8iuj

Cryo-EM structure of Euglena gracilis super-complex III2+IV2, composite

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 247.9 Å Quality: EXCELLENT

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

▼

1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id	8iuj
沉积日期 deposition_date	2023-03-24
结构标题 title	Cryo-EM structure of Euglena gracilis super-complex III2+IV2, composite
关键词 keywords	Electron transport chain, supercomplex, membrane protein, Euglena gracilis, ELECTRON TRANSPORT; ELECTRON TRANSPORT
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

▼

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	90.93 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	91.30 Å
零角强度 I(0) i0	24901900000.00
分子量 molecular_weight	1427000.0 kDa
排除体积 excluded_volume	1816300 Å³
包络体积 envelope_volume	2734200 Å³
水化壳体积 shell_volume	255220 Å³
包络直径 envelope_diameter	312.7 Å
壳层 Rg shell_rg	83.43 Å
包络 Rg envelope_rg	89.57 Å
形状 Rg shape_rg	91.28 Å
总 Rg total_rg	91.28 Å
总原子数 total_atoms	200388
残基数 n_residues	12170
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	247.9 Å
Rg (实空间) rg_real	87.72 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.96 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.3900e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	5.3110e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal	88.39 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	24700000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9168
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	102.1 Å
偏度 Skewness skewness	0.394
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.527
角度范围 angular_range	— – 0.0850 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.9657
最高正则化参数 α highest_alpha	1145000000.0000
实空间数据点数 n_real_points	18
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.984; Stabil: 0.965; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.072

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合体信息 (42)

Entity 1 polymer

描述 description	MPP-beta
分子量 formula_weight	53520.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	QA,Qa
原子数 atom_count	200404

MTTPSLSSILRHTRPIFKETLRAARPTLQNALPNGFRIASESKDGDTCTVGVWIDAGSRWETEKNNGVAHFLEHMNFKGTGKRSRQDIEFGMEKMGAHLNAYTSREHTCYYVKCFKKDVPEAVDILADILLNSKRTEQDLDAERQTIVQEKEDVEARIDEVLMDHLHSAAFEGSGLGLSILGPLENIQKSITKGMIDDFVKTHYTGPRMALVGSGAVDHGQLCDLASKYFGALPTGQPKPSGFTRFLGGDKRETNQLNPLTHVAVAFQTPGISHPDAIKIKVLEQLLGSYSRDKGEAAYSCFARAIVMDFYDPKVGQFFRPNKAGHNPIHSLNAFWAPYSDVGLLGFYAIAEPGKSYGHEWENILHYAMRELIRVSRNISEEEFERAKNQLKLQTMLQLDGTTNIADDIGRQVLSFGARVPLASFFEQLDAISREDLIRVAHEYFYDKDPVVAVIGDTDNVPEYDALRAVTYSVDLGRA

Entity 2 polymer

描述 description	Cytochrome b
分子量 formula_weight	42476.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	QC,Qc

MNKISLYRSYSTTILLSPAYSLGFCASIFIVIQIISGYILASNYIASTNESFNIIHNVIMRELDTGWLIRFNHINGCAFLFIVIYMHIYRSLYHNSITKTSVWIVGIIMYILICGIAFTGYSLVYGQMSLWAIVVICSLVTAIPFIGNKLLILIWGGNIVSSVTLQRIFCIHYLLPLLLILFIIIHLYNLHNVNSTGDNYFINNRYDRINFYPLLLIRDVFIGSNILIIYNIFVYYYSDLFGHPDNYVPANPLVTPSEIMPEFYLLPFYALIRAIPHKVLGIIIMVLFLLSLTNLYPIYFIRFYNNINILQRSLLLLLLLDLVIASKLCLLINHYESFYLLLILSILCVLSHHIYNTSFNFSNSISNL

Entity 3 polymer

描述 description	Cytochrome c1, heme protein
分子量 formula_weight	27889.4 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.8
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	QD,Qd

