8jw0

PSI-AcpPCI supercomplex from Amphidinium carterae

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 238.6 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id	8jw0
沉积日期 deposition_date	2023-06-28
结构标题 title	PSI-AcpPCI supercomplex from Amphidinium carterae
关键词 keywords	Photosysrem I, Photosynthesis, Dinoflagellate; PHOTOSYNTHESIS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	67.72 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	67.83 Å
零角强度 I(0) i0	6714990000.00
分子量 molecular_weight	885520.0 kDa
排除体积 excluded_volume	1175700 Å³
包络体积 envelope_volume	1495600 Å³
水化壳体积 shell_volume	176750 Å³
包络直径 envelope_diameter	235.1 Å
壳层 Rg shell_rg	70.67 Å
包络 Rg envelope_rg	68.38 Å
形状 Rg shape_rg	67.89 Å
总 Rg total_rg	67.58 Å
总原子数 total_atoms	63119
残基数 n_residues	5585
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	238.6 Å
Rg (实空间) rg_real	67.71 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	2.32 Å
I(0) (实空间) i0_real	6.7150e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.4690e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal	67.68 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	6714000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8519
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	72.6 Å
偏度 Skewness skewness	0.356
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.356
角度范围 angular_range	— – 0.1150 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0007
最高正则化参数 α highest_alpha	1280000000.0000
实空间数据点数 n_real_points	24
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.773; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.751

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合体信息 (40)

Entity 1 polymer

描述 description	Photosystem I PsaA
分子量 formula_weight	70529.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	a
原子数 atom_count	63119

DFSKAAFGSATGLVAKAASQTTTAIWNLHADAHDFSNSSYLSKQVFAANLAHIGVVFIWLSGMHFHGAYFSNYLDWLQDPSIAPTAQQVSNIANQSVLNPIRVTSGFFNLWLAEGITSTYQLKVIAAFGLIASALCFLGSYFHMHSSTSFTRVLNTKLTSLSTHHLVGLLGLGSLAWAGHLIHISLPVNILLNAGVAVPSPHSLLSSKAVATIVEQLSFSALTSSDGYVWQPLVYSAMHHFALALVLIVGSIFLSTASNPLMSFTVGSSWHLVLGVQLFVTGTASVLYAQMSNAYPVYPYLLTDHPTVVSLFVHHMWIGGFFLVGAFAHLSIGLVRDTLPQSFSVVLTQRDIILGHLTWVVAFLGVHSFGLYVHNDTMQALGRPDDMFSDNAISLLPVFARWSTLTLNSTGSAVSVLGVELSTADFMVTHIHAFTIHTTVLILVKGFLYARSSRLVNDKYKLDFRYPCDGPGRGGTCQISPWDHVFLGLFWMYNSISVVIFHFFWEYQSNLASIKASAGGSIRALASDFELNSINTNGWLRNFLWSGAAQVIQSYGSPLAAYGLTFLASHFVWALSLMFLFSGRGYWQELIESVLWAHHKLYVVPHIQPRALSITSGRAVGLTHYLLGGIGTTWSFFLARIVATA

Entity 2 polymer

描述 description	Photosystem I PsaB
分子量 formula_weight	67962.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	b

YGRCATQRYFQVLGNIHDIELNESLNSPQAIQALSFGQLSVILLWLAAYTFHIGWSGNFEAFIDNPLGVQPINHFVLDPHYSQYKVDTTIAALTNHPIYHWLMTVGFTSNAQIYRFTLGLEITAAVMLVLSLAPSVGLLSMGGLEVVSWISICWAGHLVNFAPGAANLTNVVMEGPGSLGNLMNVLTFNGGIQLGTQALAVSDVAHHHVAIGIVGLWISALLRVSKYAWNFNTQSSYHLDLSLSLTVGGILTSLLAQQAYVYPALSYLPYDYLTTTSLYVHHQYIGAFLATGGFVHGGIFLVRDYTLSNDLVGKLLATKATVISTLSWITLFLGFHATGLYMHNDAMAAFGVPQKQIIIEPVFAEFIQQVFFLGTPVYGLGSAAVSSTPTLSFLPIISGGDFLVHHAIALGLHTTVLVLIKGALDSQGSYLFPDKQSFGYGFACDGPGRGGTCDISTWDSFYLAFFWVNNTVAWFTYYFHWKVLSLWQSSTAVFDENSLYLMGWFRDYLWQNCAALLSGYDSLGSNDLAVWAWAFLLAHLAWATGFMFLISWRGYWQELIDTVIYMHLKAPFFNEIWSADVVTPVALSIVQARFIGLAHYVAGFILTYLAFVVGATS

