8gog

Structure of streptavidin mutant (S112Y-K121E) complexed with biotin-cyclopentadienyl-rhodium (III)(Cp*-Rh(III))

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 69.4 Å Quality: REASONABLE

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8gog

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8gog
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id8gog
沉积日期 deposition_date2022-08-24
结构标题 titleStructure of streptavidin mutant (S112Y-K121E) complexed with biotin-cyclopentadienyl-rhodium (III)(Cp*-Rh(III))
关键词 keywordsStreptavidin, Biotin, Rhodium, Enantioselectivity, Protein Engineering, Enzyme, METAL BINDING PROTEIN; METAL BINDING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier18.55
回转半径 Rg (电子) rg_electron17.15
零角强度 I(0) i017166600.00
分子量 molecular_weight28578.0 kDa
排除体积 excluded_volume34354 ų
包络体积 envelope_volume39653 ų
水化壳体积 shell_volume18727 ų
包络直径 envelope_diameter59.0
壳层 Rg shell_rg23.96
包络 Rg envelope_rg17.64
形状 Rg shape_rg17.02
总 Rg total_rg18.41
总原子数 total_atoms1965
残基数 n_residues242
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax69.4
Rg (实空间) rg_real18.43
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.55
I(0) (实空间) i0_real1.7170e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.1020e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal18.45
I(0) (倒空间) i0_reciprocal17170000.0000
解质量估计 total_estimate0.6036
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks3
主峰位置 r_peak_primary22.8
偏度 Skewness skewness0.143
峰度 Kurtosis kurtosis-0.464
角度范围 angular_range— – 0.4300 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha6124000.0000
实空间数据点数 n_real_points74
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.568; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.391; Positv: 1.000; Valcen: 0.967; Smooth: 0.000

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (7)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)