GVDSHPPALPWPHFQWFQGLDWRSVRRGKEVYEQVFAPCHSLSFIKYRHFEAFMSKEEVKNMAASFEVDDDPDEKGEARKRPGKRFDTVVQPYKNEQEARYANNGALPPDLSVITNARHGGVDYIYALLTGYGRPVPGGVQLSTTQWYNPYFHGGIIGMPPPLTDDMIEYEDGTPASVPQMAKDVTCFLEWCSNPWWDERKLLGYKTIATLAVIAVSSGYYNRFLSGLWRSRRLAFRPFNYSK

Entity 4 polymer

描述 description	UQCRQ
分子量 formula_weight	10079.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	QH,Qh

MEGHSAYVALEQRVNTRQKGIIQRHLSPYDVDIRGNGFRQIYRLGMQKIRYFGLIGTPCLLVAGAYRGIWVFCERLEDERYWSNAL

Entity 5 polymer

描述 description	UQCR10
分子量 formula_weight	17577.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	QJ,Qj

MALEIKREWHVVPATKKFADVPTEWPAKEHERFALPYGPSEGRIVSFMRASRIRNRLLFTLNPTGYTEDTYVTKEALRRQALAESKNLWYLPERPVVADQLETIVNRSTFFVVKGHKNKGLIGIAGARHNPLVWLPTLALGGVWAWRWASAGTI

Entity 6 polymer

描述 description	Ubiquinol-cytochrome-C reductase complex subunit IX, mitochondrial
分子量 formula_weight	11300.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	QK,Qk

MQTHVRRVALQALRPCLRAGLMAPKFPVRFATTAVSGELLTKTPYTRPGYAAQWTCLVVLFLKNQLLMRLFFAFVAYVVAMKVFGARFHVDHDEDATPAE

Entity 7 polymer

描述 description	COXEG1
分子量 formula_weight	27278.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	4a,4A

MLSRALCSRNVPMSLKALNRPGSAGKLPMQLMKYASAVAPISHEGTLVRISQVKKLSELQLHFNDSHLGESELAAKVLGKLRKLEAEVLARNQAFNEAHPLVFDPKRAFNDEIFLCCSLCCIIFLIFLFNQYEEFAHELSFDIREQFGLGFYMLLGLHGSHVIFGTIMLALLTLWGAQGSVGPQSHALRFTSLYVHLVDLVFIILVLAIYSANASPELYGGIVPNILEARTFVSVDAAGNPQIKEF

Entity 8 polymer

描述 description	COXEG3
分子量 formula_weight	16394.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	4c,4C

MMQRIPFKKPNQIRGYFTRVHKYNHVPVPFILNVGMSISIVTSFVYFTYTSLWVRPEYDRVVDPSKAYVNPVWVDYWLKLRDEKRIQGALERSILEEEPEKAAEKILEWARTSAQNKILEDLKLLKPALSPATIAQFEK

Entity 9 polymer

描述 description	COXEG5
分子量 formula_weight	19464.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	4e,4E

MPSSMAWTIGWGFYAAWIMKETWNLRSSSVGWTPITLMEAYKTKERYLRSKAMMERYNSELEAVDDSNITEEDAKKFELEKATPSISIWEQFRSNPYWKEVEEEISTDVRKTMLEKHPDYALLLEAVKKSGYSKLWHLPGPWMNEHYNDGLHGRFLGWTPKAAHH

Entity 10 polymer

描述 description	COXEG8
分子量 formula_weight	24495.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	4h,4H

MLRVLTPAIARPGLRCFFKDGFRDNASLELVYRVVLKSPAVSQKLIEFYAKSLDQLSVESLSALKGTTVGIPLQPYLGDPHRVLLAYSLLPHTVETEADGNPVVETKIGDEEQKIKIIDSEVISFLAKEILGKLGLETTPQAARQYLDSLVEGAEALYAKIAPVEPSPLEKAIAEINEEIKSGTPWDTLKNRADPKELHALKFAQLPHPITKKVEGKFKYF

