8xjh

Crystal structure of Arabidopsis N-amino acetyltransferase 2 (AtNATA2) bound to di-CoA

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 86.1 Å Quality: REASONABLE

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8xjh

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8xjh
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id8xjh
沉积日期 deposition_date2023-12-21
最后修订 last_revision2024-12-25
结构标题 titleCrystal structure of Arabidopsis N-amino acetyltransferase 2 (AtNATA2) bound to di-CoA
关键词 keywordsTRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier23.70
回转半径 Rg (电子) rg_electron22.86
零角强度 I(0) i039544800.00
分子量 molecular_weight48842.0 kDa
排除体积 excluded_volume61128 ų
包络体积 envelope_volume70277 ų
水化壳体积 shell_volume25937 ų
包络直径 envelope_diameter87.8
壳层 Rg shell_rg29.85
包络 Rg envelope_rg23.31
形状 Rg shape_rg22.85
总 Rg total_rg23.71
总原子数 total_atoms3434
残基数 n_residues399
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax86.1
Rg (实空间) rg_real23.77
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.70
I(0) (实空间) i0_real3.9540e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error5.7440e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal23.75
I(0) (倒空间) i0_reciprocal39540000.0000
解质量估计 total_estimate0.7425
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary28.3
偏度 Skewness skewness0.530
峰度 Kurtosis kurtosis0.035
角度范围 angular_range— – 0.3350 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha15980000.0000
实空间数据点数 n_real_points65
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.589; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.887; Smooth: 0.000

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (4)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)