8w0h

Crystal structure of Acetyl-CoA synthetase 2 from Candida albicans in complex with an isopropyl AMP ester inhibitor (trigonal form)

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 129.9 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8w0h

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8w0h
下载 Download

1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id8w0h
沉积日期 deposition_date2024-02-13
最后修订 last_revision2024-02-21
结构标题 titleCrystal structure of Acetyl-CoA synthetase 2 from Candida albicans in complex with an isopropyl AMP ester inhibitor (trigonal form)
关键词 keywordsSSGCID, STRUCTURAL GENOMICS, SEATTLE STRUCTURAL GENOMICS CENTER FOR INFECTIOUS DISEASE, Acetyl-coenzyme A synthetase 2, LIGASE; LIGASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier41.25
回转半径 Rg (电子) rg_electron40.62
零角强度 I(0) i0696740000.00
分子量 molecular_weight219740.0 kDa
排除体积 excluded_volume275730 ų
包络体积 envelope_volume338630 ų
水化壳体积 shell_volume67424 ų
包络直径 envelope_diameter127.5
壳层 Rg shell_rg47.14
包络 Rg envelope_rg40.91
形状 Rg shape_rg40.63
总 Rg total_rg40.93
总原子数 total_atoms15515
残基数 n_residues1974
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax129.9
Rg (实空间) rg_real41.14
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.94
I(0) (实空间) i0_real6.9670e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.2480e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal41.25
I(0) (倒空间) i0_reciprocal696800000.0000
解质量估计 total_estimate0.8331
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary44.4
偏度 Skewness skewness0.175
峰度 Kurtosis kurtosis-0.666
角度范围 angular_range— – 0.1900 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha165800000.0000
实空间数据点数 n_real_points39
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.943; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.996; Smooth: 0.000

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (6)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)