Entity 3 polymer

描述 description	Photosystem I PsaC
分子量 formula_weight	9409.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	c

AHAVKIYDTCIGCTLCVRACPTDVIEMVPATVNAAKQVASTPRVEDCVGCKRCETACPTDFLSIRVYLQENEETQYSLGLDLADWS

Entity 4 polymer

描述 description	Photosystem I PsaD
分子量 formula_weight	28754.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	d

AVPNTPKSSPDTLAGNRTEASAVSRPYDKFNVNYPLSSPDQARTEVTTKEIPRPEDLVDSPKFPLFGGSANGYMSKATRERHAITWTAKEETTFEMPTSGWAMMNKGENLCYFRKKEQCIALCKQLRSMKINDVKIYRLSKDGTVTFLHPSDGVFPEKVNKGRVPVNFRPFTVCQNAKQGELKFTEYWTKPYEADALTTLFVKARVAAYNDVVNLFPLPNPKLTSGPAEPTSVDYDALTKEAMEGQKKRIEAAMASV

Entity 5 polymer

描述 description	Photosystem I PsaE
分子量 formula_weight	8617.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	e

AWVGPKKGSQVRILRPESYWFQQRGTVVNVNQKTNIKYPVTVKFDFVNYANVNTNGFALWEVDELKEGEYDPDL

Entity 6 polymer

描述 description	Photosystem I PsaF
分子量 formula_weight	20761.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	f

IDTAPVTKMKNLKTGTVEVDQTKLSVKSWGHMEPCGQNKKFQKRIKDEAFKLKKRQDKYAKGSAAYAGVQEVIDQAKDTAKAYEGRWCGKKDGLPRVIATGEVTRGGIVTPALMFLYTTGWIGYAGRSYLLRTKDAAKEIKIDVPLALTCMTSAFAWPVYSWQDITNGRFVAKDTEIRVQRMHMA

Entity 7 polymer

描述 description	Photosystem I PsaR
分子量 formula_weight	14937.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	h

YTESAQDAKLFETVFSTYTAEYLKGPMYETPEKMIGRRPFNPGEPLWGEDKKLTSNVLGPLKRVSSNELAFLTMICLAIGAWGEAQFLWFDPQFAAIDRGEYFNPIYIIAASLLPVSFWAHIACYIQKANGK

Entity 8 polymer

描述 description	Photosystem I PsaI
分子量 formula_weight	14184.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	i

AYGDGPKKWGAVLLPLTIFGVGITAMGTFVLYTFSEDFFWAFVPGSKRSMELEKKKKEMAEKYPSPVVQHPADPLAGLVNRADYEKGLEEAWDKVKPKGSTVTVEEKLKELSTQNNPHYWRNAIKS

Entity 9 polymer

描述 description	Photosystem I PsaJ
分子量 formula_weight	7757.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	j

RKIPAGPYSVSVEPLRDGATNEVSIVTPPISSEGVQEYLSLAPVFFMALAIFTSGFAIEVLRFFPDTRYW

Entity 10 polymer

描述 description	Photosystem I PsaL
分子量 formula_weight	27994.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	l

VLPYMENIPRAIVEKEALEGVLAMTPREQWEDPPEDSVLYTLKVYAETYGEGKATKMPWWDWLYMRFELPDANEVSAEKIKLMEDDAKIQRRMMEGKIPLYVPILGVPIYTGMTLDWKPEAELFAGDQIRSPISDSRFAKNFIGNTAFYREGLENWQRGLEIGMAHGYFLVGPFTTLGPLRNTPEAATVGLLSACAVIGIVSVGGLLFGATVKPRAFDKDGATAGSGFTEIINWHAVGGLGGAGFCHLLLTLF

Entity 11 polymer

描述 description	Photosystem I PsaM
分子量 formula_weight	9634.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	m

ERIPGGKFTKAQGKIVATPDEDGFTDSEVALALIIAAVVLYLAIEVTKSLFYGEDPETTAKGPMTPFEKRVVEKGLFGSRGDSYSPFRP

Entity 12 polymer

描述 description	Chlorophyll a-chlorophyll c-peridinin-protein-complex I-10, acpPCI-10
分子量 formula_weight	19554.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A

