8rbx

Structure of Integrator-PP2A bound to a paused RNA polymerase II-DSIF-NELF-nucleosome complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 266.2 Å Quality: EXCELLENT

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8rbx

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8rbx
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id8rbx
沉积日期 deposition_date2023-12-05
结构标题 titleStructure of Integrator-PP2A bound to a paused RNA polymerase II-DSIF-NELF-nucleosome complex
关键词 keywordsIntegrator complex, Pre-termination complex, TRANSCRIPTION; TRANSCRIPTION
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier
回转半径 Rg (电子) rg_electron98.74
零角强度 I(0) i051890900000.00
分子量 molecular_weight1841400.0 kDa
排除体积 excluded_volume2260000 ų
包络体积 envelope_volume4258700 ų
水化壳体积 shell_volume352730 ų
包络直径 envelope_diameter336.5
壳层 Rg shell_rg99.04
包络 Rg envelope_rg96.73
形状 Rg shape_rg98.75
总 Rg total_rg98.72
总原子数 total_atoms129226
残基数 n_residues17295
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax266.2
Rg (实空间) rg_real97.61
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.71
I(0) (实空间) i0_real4.9750e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error8.0360e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal101.30
I(0) (倒空间) i0_reciprocal51860000000.0000
解质量估计 total_estimate0.9144
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary116.5
偏度 Skewness skewness0.216
峰度 Kurtosis kurtosis-0.497
角度范围 angular_range— – 0.0800 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.6111
最高正则化参数 α highest_alpha2682000000.0000
实空间数据点数 n_real_points17
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.003; Oscil: 0.994; Stabil: 0.976; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.979; Smooth: 0.001

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (44)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)