Entity 11 polymer

描述 description	COXEG10
分子量 formula_weight	10043.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	4j,4J

MNHERPWVFLNKVTGKWGACGWQPFWKATSQSLNYIPDNFIALRTNGSWVRNLWQSSKVLDRGLNASGYPTVGTTDWVRIPLDAPLEA

Entity 12 polymer

描述 description	COX5c
分子量 formula_weight	23788.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	5c,5C

YFFSRARMSLQLGHMRVGALWQSNANSRGLPNLLKEVMAAEPIYPYTHPGLSAKQILWNTKFNLKLEKDLISIAESAVQSQTVNKVVIPTMLTGDVNPKSPASVVAKDKYQLAKQMAEFQYKKSYFEKPWGYMFAYYCDEDRARLCGGIGYVGHHGGGDAEILSYTEYVSTVVYPTIFYMAITFVVSLFLMYYYIYGTFFSSTRNRFD

Entity 13 polymer

描述 description	COX6a
分子量 formula_weight	13079.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	6a,6A

MSTNKNVFFPPALHLKENSIFQYKFKNLAVRHDAARLGIILAGPTLFYWFTVYYFKGMPNGLPPVLLNPFVNRNYRGQKRDMPWGTDCAFLDTKCHEEKDTWAKRGPFFIIA

Entity 14 polymer

描述 description	COX6b-1
分子量 formula_weight	32995.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	6b,6B

MEGFVDKIDDNKYLGKWETILTDGRTHLPKHITFHDAAAISARWNQQYVNDSGPVYYRHWLACQQTYGAGNEDCRKLRWWAQQITHPLHLAEWDDWWKDEHYDLQIGQHWNRICGEEFEEASNLLKDLKEKREGLAAKFRDLLKTKTAEDPMGKILHEVAQLEEPSKTPVADLVEAGTLSKEAVEAAAALKIKELKALRDDATWAEVKGSLLNGVTTTCSTLKKTSKVVAELKAQAELERNKTSAVKLDIPHMRVNYEKPGLYEYDTWFGKFLPRTPQFGFAESDEE

Entity 15 polymer

描述 description	COX7c
分子量 formula_weight	19897.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	7c,7C

MQKAVVGNLLRQLSLTRPRGHGSNLYNRVHGNLPQLYVEQLYNTDEILDTVPHSSDPVHHMFPKCAAASPLGFRPYDNNKLWDAFVLWAIVYGVTTIFCVLHILKYPQIWKHLFETLTFQYTYQREIGEEYVWQYGGGGLNPAKWRFVKSPLEELGLVTEYRSDLDYPDDL

Entity 16 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase subunit 1
分子量 formula_weight	55759.5 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.9
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	c1,C1

MINNIMHMINKYTLTTSHKIIGILYGYMGYIAGILGYIISMLIRMELNTQGLAIVRKVKEVTIYNNWITIHGLIMLFVFIMPVGIGFYGNYLIPMLIGTSELSMPRMNGISFWMLIVGVVIFVISNVLMSKPISSGWTLYPPLSTRDADNIGVNIDLSLLVVHVLGISSTIGSVNYITTNKYNRHVGLTFMNINIYNFSIIVTSILLIGSLPILGVAITGLLLDRNINSTIYDVIGDPVLYQHLFWFFGHPEVYVIILPVFGLTSLILTSIIHKDIFGREGMMYCIISIGVVGYFVWAHHMFTVGLDIDSRSYFSIATSIISIPTSVKMFSYINTWASGRGFRGNNSSWSFFSFLICFCFGGFTGLLLSSGSLDIMLHDTYFVVGHFHTVLSLAATFGLLIAHYFFLPIIFSYSIFESFSFYHTFLLLVGALLVFYPMHLAGLSGMARRVPEYADIFIPFMTVGFHGTFLLIFSTLTFIRSYFQFLSHINHSNYL

