUGACGGAGGGGUACCACCAGACGUGGAGUCUGCGGCUCAAUCUGACCCAACGCGCGCACCUCACCAGGCCCGGACGCGCGGAGGACCGACAGCCGGGCGCGCUUUCGCGAUCGCGCGGGCGGUGGUGCAUGGCCGCUCCCAGCCCGUGGCGCGAGCCGUCUGCUCCAUUGCGACAACGAGCGAGACCCCGGCCGCGGGCGCCGCGGGACGGCCCGCGCGAGCGGGAGGACGGCGGGGCGAUAGCAGGUCUGUGAUGCCCUCAGACGCCCUGGGCCGCACGCGCGCUACACUGGCGGGGCCAGCCGGCGCCCGCGAGGACGCGCGGAGCCCCCGCCGUGGCCGGGACCGCGGGCUGGAACGCCCCCGCGCACCAGGAAUGUCUUGUAGGCGCCCGCCCCCACCGCGCGCCGGACGCGUCCCUGCCCCUUGUACACACCGCCCGUCGCUCCUACCGACUGGGCGCGGCGGCGAGCGCCCCGGACGCGCGAAGGGCCGCGAGCCCCCGCGCCUGGAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUAUCCGUAGGUGAACCUGCGGAUGGAUCCCU

Entity 2 polymer

描述 description	40S ribosomal protein SA
分子量 formula_weight	28101.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A

MSTEKTSQASKEYQLKEADVKKMLVATTHLGVRNIDRRMQFYIFDRQKDGTFVFNLQKVWAKIVFAARILVTIDDPAEIAVVANRPDAQRAILKFCKYTHATAFPGRFIPGNFTNRMNPNYCEPRLLLVNDPVVDRQAILEASYVNIPTISLCNSDANLKFIDVAIPCNNKTPMSIGLIYWLLAREVLRLKGSISRTEEWDVKPDLFVALPEEIPDEEESEDFYDDDEEEDEEFSAGNGNLFDEY

Entity 3 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S3a
分子量 formula_weight	28413.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MAIGGNKTGKKKITQRKNPDPYLKKEWYPVIAPAHFKSRHIGQTPVTKTAGLRVATDVINHRVYEVNLGDLNPGAEDLNGNTKFYLQTQLVSDGKCLTNFHGMDITRHKYGSLFRKGCDCIDVFMDIPTTDGYLLRVFVIAFTDRFRFQRRKNCHVKGRVIRMMRAGIYETLHNELGKVSIPVLVTKLSNFEVNAKLTEALQKITMCRDVMIRRVKVVKRPRNTMELLSTMHDSNQVRNLAEGQSIQQ

Entity 4 polymer

描述 description	Ribosomal protein S2
分子量 formula_weight	26765.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MQAESAPRPERPERGERGPRQMEEEEWHPSTKLGRLVKAGKIESLYDIFKYSLPIKETEIIDYFFPKSELAEEVCNIMSVQKQTTAGQRTRFRAHVIVGNRDGFIGYGAGVSKEVANAIKKAAKNARLNIVPVRRGFWGGKLGDPHTVSSKLSGKCGSVRVRLIPAPRGAGIVASPTVAKVLEFAGVSDVFTRQSGHSRTLMNSVGAVYNALKSSYSILTPDLWKKEQLDHVQDIRTMSLAD

Entity 5 polymer

描述 description	Ribosomal protein S3
分子量 formula_weight	24779.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MPRIVRRDEENVYYSKYLNDCIMEAELHEFFSRELVDAGYASCSLCRTIDSICVIIQCAEPEVVMGDNHYRLHKIEYLLAGRFMCDPKNFNIWVDKIIKRGLSAEIMVDNLRAKLEEAMPIRRAAYSIIRTAMRAGAAGCEVIVAGKLRAQRARANKFKEGCLISTGHPKRIFLAEATRHIKMRQGVIGVKVRIYNPNIRGAVMPDKIEIGAFSRQK

Entity 6 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S4
分子量 formula_weight	30464.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MARGVRKHLKRLNAPKHWLLDKMGGIWAPRPTNGPHGLRECIPLILILRNRLHYANTYAETSMILQDKNVLIDGKPRTDPTFPVGFMDVFEIPKVHKTFRVLYDVKGRFTLVPIQSNEAGFKLCRVQKIFLGDKGMPYLSTHDARTIRFPHPDIKTNDTIKINLKTGKIDEWYKFDIGKIVMVTGGRNCGRIGTIQAIDKHMGSYTMIRMKDTEGTEFLTRLCNVFVIGNDSPAVAIPTTKGIRPDIIKNRELRLRSIAKRGGGASYE

