8z11

Cryo-EM structure of haptophyte photosystem I

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 269.1 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id	8z11
沉积日期 deposition_date	2024-04-10
最后修订 last_revision	2025-01-22
结构标题 title	Cryo-EM structure of haptophyte photosystem I
关键词 keywords	Haptophyte, Photosystem I, evolution, PHOTOSYNTHESIS; PHOTOSYNTHESIS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	77.14 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	76.75 Å
零角强度 I(0) i0	8558470000.00
分子量 molecular_weight	1031100.0 kDa
排除体积 excluded_volume	1377900 Å³
包络体积 envelope_volume	1791000 Å³
水化壳体积 shell_volume	190190 Å³
包络直径 envelope_diameter	256.6 Å
壳层 Rg shell_rg	73.90 Å
包络 Rg envelope_rg	77.43 Å
形状 Rg shape_rg	76.82 Å
总 Rg total_rg	76.39 Å
总原子数 total_atoms	73539
残基数 n_residues	6274
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	269.1 Å
Rg (实空间) rg_real	80.54 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.51 Å
I(0) (实空间) i0_real	8.5650e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.9560e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal	76.77 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	8550000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8773
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	80.7 Å
偏度 Skewness skewness	0.469
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.247
角度范围 angular_range	— – 0.1000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	1.2540
最高正则化参数 α highest_alpha	1659000000.0000
实空间数据点数 n_real_points	21
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.871; Stabil: 0.873; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.994; Smooth: 0.202

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合体信息 (43)

Entity 1 polymer

描述 description	iFCPI-7
分子量 formula_weight	22841.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	73546

MLSIALSSLSYSPAAMPAVQVSRGAVNMAIAKPSNAVPFLTAPPCQSSKLAGAETGFDPLYLSEFIDLKWAREAELKHGRICMLAAPGYFFQEFFQLPGFPGYSPNGIEAVSSVSPEALAQIVIFMSVIEYNSNLNKWTMDTMFADPKREPGNLGFDPLKFGENKNTRARLEMAELKNGRLAMLAFSGMVHQTFVTGKPVWASLQDIFA

Entity 2 polymer

描述 description	iFCPI-1
分子量 formula_weight	22262.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MLSISVGSLSLATPMRPVVAPRAPVPKASIFEAGMAQYNADYPWLAKYGFGPSVKAERWNGRHAMFGWVAILATGVAKSHGLLPAGDLMLTYQDWGGLAQQGFNTYISNERAVIMIAHVHALAVSFAAAFGPQVLGDSLTLLDGEKDEEPYGFLPPMQFGLTPAAEIANGRMAMFGLISLVCTSAFTGMDILQIVDIGTGGNLLTHPMF

Entity 3 polymer

描述 description	iFCPI-11
分子量 formula_weight	21889.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MLSLVSASPSLLAPVVTPRAPAPAMAAERSASIPFLKKPPALDGSMIGDVGFDPLGFSTTITELGGDLSYVREAELMHGRQAMLAAVGMIFPKVFGKLPAPWTEAVSTNPLEAQYQLPPVVLGQILISIFIAEGLRSRIVFGNDPNYVVGDHGFGSNFLKGKSEAQIADMKLKELNNGRLAMIAVTGMFFQISIKGNLWPIIDGF

Entity 4 polymer

描述 description	iFCPI-6
分子量 formula_weight	26300.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MALRTLAVSVGVATALSTGATPAALARPKMTAHADALRFLRMDEAAPAKPAEEAEEAAAPAPPPAPPPVEYSESLPFLVKRKALKGYVGDVGFDPLGFSEILPMDWLREAELKHCRVAMLATFGFGFTDFWHFPGFDYTTLEAHDACVASGAMSQLLLWIGLLEVFGTIGIDQTLRGSGRAAGDFGFDPLGFGSDPAKMADLQMKELANGRLAMFAFSGFVTQSVLTGNQFPYLFDYQTTDVFAL

Entity 5 polymer

描述 description	iFCPI-5
分子量 formula_weight	21683.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MLSLASAPLSFAGPALSGVAHRTGALNMMAKSKSIPFLEAPPALDGTMAGDKGFDPMRLSEVVPIQWAREAELKHARICMLAVVGWVAVDLGFTVPYAPQVSSLAAHDAAVEKGAFLFLLFPIAVVEVLAGIPKCFQIMNDPNAAPGGDYKFDPLGIGASADMQEKEISNGRLAMMAFSGIVTQAALTQAPFPYTYNGMSDLVPVL

Entity 6 polymer

描述 description	iFCPI-8
分子量 formula_weight	25390.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MLSVVSAPTLAFGAGVARVVPQRAAVQMSAGPMYDEPLAPSGMGREFINKERAPLSSYVGASQELAAFPGGGGKEGMAPTPWDPFCFSELYKVSANNPDVAWLRESELKHGRMAMLAITGVMVQSTGFHLPGNAEVSFANSDWVSAPTTLPPVVWGQVLAFVAIAEGQTSEGLFDLWLGDTSKREPGNLGWGSGLLSKDKKAADKMRLKELKNGRLAMLAIMGVAANHFIPGALPGCIYS

Entity 7 polymer

描述 description	iFCPI-13
分子量 formula_weight	20749.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MLSLASLPSTAFVAPIPAARLGVRAAAPLMGVEDMVGASVEVSNKVWDPLKLSAKMDEGNLNLVRAAELKHCRVAMLATVGWAWTATGTHFEGMLSTSQGISFADACAAGPLLGAAKVPAVGVWQIIAAIGALEVFWENKYPASECAGNFGVPWVTSDPAKMKEIQLAELKNGRLAMIGIISFACAESIPGSVPFYPF