Entity 17 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase subunit 2
分子量 formula_weight	22443.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	c2,C2

MRYGNREIESIILFFDQTIILYTSIINALIVGIIIIIRKWYNRKGICNQYIYHIKIEVIWTILPIIFLIVIVLHSVTVIYNLEINKGTNNKYINVIGNQWYWIYNNIESRISSLGRIILVDQPLFIKANNNTHLIISSLDVIHSFALPTLGIKVDAIPGRINNISINGLTQGLYVGYCSELCGSGHAFMPINLIVY

Entity 18 polymer

描述 description	Putative NADH dehydrogenase subunit 6
分子量 formula_weight	19414.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	c3,C3

MILNTNINYGGRNSRLCYLIPLMVHTIFLYLAYLIYYNINLINIYLLLIIIIFINIEWPLVIIYEYIYLTNYNIQNNLLYNIATFIFLEILLFIGFYWLYINNIIHYPNNLPYNNNIAVNLLDHLNHNNNTDICLYIILHNLLLLLYVTLILQLVHRYVQL

Entity 19 polymer

描述 description	COX4
分子量 formula_weight	20427.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	dc,DC

MGGDAHAHGGHGLHADPIFNGSKVVRSIQMMRSYHRLPVGPEPPHLKIRGAPLHPWSMYTDKGGFFFGVGTQLPRNFFPKFLATTSAIMGVTYGLVWLYNAAGPRAKTQTRKWKELESEDPRFPFQEIPEIYLPSDIDRDPNADCWRILNQVPRKEKLLVEITDPLRNFDFKVAKIKEN

Entity 20 polymer

描述 description	UQCRFS1
分子量 formula_weight	27825.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	QE,Qe

MFKQLSRMYSTSPAVANAVGGLATSQIRDLVGNPAKSGKPVVKMPPYLKPSQLRPSRGAYSDEFVRENYIKAADPEDPYNYRSRAFTYAAKIPMWAGLLAGTRVTVVYLMSQFMPSKSSLALANIEVDIGDIPEGKTVTIMWQGKPVFLRKRTDAEIEDMRAVPMDALKDPQTDEERLGEGRWAVFMAVCTHLGCVPVIDQGSYNAYFCPCHGSHYDHSGRIRKGPAPLNLEVPPFKLLDDSTLFIGNADAA

Entity 21 polymer

描述 description	UQCRH
分子量 formula_weight	8207.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	QF,Qf

GKMAAEQVSVSELKLKFEEECAHHHCHDIVKKVEVCEESIKGKEGKNCLFQHARLWECVDHCASPKVFALLK

Entity 22 polymer

描述 description	UQCRB
分子量 formula_weight	27404.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	QG,Qg

MNDAPILAKLGLSKVNTYYFQRRKHIFALPITIPNFPLAALGIFRSTDMFEERTLERYSRDEREKTLGKAALLLKEAKEKGNYSELVRLDPTDPRHPYYFEHPWQSALKMDTVSLTPYQQYLRWHCLTYRAMHEWDRQGLLYDDLMQPKALATDPFLEEAILRLPYNQRVERERRLSRAYDLALRREYLPDEDCIHPEDDVAYLHPYYHMVVDEHREQHENPVDVYSR

Entity 23 polymer

描述 description	UQCR9
分子量 formula_weight	6939.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	QI,Qi

MLANFSRFFYKTFLQSNATLIPLTLVFTYXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

Entity 24 polymer

描述 description	Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex core protein 2, mitochondrial
分子量 formula_weight	51132.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Qb,QB