Entity 7 polymer

描述 description	SSU ribosomal protein S7P (Fragment)
分子量 formula_weight	21058.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MSLEVALFNKWPLTDVKCQDESLEAYISIDNHSFVPHSAGRWSAKRFRKAKCPVVERLTNSLMMHGRNSGKKLMAMKTVGEAFELINLYTGKNPVQVLVDAVANSGPREDSCRIGKGGQVRRQSVDVSPLRRVNIGIYNIATGARKAAFRKVRPFAECLAEEIMNAAAGADKSYAISQRNSVERIAVSNR

Entity 8 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S6
分子量 formula_weight	28084.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MPKGSFCKVNISNPVTGANKSLMIEDFRKSQTIHGLRMASEFDGAALGEEYAGCTFRITGGNDAQGFPMYQGVLKSQRARLLLRQGAKCYLHRRNGERKRKSIRGCIVGPDLHALSVVLVDAGDKTLPGLTDVVVPKRLVPKRASKIRRLFGLPTTKVDPKDQMLVCELIKELGHEVTLKNGEKKLKYPKVQRVVTDEKYARKQRVIAEKKEIMRKSLQQLEEYKALLSRMGKQHNIRIYKPAKRTVE

Entity 9 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S7
分子量 formula_weight	23073.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MNFHLTRSIPSMTFPAQRKIRKPFEKLSELEKQVAGTLLKLEDDPDLREMGLGTLYISSVKEIAVDGDKKAAVVYVPYPMLQSFQKNSEALILKLEKNHSGHRFIIVANRTIMKNAYVFTGKKSIRRPRSRTMTSVYNCILDDICYPIHVIGKRTLYPAGSNPRLQVVLPKAVYNEVSERTKTYSAVYKALTERDTEFIFM

Entity 10 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S8
分子量 formula_weight	19451.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MGITHDKMYKRSKTGAVQGKWHKKRKYNLGRQPANTKLIVKVTSKKNEGQKISTIRCRGGNIKRRALRLSHGSFAWGSADISHKARILQVVYNSTSNELVRTNTLVKGCVVQIDSAPFKSALSNDTLDKEILDQIRGDHILARISSRPGQVGTADGYILEGPELLFYQKKLAPK

Entity 11 polymer

描述 description	Ribosomal protein S9
分子量 formula_weight	21699.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MPRISRHRNSSKTYSTPKKPFTKPRLDAELKLCGEYGLKCKREIYRARYMLAKIRRTARNLLTLDENDIKRRFEGAALLRRLHMLGILDEEKDQLDYVLGLRIEDIFKRRLQSVIVESKLAKSVHHARNMIKARHISVGGQIVNIPSYMVRISNTSRVAIADTSSLAPNGKPGRTKRAAARRQSSGDNE

Entity 12 polymer

描述 description	Ribosomal protein S10B
分子量 formula_weight	15406.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MVHIPKAVYKAVYAHLYENASLALKEYWRVGNVPGITYVDENGKLCNPTYLHVNCIMQSLESRGVVKDTFAWRHHYYLLTEKGEQFIRKELDLTDDVLPTPYSKPSIKPPQYAQCFSSKGKPDRAPQPKPDEAK

Entity 13 polymer

描述 description	SSU ribosomal protein S17P
分子量 formula_weight	23160.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

MSATKDKQQSNAGAKVGGRHPLRPDPDRERRALERAETLRKAAYEMAENQHERAYHKQSQIFQGRFLRKDNARCLRFYKSIGMGYHTPITAINGTYIDKKCPFTGNVSIRGRILRGVVHSAKMQRSIIVRRDYLHFVQKYKRYERRHKHVAAHLSPCFRVKEGDIVTIGECRPLSKTIRFNVIKVEPVSEAAKKRFSPF

Entity 14 polymer

描述 description	Ribosomal protein S13
分子量 formula_weight	17627.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N

MGRMHSKGKGISRSAIPYTRAPAPWNKYTPEDVCEQICKLAKKGTPPSRIGLILRDQFAIGQVKNVTGSKIVRILKAKGLAPEIPEDLYCMIKKAVAIRKHLERSRRDKDSKFRLILVESRIHRLARYYRQARRLPPTFRYKSDQAAALLATYA

Entity 15 polymer

描述 description	Ribosomal protein S14
分子量 formula_weight	15756.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O

