8tve

Langya henipavirus fusion protein in postfusion state

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 156.4 Å Quality: REASONABLE

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id	8tve
沉积日期 deposition_date	2023-08-18
结构标题 title	Langya henipavirus fusion protein in postfusion state
关键词 keywords	;Langya, henipavirus, fusion protein, postfusion, LayVF, SSGCID, VIRAL PROTEIN, Structural Genomics, Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease ;; VIRAL PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	44.39 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	44.68 Å
零角强度 I(0) i0	242400000.00
分子量 molecular_weight	129210.0 kDa
排除体积 excluded_volume	162820 Å³
包络体积 envelope_volume	221670 Å³
水化壳体积 shell_volume	48604 Å³
包络直径 envelope_diameter	165.0 Å
壳层 Rg shell_rg	41.80 Å
包络 Rg envelope_rg	44.97 Å
形状 Rg shape_rg	44.72 Å
总 Rg total_rg	44.38 Å
总原子数 total_atoms	9090
残基数 n_residues	1227
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	156.4 Å
Rg (实空间) rg_real	45.43 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.98 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.4240e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	5.1070e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	44.39 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	242100000.0000
解质量估计 total_estimate	0.6861
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	39.1 Å
偏度 Skewness skewness	0.856
峰度 Kurtosis kurtosis	0.085
角度范围 angular_range	— – 0.1800 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	26650000.0000
实空间数据点数 n_real_points	37
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.421; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.525; Smooth: 0.127

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合体信息 (2)

Entity 1 polymer

描述 description	Langya henipavirus fusion protein in postfusion state
分子量 formula_weight	58480.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C
原子数 atom_count	9090

MAFLKSAIICYLLFYPHIVKSSLHYDSLSKVGIIKGLTYNYKIKGSPSTKLMVVKLIPNIDGVRNCTQKQFDEYKNLVKNVLEPVKLALNAMLDNVKSGNNKYRFAGAIMAGVALGVATAATVTAGIALHRSNENAQAIANMKNAIQNTNEAVKQLQLANKQTLAVIDTIRGEINNNIIPVINQLSCDTIGLSVGIKLTQYYSEILTAFGPALQNPVNTRITIQAISSVFNRNFDELLKIMGYTSGDLYEILHSGLIRGNIIDVDVEAGYIALEIEFPNLTLVPNAVVQELMPISYNVDGDEWVTLVPRFVLTRTTLLSNIDTSRCTVTESSVICDNDYALPMSYELIGCLQGDTSKCAREKVVSSYVPRFALSDGLVYANCLNTICRCMDTDTPISQSLGTTVSLLDNKKCLVYQVGDILISVGSYLGEGEYSADNVELGPPVVIDKIDIGNQLAGINQTLQNAEDYIEKSEEFLKGINPSMKQIEDKIEEILSKIYHIENEIARIKKLIGEAPGGSIEGRGSGGGSHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Langya virus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	2971765
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

Entity 2 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

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7. 引用文献 (1)

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分辨率 resolution	3.90 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	86749

fit	/app/data/saxs_computation/tv/8tve/8tve.fit
pddf	/app/data/pr_computation/tv/8tve/8tve.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/tv/8tve/8tve.dat