8w0d

Crystal structure of Acetyl-CoA synthetase 2 from Candida albicans in complex with an isopropyl AMP ester inhibitor

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 127.8 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8w0d

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8w0d
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id8w0d
沉积日期 deposition_date2024-02-13
最后修订 last_revision2024-02-21
结构标题 titleCrystal structure of Acetyl-CoA synthetase 2 from Candida albicans in complex with an isopropyl AMP ester inhibitor
关键词 keywordsSSGCID, STRUCTURAL GENOMICS, SEATTLE STRUCTURAL GENOMICS CENTER FOR INFECTIOUS DISEASE, Acetyl-coenzyme A synthetase 2, LIGASE; LIGASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier40.20
回转半径 Rg (电子) rg_electron39.54
零角强度 I(0) i0597762000.00
分子量 molecular_weight202330.0 kDa
排除体积 excluded_volume253500 ų
包络体积 envelope_volume314630 ų
水化壳体积 shell_volume64619 ų
包络直径 envelope_diameter128.7
壳层 Rg shell_rg46.23
包络 Rg envelope_rg39.69
形状 Rg shape_rg39.54
总 Rg total_rg39.87
总原子数 total_atoms14289
残基数 n_residues1821
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax127.8
Rg (实空间) rg_real40.11
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.85
I(0) (实空间) i0_real5.9780e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.0350e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal40.20
I(0) (倒空间) i0_reciprocal597800000.0000
解质量估计 total_estimate0.8322
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary45.9
偏度 Skewness skewness0.213
峰度 Kurtosis kurtosis-0.556
角度范围 angular_range— – 0.1950 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha96750000.0000
实空间数据点数 n_real_points40
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.938; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.000

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (7)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)