MSRKVTYAPENLPAKNNNSEAFAVCHIYAGKNDTFIHVTDLSGRETIGRVSGGMKVKRHCDEPSAYAAMQATQDLIEIITDRGITAVHIKIRADGGTGKRVYGQGGSAAIRALVRGGIKIGRIEDSTPIPTDRTRHKGGRRGRRL

Entity 16 polymer

描述 description	Ribosomal protein S15
分子量 formula_weight	16728.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P

MTDQVKTRRRGLAQPNFRGVEVEKLATMKITDILPKLNARCRRRIGKHGLSMKHLRFVNKLRLRRAAQPSQKPKIVRTHLRDMIIFPEMIGMTVSVYNGRQFIPVEIKPPMVGRALREYSMSYKIVSHGKVGIGATRSSKFVPLR

Entity 17 polymer

描述 description	Ribosomal protein S16
分子量 formula_weight	17634.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q

MAKGNRRDLLERNDIEVRERDKYTVHTLGKKKNSVAVAFVKAGKGDILVNNVPLALVRPEILRTKVSEPIMILGESLFKGLDMNIKVAGGGHVSQIYAVRQAISRGVLASVKDEAARSELRAKLVSYDRQLVVSDPRRCEAKKFGGRGARARRQKSYR

Entity 18 polymer

描述 description	Ribosomal protein S17
分子量 formula_weight	15757.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R

MGKVRTKTIKRAARKIVENNYESLKPKDFQNNKAICSKRNVAIIPSKRLRNKVAGYVTTLMNRVVKGPVHGISLRLQEEERERRDNYAPKKSEFDVENITVSGATQQMIDSIGFKCMSTSLKVIDPTMRKRARDTRE

Entity 19 polymer

描述 description	Ribosomal protein S18
分子量 formula_weight	17510.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S

MTTIVQPNDYRDLLRMFNTNIQGKVVLECALVGIKGIGRRFANVALKKANIDVHKRAGELTAAEEDALMKVLEDPLSHGIPAWMLNRNNDFESGKDMHILVNTIASTHRADLERLRKTRCERGVRHHHNLKVRGQHTKSTGRRGHVVGVQRKKK

Entity 20 polymer

描述 description	SSU ribosomal protein S19E (Fragment)
分子量 formula_weight	17816.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	T

VRQRIHIKLKYWSINQLLGMSSVTRVPADVFINSFAAHLKNRGIIKCPAFTDYVKTGVSRQYAPRDADWFYIKAASVIRHFYISGSHSIGVAGLARKYSSLQKGKTTPHHTKRASCKVIRSIVSQFLGQKLLIAGERGRHISPNGRKMVEDFAEGLQK

Entity 21 polymer

描述 description	Ribosomal protein S20
分子量 formula_weight	14073.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U

MAESVSTGGVNLADHKDGKDMHQKYTIIVVGKDLKLVERYVKSIVKEGRAFGISGPCRAPVRRLTITTRKSPCGEGTNTWHRFELRMYKRTFWVTCGGNDISTILSKTVVIPGIQVTVEVEEPDNE

Entity 22 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S21
分子量 formula_weight	9686.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	V

MQSDDIGMKNSSGVVVDAYIPRKCSATNRLIGPKDHAAVQLSVARVNDKGKMIENNYVTFAFCGAIRSRGGVDSAFMLLAQEHGLMERL

Entity 23 polymer

描述 description	SSU ribosomal protein S8P (Fragment)
分子量 formula_weight	14770.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	W

MVRINVLRDALKSICNAQRIGKKQVIVRPSSKVIIEFLQLMQKNGYISDFAVVDNHRSNRIVVNLIGRLNKAGVISPRFDIPANDIEKWVVNLLPSRLFGHIILTTSQGIMDHIEAQHRQIGGKVIGYFY

Entity 24 polymer

描述 description	SSU ribosomal protein S12P
分子量 formula_weight	15897.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X

MSKTSGLYTARKLRTVRRVNRWADKKYRKAHLGTWLKANPLEGACMARGIVTQKIGISAKQPNSAVRKAVRVQLTKNSKKITAFVPRDGSITYIDNNDEVLVAGFGRAGRAVGDIPGCRFKVIKVAGIGLLALFLRKREKRAR

Entity 25 polymer

描述 description	Ribosomal protein S24
分子量 formula_weight	14872.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Y

MPEITVKVRKVLNNPLLQRQQCVVDVLHPGCTYESKEAIKAKVAQQLKVADQKNIVLYGFKTSFGGGHTVGFCNAYQNMDALMKYEPGFRKIRCGLIEAPKPVSRKQLKNLKNRRLKKRGTEKATVTLGAKK

