8un8

Solution conformations of a 12-mer peptide bearing a natural N-hydrophobic triangle

Method: SOLUTION NMR Dmax: 22.8 Å Quality: REASONABLE

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8un8

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8un8
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id8un8
沉积日期 deposition_date2023-10-18
结构标题 titleSolution conformations of a 12-mer peptide bearing a natural N-hydrophobic triangle
关键词 keywordshydrophobic triangle, PROTEIN BINDING; PROTEIN BINDING
实验方法 methodSOLUTION NMR

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier5.76
回转半径 Rg (电子) rg_electron6.69
零角强度 I(0) i09151640.00
分子量 molecular_weight28877.0 kDa
排除体积 excluded_volume37774 ų
包络体积 envelope_volume2322 ų
水化壳体积 shell_volume3280 ų
包络直径 envelope_diameter24.5
壳层 Rg shell_rg11.17
包络 Rg envelope_rg7.59
形状 Rg shape_rg6.67
总 Rg total_rg7.01
总原子数 total_atoms4232
残基数 n_residues276
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax22.8
Rg (实空间) rg_real5.92
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.40
I(0) (实空间) i0_real9.1520e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.0080e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal5.92
I(0) (倒空间) i0_reciprocal9152000.0000
解质量估计 total_estimate0.6237
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks3
主峰位置 r_peak_primary4.0
偏度 Skewness skewness0.494
峰度 Kurtosis kurtosis-1.101
角度范围 angular_range— – 0.5000 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha268.6000
实空间数据点数 n_real_points80
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.055; Stabil: 0.998; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.002; Smooth: 0.941

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (1)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)