8xhy

The complex structure of mutant T307A of SsBcmE and its natural substrate cIL

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 64.0 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8xhy

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8xhy
下载 Download

1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id8xhy
沉积日期 deposition_date2023-12-18
最后修订 last_revision2025-05-28
结构标题 titleThe complex structure of mutant T307A of SsBcmE and its natural substrate cIL
关键词 keywordsC-H activation, selectivity, Fe/2OG dependent dioxygenase, OXIDOREDUCTASE; OXIDOREDUCTASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier19.69
回转半径 Rg (电子) rg_electron18.63
零角强度 I(0) i041400300.00
分子量 molecular_weight32524.0 kDa
排除体积 excluded_volume31013 ų
包络体积 envelope_volume49493 ų
水化壳体积 shell_volume21593 ų
包络直径 envelope_diameter68.8
壳层 Rg shell_rg25.65
包络 Rg envelope_rg18.96
形状 Rg shape_rg18.61
总 Rg total_rg19.35
总原子数 total_atoms2470
残基数 n_residues307
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax64.0
Rg (实空间) rg_real19.56
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.38
I(0) (实空间) i0_real4.1400e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error5.4520e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal19.58
I(0) (倒空间) i0_reciprocal41400000.0000
解质量估计 total_estimate0.8010
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks3
主峰位置 r_peak_primary25.2
偏度 Skewness skewness0.193
峰度 Kurtosis kurtosis-0.325
角度范围 angular_range— – 0.4050 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha11710000.0000
实空间数据点数 n_real_points72
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.804; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.999; Smooth: 0.000

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (6)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)