EFAGGLIGGQSAFASQEYNFDPLGLAEKFPEQLPFFREAELKHGRIAMLAWVGLVVPEFVRIPGPEKCWQASAVDAHSACVETGALTQVFIFCGTLEICGTWAKMNPMPYLPLSQSGSTGGLTMENAGDYRLGVNFLPDEPEKVKEMKLKELKNGRLAMLAFGGAITQATLTGSGFPWLY

Entity 13 polymer

描述 description	Chlorophyll a-chlorophyll c-peridinin-protein-complex I-8, acpPCI-8
分子量 formula_weight	23780.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

AHPKHMLVAGVRGYEMEWQPIPGDAVKYPKPNSEEMFKTMIGADVETGGEAWDPLGFHKLFDRNFDFNMLPVYPHVQWLREAEIKHGRVCMLAFIGCFAQAGYHIGSYPVQPDWSKALAECYASPTGAVGLFQISVLIGWIEGKNYNGDAWVGMSEKEPGDLGFDPAGFTKNPDFDLKKAQLQEIKNGRLAMVGCASIAANHFIPGSVPLLTGFY

Entity 14 polymer

描述 description	Chlorophyll a-chlorophyll c-peridinin-protein-complex I-7, acpPCI-7
分子量 formula_weight	21347.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

KETSASVPFLPKPKNLAGWVGGETEFDPIGFSNWFDMKWLREAELKHGRVCMMATVGFVLQPYIGAYPGVEMPADSLQAVYAAPSEAWFAFIFAAGYIESSSYNGKITQLNMFEDSDRVPGNLGWGSTRLEGMSKEESELMQLKELKNGRLAMLAFSGMVHHNIVVKGALFPLVPDGWTGPEPWAVGSIMNNMG

Entity 15 polymer

描述 description	Chlorophyll a-chlorophyll c-peridinin-protein-complex I-6, acpPCI-6
分子量 formula_weight	19171.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

GGYKMSKAVPFLPMSPALEGYVGAEEEGFDPMGFSLALDIRWLREAELKHGRICMLATVGWIATDLGMRLPGPAYQVSTLEAHDAMVKFGPMAQILIWLGIIEVFSFLAITNMMEGTTDRQPGDYGLRRLYPKDEEGQYEMQLKELRNGRLAMLAFSGIVTTAVLTGRTWPF

Entity 16 polymer

描述 description	Chlorophyll a-chlorophyll c-peridinin-protein-complex I-2, acpPCI-2
分子量 formula_weight	19335.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

FEGELGVTPPMGYFDPLGLSSDGDKKTFIRRRKSELKNGRVAMWACMGWIVPEWYRFPGELSPSSGLKFSEIPNGMAALKALPTEAWAQMGAFVALLELGPLWQDESRAPGDFKTCAKYGFPMFFVGGREGSDSDPVKNQYSLNSEINNGRLAMMAITGMVFQNGITGTTGPEMWA

Entity 17 polymer

描述 description	Chlorophyll a-chlorophyll c-peridinin-protein-complex I-3, acpPCI-3
分子量 formula_weight	18231.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

REAPKVLAGTGGPLPESFWDPAGFTNNKTDEELLFYRAAELKHGRIAMAAVVGWFTNASGFHYLGDLWLKKPASDNPIEAFNQLSLLGVFQMVFFIGCLEWLTTVPCPPPKDAPWDVIGMSDVLEEDTDENPMAEYKKIQMQELNNSRLAMVAIIGLIVQATTTG

Entity 18 polymer

描述 description	Chlorophyll a-chlorophyll c-peridinin-protein-complex I-4, acpPCI-4
分子量 formula_weight	18956.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

FAGGLTGSDYGGFGGKYEWDPVGFSTRWPEHLAWYREAELKHGRIAMLAFAGLLAPDLFRLPWAEFQDSSLDFANAHDKFVAGFGPMWWGFIACGGIEYQRFRKLGLGMEGLTLENAGNLGWFDLPKNSEERLFYETAELKNGRLAMLAVSGIFTAGIFWDQHHFPFI

Entity 19 polymer

描述 description	Chlorophyll a-chlorophyll c-peridinin-protein-complex I-5, acpPCI-5
分子量 formula_weight	20585.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

