8xks

The cryo-EM structure of Orf2971-FtsHi motor complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 264.0 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8xks

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8xks
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id8xks
沉积日期 deposition_date2023-12-24
最后修订 last_revision2024-12-04
结构标题 titleThe cryo-EM structure of Orf2971-FtsHi motor complex
关键词 keywordsChlamydomonas reinhardtii, protein transportation, chloroplast, lipid synthesis, Enzyme, PROTEIN TRANSPORT; PROTEIN TRANSPORT
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier74.30
回转半径 Rg (电子) rg_electron73.75
零角强度 I(0) i012327100000.00
分子量 molecular_weight957480.0 kDa
排除体积 excluded_volume1204000 ų
包络体积 envelope_volume1820700 ų
水化壳体积 shell_volume199570 ų
包络直径 envelope_diameter248.0
壳层 Rg shell_rg75.48
包络 Rg envelope_rg72.09
形状 Rg shape_rg73.74
总 Rg total_rg73.83
总原子数 total_atoms67528
残基数 n_residues8575
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax264.0
Rg (实空间) rg_real74.28
Rg 误差 (实空间) rg_real_error2.32
I(0) (实空间) i0_real1.2330e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.7320e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal74.39
I(0) (倒空间) i0_reciprocal12330000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8646
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary88.0
偏度 Skewness skewness0.250
峰度 Kurtosis kurtosis-0.599
角度范围 angular_range— – 0.1050 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0125
最高正则化参数 α highest_alpha989700000.0000
实空间数据点数 n_real_points22
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.787; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.973; Smooth: 0.900

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (25)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)