8p4p

;Structure average of GroEL14 complexes found in the cytosol of Escherichia coli overexpressing GroEL obtained by cryo electron tomography ;

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 209.8 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8p4p

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8p4p
下载 Download

1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id8p4p
沉积日期 deposition_date2023-05-23
结构标题 title;Structure average of GroEL14 complexes found in the cytosol of Escherichia coli overexpressing GroEL obtained by cryo electron tomography ;
关键词 keywordsChaperonin, Folding cage, proteostasis, heat shock, ATPase, CHAPERONE; CHAPERONE
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier67.67
回转半径 Rg (电子) rg_electron67.11
零角强度 I(0) i08667550000.00
分子量 molecular_weight779650.0 kDa
排除体积 excluded_volume974470 ų
包络体积 envelope_volume1626100 ų
水化壳体积 shell_volume194760 ų
包络直径 envelope_diameter203.5
壳层 Rg shell_rg77.31
包络 Rg envelope_rg62.80
形状 Rg shape_rg67.15
总 Rg total_rg67.10
总原子数 total_atoms54439
残基数 n_residues7343
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax209.8
Rg (实空间) rg_real67.32
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.61
I(0) (实空间) i0_real8.6680e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.8650e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal68.80
I(0) (倒空间) i0_reciprocal8691000000.0000
解质量估计 total_estimate0.7911
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary100.4
偏度 Skewness skewness-0.062
峰度 Kurtosis kurtosis-0.455
角度范围 angular_range— – 0.1150 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha3075000000.0000
实空间数据点数 n_real_points24
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.784; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.929; Smooth: 0.000

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (6)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)