MKSVVRSKGTQALFRRFSSALGDSINPNQVGVGDNVIRVNGRLFEVDKVQEKGLKTSVLDNGTKVITLDNGGSVAQLTFLYKDGPVYENIFNAGISSFMKHALTKDGLTSSEYITKTFLQKAGIIVHEPTVVNKSAIAFTVEGFRDTLAQPAVADKFWQSLLFPRFSPENVKEVKRLVELESKETKRDSPFAYLQDILHKTAFKGSPLGHTSFVPAYNLGYIDSNKLFDRWDAHYGFGNIAVIATNIEHEAVLAAITDSAWVARAHNKVGGVAAPASKYSGGEGYDVVHRAKEFDDQFTDVYSTYTAYAFKAPGRSNLKEHAASLVIAQALSNAVSPVLNTSFAPKRLEVFYQAYDTVGLIGLSSVQASNAQLKAFKAALSKIGTLSEADLAVHKSAALLTAYGNVESWRATQATLIDSFNTTGQPLSPLEIVSAIKAVSADTVKSVVATMLGSPATLVHHGDSPCAPTLDALQ

Entity 25 polymer

描述 description	COX5b-2
分子量 formula_weight	19736.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	5B,5b

MFRRGLVLAASRSKSLLDSVHVFRPEFAQGKFRIDLDQPAKQNKLQQQIYTLTDDEREMYEDEPYIGVDHLYEAHKGSKENPVVVEAIGVHGNDVFTGCLGGCHKDAADAVAYYTIVPPNTLAVCIDCGIHFVARINEQLTFWPDGTQPWEKVDFKAVEGFLYKHYKYGSPLMI

Entity 26 polymer

描述 description	COXEG4
分子量 formula_weight	19359.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	4D,4d

MSTVLSILGKRFQRSALTPKMNPFIRIRCQGPIEEFQRGFIGEFHAFALPGACMLVASCLGTFHIIRCLVVNPELSLAKVIPEILQPFTNPNAQLKAADGKDDDDSQVPKQWGMWGRHPNYGVLHVPFLDALNKEALARGKDGVNMGAEYNLVFTKSMADQVVDLILDDVQKRV

Entity 27 polymer

描述 description	COXEG6
分子量 formula_weight	8728.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	4F,4f

VFPSITKPLGLFKNLPRQHRAARDASIWLAILTAGPFGIFIAFKYYADWYDKKLLMEYYKDSIVYGETYGKGKYV

Entity 28 polymer

描述 description	COXEG7
分子量 formula_weight	35651.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	4G,4g

MLRQVVRRSNPLRMQVRGSAWNFQELMESRIPDYKGRPNRSGAELEQVKAALPKIEFMTSYEFDVLTKTRSNLTKEYSYQRDMRLKVTELMLDEAPHELEGLAVEGDAALKQLAELKALQTLTEYAGDLLEGQNQIVQRVNDFVDSNPVYLLDQPLREEARWNLLPEMDHKTRSLVRTELRDWLPAEYRQTRAVDLQQVAAFSPPVKADMFRAIEARAKDAEAEIRSLPPAEQAGLLALVKDNVAKSKAFIDPTYDITPEAINACNDVDALRAMAHRVTEYSGDARLLAIYGKAAQLTGDTAAQAILKEAKDLVF

Entity 29 polymer

描述 description	COXEG9
分子量 formula_weight	31754.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	4I,4i

MMNKGRILLGTNPGDIALNSKRFTVGKFVAWACGGWGLKDWIFPSLFIGRGDGPDFDRIVKHTLQSSSAIEKVNWFDSPFACYTEWFVEHFPGFFDSRYRFEMSAKTILANKYPIKDFPVVDMRSWRSSRLFDLFEVPHPEHTFVFGGPVLLNTEAKRAERLEQEWHGKDGTFVDVHPLNVATESHTEVSVIGGIKVYNGVWQGGKDSWKRDSAKPELTAPFHSPIWYRNMFIVKNADQLVEHFGENLSDETWQEVRKEHLAFHERFHKDYSFA

