8q1b

III2-IV1 respiratory supercomplex from S. pombe

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 261.5 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8q1b

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8q1b
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id8q1b
沉积日期 deposition_date2023-07-31
结构标题 titleIII2-IV1 respiratory supercomplex from S. pombe
关键词 keywordsSupercomplex, respiration, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier67.25
回转半径 Rg (电子) rg_electron66.31
零角强度 I(0) i05863170000.00
分子量 molecular_weight690360.0 kDa
排除体积 excluded_volume879780 ų
包络体积 envelope_volume1345600 ų
水化壳体积 shell_volume163640 ų
包络直径 envelope_diameter231.5
壳层 Rg shell_rg71.02
包络 Rg envelope_rg65.09
形状 Rg shape_rg66.33
总 Rg total_rg66.32
总原子数 total_atoms48686
残基数 n_residues5974
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax261.5
Rg (实空间) rg_real71.79
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.90
I(0) (实空间) i0_real5.9310e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.1920e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal67.48
I(0) (倒空间) i0_reciprocal5866000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8721
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary79.6
偏度 Skewness skewness0.631
峰度 Kurtosis kurtosis0.467
角度范围 angular_range— – 0.1150 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.8089
最高正则化参数 α highest_alpha527500000.0000
实空间数据点数 n_real_points24
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.686; Stabil: 0.835; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.979; Smooth: 0.848

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (36)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)