8ufg

Acinetobacter baylyi LptB2FG bound to Acinetobacter baylyi lipopolysaccharide

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 119.8 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8ufg

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8ufg
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id8ufg
沉积日期 deposition_date2023-10-04
结构标题 titleAcinetobacter baylyi LptB2FG bound to Acinetobacter baylyi lipopolysaccharide
关键词 keywordslipopolysaccharide, ABC, ATPase, antibiotic, macrocyclic peptide, gram-negative bacteria, ESKAPE, LIPID TRANSPORT; LIPID TRANSPORT
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier38.24
回转半径 Rg (电子) rg_electron37.20
零角强度 I(0) i0226735000.00
分子量 molecular_weight129280.0 kDa
排除体积 excluded_volume165110 ų
包络体积 envelope_volume209540 ų
水化壳体积 shell_volume47753 ų
包络直径 envelope_diameter128.7
壳层 Rg shell_rg42.52
包络 Rg envelope_rg36.88
形状 Rg shape_rg37.25
总 Rg total_rg37.40
总原子数 total_atoms9107
残基数 n_residues1120
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax119.8
Rg (实空间) rg_real38.39
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.10
I(0) (实空间) i0_real2.2670e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.6750e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal38.30
I(0) (倒空间) i0_reciprocal226700000.0000
解质量估计 total_estimate0.8481
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary40.9
偏度 Skewness skewness0.392
峰度 Kurtosis kurtosis-0.447
角度范围 angular_range— – 0.2050 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha27890000.0000
实空间数据点数 n_real_points42
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.951; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.984; Smooth: 0.183

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (5)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)