Entity 26 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S25
分子量 formula_weight	10121.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Z

MSSKKWTKKAVKEKVDYPTLFADEAAMNEALKFIKNSKCITHTQICERLRVSVALAKRVMRQLVKSGDFAIVSKSSRMTIFKNMTKKE

Entity 27 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S26
分子量 formula_weight	12791.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	a

MPVKRRNNGRSKYNCGHTNIVRCQNCHRCVPKDKVIKRFTIRNIVDNTIADDVLNACVIQGFAIPKLYNKVQYCVSCSIHNHIVRVRSREDRKIRTPPKRFPRNSSQKK

Entity 28 polymer

描述 description	Ribosomal protein S27
分子量 formula_weight	14117.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	b

MTPFSRFGEHCQLNINHAVYTLKLQTNPNKFKFKSELRGAKVSMNVDLLYPDPVEEQRKHKLKRLVQGPNSYFLEIKCAGCQDIVVVYSHANTPVFCPGCTSQISIPTGGKCAFTSQVERYRQK

Entity 29 polymer

描述 description	Ribosomal protein S28
分子量 formula_weight	7358.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	c

MPEPINARVIEVLGRTSSRGGITQVKVEFMTGEKRQIIRNVIGPVRKDDILVLMESEREARRLR

Entity 30 polymer

描述 description	Ribosomal protein S29A
分子量 formula_weight	15499.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	d

MRSALDTGVAADRIGRPQTFAELRVDKVDDIGTQRHIEHLGPRKLRNLGSCGAEDLDSRVHPSTIFWPTEADNINLASGVPKKGPSMRETEFCTHIAHKRECRICGNYNSVYRKYGLFICRRCFKENAGKIGFVKLH

Entity 31 polymer

描述 description	Ribosomal protein S27a
分子量 formula_weight	15134.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	f

MLVIVRLQDQTLPFELPAGARASQLSNLLSSSGMAFSLHTQGRVLSEAAELNDKMVIDAFVPADGAGKDKKRKKKAHKTPKKIKHEPKKVRLACLKYYTIKGDTAEPTREYCPNCGPGIRIARHADRCHCGRCGFAK

Entity 32 polymer

描述 description	tRNA
分子量 formula_weight	23749.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	g

GGGUAAUUGGCGCAGUUGGUUAGCGCGCGGGUCUCAUAAUCCCGAGCUCGUGAGUUCGAUCCGCACAUUCCCCA

Entity 33 polymer

描述 description	Ribosomal protein S12
分子量 formula_weight	14378.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

MADTTRENFLKETFKRIHNMDGLVTGHRQVFKYLERKRAKICFLASDCEEKQYADIVECLCKEYKVHLCKKFTRRTLGELTGQVRCLADSDKIIKVVPASACVIHNFVGMSSGDVDSFLTKLDEQ

Entity 34 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S30
分子量 formula_weight	7932.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	e

MARAHGGLTSAGKVRKCTPKKEKKEKPRPPRGRAYKRLLYNKNFVDDTLIHNGRRLGPNNLLIRQKLGF

Entity 35 non-polymer

描述 description	emetine
分子量 formula_weight	480.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

Entity 36 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	23

Entity 37 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

Entity 38 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	677

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7. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.24 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	143395

fit	/app/data/saxs_computation/g4/8g4i/8g4i.fit
pddf	/app/data/pr_computation/g4/8g4i/8g4i.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/g4/8g4i/8g4i.dat

40S ribosomal subunit of the 80S Giardia intestinalis assemblage A ribosome with Emetine bound in V1 conformation

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

1. 结构基本信息 1. Structure Basics

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合体信息 (38)

Entity 1 polymer

聚合体 Polymer

Entity 2 polymer

聚合体 Polymer

Entity 3 polymer

聚合体 Polymer

Entity 4 polymer

聚合体 Polymer

Entity 5 polymer

聚合体 Polymer

Entity 6 polymer

聚合体 Polymer

Entity 7 polymer

聚合体 Polymer

Entity 8 polymer

聚合体 Polymer

Entity 9 polymer

聚合体 Polymer

Entity 10 polymer

聚合体 Polymer

Entity 11 polymer

聚合体 Polymer

Entity 12 polymer

聚合体 Polymer

Entity 13 polymer

聚合体 Polymer

Entity 14 polymer

聚合体 Polymer

Entity 15 polymer

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