Entity 30 polymer

描述 description	COX7a
分子量 formula_weight	20079.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	7a,7A

MLSRLLHGPGSDKGHGYFHPDHGLVDSAAQNIRGPYWHAENMQFMQQTTQSGEKLPVPLTETAAQSSKLPVLSAQDGKTLQKIQLTDGSKVPKAATLVKWNPKSVHQWHSDDILRVDMTKHPEWVRTMRMFHGTVWRHRPEFRHPWFSRGSRASGIIMLVFGAVAYGEITFGKRLGGV

Entity 31 non-polymer

描述 description	PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE
分子量 formula_weight	616.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

Entity 32 non-polymer

描述 description	CARDIOLIPIN
分子量 formula_weight	1464.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	15

Entity 33 non-polymer

描述 description	HEME C
分子量 formula_weight	618.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

Entity 34 non-polymer

描述 description	1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE
分子量 formula_weight	790.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	22

Entity 35 non-polymer

描述 description	1,2-DILAUROYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHATE
分子量 formula_weight	535.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

Entity 36 non-polymer

描述 description	1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine
分子量 formula_weight	748.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	11

Entity 37 non-polymer

描述 description	HEME-A
分子量 formula_weight	852.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

Entity 38 non-polymer

描述 description	COPPER (II) ION
分子量 formula_weight	63.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

Entity 39 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

Entity 40 non-polymer

描述 description	FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER
分子量 formula_weight	175.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

Entity 41 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

Entity 42 non-polymer

描述 description	O-[(S)-hydroxy{[(2S)-2-hydroxy-3-(octadec-9-enoyloxy)propyl]oxy}phosphoryl]-L-serine
分子量 formula_weight	523.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

▶

7. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	3.06 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	135598

fit	/app/data/saxs_computation/iu/8iuj/8iuj.fit
pddf	/app/data/pr_computation/iu/8iuj/8iuj.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/iu/8iuj/8iuj.dat

Cryo-EM structure of Euglena gracilis super-complex III2+IV2, composite

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

1. 结构基本信息 1. Structure Basics

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合体信息 (42)

Entity 1 polymer

聚合体 Polymer

Entity 2 polymer

聚合体 Polymer

Entity 3 polymer

聚合体 Polymer

Entity 4 polymer

聚合体 Polymer

Entity 5 polymer

聚合体 Polymer

Entity 6 polymer

聚合体 Polymer

Entity 7 polymer

聚合体 Polymer

Entity 8 polymer

聚合体 Polymer

Entity 9 polymer

聚合体 Polymer

Entity 10 polymer

聚合体 Polymer

Entity 11 polymer

聚合体 Polymer

Entity 12 polymer

聚合体 Polymer

Entity 13 polymer

聚合体 Polymer

Entity 14 polymer

聚合体 Polymer

Entity 15 polymer

聚合体 Polymer

Entity 16 polymer

聚合体 Polymer

Entity 17 polymer

聚合体 Polymer

Entity 18 polymer

聚合体 Polymer

Entity 19 polymer

聚合体 Polymer

Entity 20 polymer

聚合体 Polymer

Entity 21 polymer

聚合体 Polymer

Entity 22 polymer

聚合体 Polymer

Entity 23 polymer

聚合体 Polymer

Entity 24 polymer

聚合体 Polymer

Entity 25 polymer

聚合体 Polymer

Entity 26 polymer

聚合体 Polymer

Entity 27 polymer

聚合体 Polymer

Entity 28 polymer

聚合体 Polymer

Entity 29 polymer

聚合体 Polymer

Entity 30 polymer

聚合体 Polymer

Entity 31 non-polymer

Entity 32 non-polymer

Entity 33 non-polymer

Entity 34 non-polymer

Entity 35 non-polymer

Entity 36 non-polymer

Entity 37 non-polymer

Entity 38 non-polymer

Entity 39 non-polymer