ARRELAVAYEDAGIDLMDNGKFAQGLVGAEAAFGRYEFDPIGFSKYTELVPWFREAELKHGRIAMLAWLGLVVPDFVRIPGEAYSFEAVPRVIDAHDALNADAGPNFQIILFISIVELCCAKKVFEWNSVETAGDYNLTRLFPEDDEAQKQMRIAELKNGRLAMIAFGGAVTQAVITGKPFPWTF

Entity 20 polymer

描述 description	Chlorophyll a-chlorophyll c-peridinin-protein-complex I-9, acpPCI-9
分子量 formula_weight	17068.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

FENELGVQAPTGFFDPLGLSSDGSIDNFKRRRASEIKHGRVAMLATMGYMTPEITGKFPGYLSYSQSIKFADVPNGLAAMSKVPVLGWAQVAAYGAVCELSQDQSPGTPGAAGDFGFKVITSEDEETLKRKLNSELANGRLAMMAIIGLFFQDGLTGGAY

Entity 21 polymer

描述 description	Chlorophyll a-chlorophyll c-peridinin-protein-complex I-11, acpPCI-11
分子量 formula_weight	19562.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

VKMSPSVPYLPYPERLEGWVGGEKGFDPLRTSDIIDVYWLREAELKHGRICMLATLGWISVDAGWRFEAEMFQGVSVINAHNKMVEMGVMQQMLSIVGVCEIFSLYLIKEGLLGKIQRKAGDYFIGKNFLPKEEDKAKDMQLKELENGRLAMLAFSGICTQANLFPESHFPY

Entity 22 polymer

描述 description	Chlorophyll a-chlorophyll c-peridinin-protein-complex I-12, acpPCI-12
分子量 formula_weight	17109.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

FESELGVQAPTGFWDPLGFAKDGSMKAFKRRRASEIKHGRIAMLATMGYITPEITGKFPGYLSPSTLLKYDDIPNGLGAISKVPALGWAQIFVYCGYAELSQDQTPGSPGAEGNFGFKVLTSSDPDSLEKKLASEIANGRLAMMAFTGMATQDGLTGSAW

Entity 23 polymer

描述 description	Chlorophyll a-chlorophyll c-peridinin-protein-complex I-13, acpPCI-13
分子量 formula_weight	17119.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N

FENELGVQAPVGFWDPVGFTADGNVASFRRRRTVELKHGRISMLAAMGYMTPEITGKFPGYLSPSTLLKYDDIPNGLGAISKVPALGWAQIFVYCGYAELSQDQTPGSPGAEGNFGFKVLTSSDPDSLEKKLASEIANGRLAMMAFTGMATQDGLTGSAW

Entity 24 polymer

描述 description	Chlorophyll a-chlorophyll c-peridinin-protein-complex I-15, acpPCI-15
分子量 formula_weight	17422.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O

ESERGAQPPFGFWDPLGLSADGDVATFKRRRASEIKHGRIAMLAAMGYMTPEITGKFPGYLSPSTGVKYADIPNGLAAISKVPVVGWLQIFAWTAVCELWEDQVPGTPGHEGEFCFKAFKVTSDAPETRETKLASELANGRLAMMAIIGLFFQDGLTGSAY

Entity 25 polymer

描述 description	Chlorophyll a-chlorophyll c-peridinin-protein-complex I-16, acpPCI-16
分子量 formula_weight	17109.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	T,C

FESELGAQAPLGFFDPLKLTGDGSVEAFKRRRQSEIKHGRISMLAAMGYMTPEITGKFPGYLSPSLNLKFADVPNGLAAVSKVPAAGWAQILGYMAYCETSQDQSAGTPGAAGEFGFKVITSDDDEVLKRKLASELANGRLAMMAIIGMFYQDGLTGSAW

Entity 26 polymer

描述 description	Chlorophyll a-chlorophyll c-peridinin-protein-complex I-17, acpPCI-17
分子量 formula_weight	17357.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q

FENERGVQAPVGYWDPLGFARDGNVALFKIRRATEIKHGRISMLAAMGYITPEVTGKFPGYLSPSMGLKFADIPNGLAAISKVPGYGWAQILGWMAFCEISVDQSPGKPGAAGDMGFKAFKVTADAPETTEKKLASELANGRLAMMAIIGMFFQDGLTGSAW

