8p60

Spraguea lophii ribosome dimer

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 398.8 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8p60

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8p60
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id8p60
沉积日期 deposition_date2023-05-24
结构标题 titleSpraguea lophii ribosome dimer
关键词 keywordsMicrosporidia, RIBOSOME; RIBOSOME
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier
回转半径 Rg (电子) rg_electron153.40
零角强度 I(0) i0669236000000.00
分子量 molecular_weight5051200.0 kDa
排除体积 excluded_volume5519000 ų
包络体积 envelope_volume11322000 ų
水化壳体积 shell_volume601420 ų
包络直径 envelope_diameter480.9
壳层 Rg shell_rg137.80
包络 Rg envelope_rg145.80
形状 Rg shape_rg153.40
总 Rg total_rg153.30
总原子数 total_atoms343629
残基数 n_residues29498
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax398.8
Rg (实空间) rg_real146.20
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.64
I(0) (实空间) i0_real6.3940e+11
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.4960e+10
Rg (倒空间) rg_reciprocal124.70
I(0) (倒空间) i0_reciprocal593500000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8639
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary119.6
偏度 Skewness skewness0.233
峰度 Kurtosis kurtosis-0.996
角度范围 angular_range— – 0.0500 −1
当前正则化参数 α current_alpha1.2900
最高正则化参数 α highest_alpha10890000000.0000
实空间数据点数 n_real_points11
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.009; Oscil: 0.977; Stabil: 0.966; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.407; Smooth: 0.000

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (76)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)