Entity 27 polymer

描述 description	Chlorophyll a-chlorophyll c-peridinin-protein-complex I-14, acpPCI-14
分子量 formula_weight	17355.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P

FENELGVQAPTGFWDPLGFAKDGSMKAFKRRRASEIKHGRIAMLATMGYITPELTGKFPGLLSPSMGLKYEDIPNGLGAISKVPAVGWAQILAYTFYCEQSQDQSEGSAGEAGDFGFKVLTSKDEEGLKRKLNSELANGRLAMMAIIGMFFQDGLTGSAW

Entity 28 polymer

描述 description	Chlorophyll a-chlorophyll c-peridinin-protein-complex I-1, acpPCI-1
分子量 formula_weight	15280.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

VAGVCAPLTEKFDPLGLGTEEKMEQFTAAEIKHGRCAMIACLGYVLPEWFRFPGCESYESGLGALGSLPAEGWFQLVALIGAHEVLVKPREGGLGAFDFGLGSELLEGQSAEEVERKQTVERNNGRLAMVGFAGLVSQELMF

Entity 29 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL A
分子量 formula_weight	893.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	223

Entity 30 non-polymer

描述 description	PHYLLOQUINONE
分子量 formula_weight	450.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

Entity 31 non-polymer

描述 description	1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE
分子量 formula_weight	723.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

Entity 32 non-polymer

描述 description	BETA-CAROTENE
分子量 formula_weight	536.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	12

Entity 33 non-polymer

描述 description	IRON/SULFUR CLUSTER
分子量 formula_weight	351.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

Entity 34 non-polymer

描述 description	1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE
分子量 formula_weight	787.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	11

Entity 35 non-polymer

描述 description	DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)
分子量 formula_weight	949.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

Entity 36 non-polymer

描述 description	(3S,3'R,5R,6S,7cis)-7',8'-didehydro-5,6-dihydro-5,6-epoxy-beta,beta-carotene-3,3'-diol
分子量 formula_weight	582.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	49

Entity 37 non-polymer

描述 description	PERIDININ
分子量 formula_weight	630.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	49

Entity 38 non-polymer

描述 description	;[(1~{S},5~{R})-3,3,5-trimethyl-5-oxidanyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(1~{S},4~{S},6~{R})-2,2,6-trimethyl-4-oxidanyl-7-oxabicyclo[4.1.0]heptan-1-yl]octadeca-1,3,5,7,9,11,13,15,17-nonaenylidene]cyclohexyl] ethanoate ;
分子量 formula_weight	642.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	12

Entity 39 non-polymer

描述 description	Chlorophyll c1
分子量 formula_weight	610.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	39

Entity 40 non-polymer

描述 description	1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL
分子量 formula_weight	795.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

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7. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.90 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	356838

fit	/app/data/saxs_computation/jw/8jw0/8jw0.fit
pddf	/app/data/pr_computation/jw/8jw0/8jw0.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/jw/8jw0/8jw0.dat

PSI-AcpPCI supercomplex from Amphidinium carterae

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

1. 结构基本信息 1. Structure Basics

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合体信息 (40)

Entity 1 polymer

聚合体 Polymer

Entity 2 polymer

聚合体 Polymer

Entity 3 polymer

聚合体 Polymer

Entity 4 polymer

聚合体 Polymer

Entity 5 polymer

聚合体 Polymer

Entity 6 polymer

聚合体 Polymer

Entity 7 polymer

聚合体 Polymer

Entity 8 polymer

聚合体 Polymer

Entity 9 polymer

聚合体 Polymer

Entity 10 polymer

聚合体 Polymer

Entity 11 polymer

聚合体 Polymer

Entity 12 polymer

聚合体 Polymer

Entity 13 polymer

聚合体 Polymer

Entity 14 polymer

聚合体 Polymer

Entity 15 polymer

聚合体 Polymer

Entity 16 polymer

聚合体 Polymer

Entity 17 polymer

聚合体 Polymer

Entity 18 polymer

聚合体 Polymer

Entity 19 polymer

聚合体 Polymer

Entity 20 polymer

聚合体 Polymer

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聚合体 Polymer

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聚合体 Polymer

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聚合体 Polymer

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聚合体 Polymer

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聚合体 Polymer

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聚合体 Polymer

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聚合体 Polymer

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聚合体 Polymer

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7. 引用文献 (1)