Entity 8 polymer

描述 description	iFCPI-10
分子量 formula_weight	21410.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MLTLSLQSLSLNAGVAPAARVQRMQAPMMVKSQALPFLEAPAKLDGSMAGDKGFDPLNLAGSFDINWMREAELKHGRICMLAWVGYVAVDNGFYVPFAPHVSSLAAHDTAVKSGQMLFLLGAVGVVEALSYNAINEMMSGQTDRRPGDFSMDPFKMVDTPEKAKSMLEKEISHCRLAMMAFSGVVTQSALTGHGFPYL

Entity 9 polymer

描述 description	iFCPI-3
分子量 formula_weight	21055.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MALSLLASPLALVNNGMLRAPVMQPACQGIQAKLDMVGACKPLGFFDPLGFSKDASPASMAKFREAELKHGRVAMLACAGMITADKFHPLYDGKLSSNPLLAIAQVPKLGLLQILLFIGFMEVFGILNSRRPDYKPGDFLGSSQWDTTEVWDNYQLRELNNGRLAMFASIGMLTHAYITGKGPLELLDGSSIVF

Entity 10 polymer

描述 description	iFCPI-9
分子量 formula_weight	20788.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MLSLTSAPLAFSAPLAAPLAPQRAAVSMMAKSQALPFLEKPASLDGSMPGDVGFDPLGLSSYFPLDWMREAEIKHGRVCMLAIVGYIAVDIGIRAPGAEKLGSLTSFTAHNAAVTSGHMWALLGVAGIAEIAGMAGIAATLNGSGRAPGDFAFDGGFAKDAAKLERFKLSEIKHCRLAMMAFSGLVTQDAMANGMGFPYF

Entity 11 polymer

描述 description	iFCPI-4
分子量 formula_weight	21735.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MLSLTSASALALHAPLAAVPTAQRAAAAPLMAMENELGATGPLGYWDPLGFSTKQPERFARYRAVELKHGRIAMAACTGYFVQSVLRWPGYLSTSAGVKFSDLPNGIAGFAKIPPLGLAQIFLFIGLMEAFTWPFYQGGLGKVPEGKLPGDVAGDLWVRYSDPEVKKHKLNVEINNGRAAMMGSLGMLMHDHILGTWIPPGF

Entity 12 polymer

描述 description	iFCPI-12
分子量 formula_weight	24225.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

MLSLALAPLSFNAPMAPLSQAMRSSTSVRMGVETMEGAAGPETAGKVFDPLGLASLGGEETLAFFRHAELKHGRVAMAAIVGFQFHINHVHFPGYLSPSAGVTFEQLAGVGPFEAWNLIPLLGKMQILFTIAGLEHASECLDPAGHYTKGGTPGNLKFLKKFWDTPGFTDKLTEEQKATKRVSELKNGRLAMIGMASIISAMSIPGSVPLLNGAPALTGTGFVLPFGDF

Entity 13 polymer

描述 description	iFCPI-15/14/16
分子量 formula_weight	23142.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M,P,W

MAPALINAPVMPVAGAARVAVPKMAFVDSIEGVGEETGNKIWDPLGISDAVSDEAVMWFRHSELKHGRVAMLATVGYMIGAAGITFPGEIAKGVTFASVGASGPYAAWDATPTAGKLQILTIILALEWAAETKKPHYMRGGVPGKIDQLPFEGIPGLWAPKIKFWDPLNFMGALTEEQKARKRKSELKNGRLAMIGIISFLTGHNIPGSVPALDSHF

Entity 14 polymer

描述 description	iFCPI-17
分子量 formula_weight	23706.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N

MALSLASPLACGLAAPAMVRPAVQTRHVMMSAADGMEGISHETGMKTWDPLGLADLGSPATLAFFRHAELKHCRVAMAAFVGWLVAVSGVHFPGLCSFSEGVSFEDISKLTPLEQWAAVPALGKAQILLAIGIIEHNSEWKIKPHYMAAGGKPGDLKGLKSFWDPAGLTSKMSAAKLERQRLSELKNGRAAMIGIISVLIAHNVPGSIPLPINFPAGPSLILPF

Entity 15 polymer

描述 description	iFCPI-20/19/21
分子量 formula_weight	21494.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O,R,T

MLSIAVSSLSFNAPALAPRTAPSAASVRMGVADMEGVGPETGNKVFDPLGLAKIASPETLAWYRAAELKHSRVAMAAVTGWAWVSSGGPLFPGYLSIDQGITFESLGRDGYAAWAAVPEAGKFQILGTIGILELLQEGSVKPHYMAGGTPGKVPLLWDPLGFTTKLSADTLATKRTSELKNGRLAMIGVMSLVSAHFIPGSVPLLP

Entity 16 polymer

描述 description	iFCPI-18
分子量 formula_weight	20023.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q

MLALSSMPLAFSAPASAAVAAAPRAAVSMGGNVNNMIGKYSVKGTVYDPLNLASTYDNNWLREAELKHGRLCMLAFAGFIANDAGWGLPGLDIKCSSVEAHDKMVESGHMWALLAFVSVCEALHFSVIIPKLDGDWGDYEPGNYGLDPFKLDTPARREAELKNGRACMLAFSGIVTQAALGHPAPYW

Entity 17 polymer

描述 description	iFCPI-22
分子量 formula_weight	25384.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S

MLSLASAAPLAFSAPIAAAVQPARAGAASMLTKEKLAEKLNPAIGYYDPLGLATADFWSQGNDATWGFLRHSEIKHGRVAMAAFVGFCVQSNGIHFPFDFQGGGVSQAQYAAGLSPPEQWDALPFAAKAQIILFIGFLEWWSEFGGQHYMRGGQPGKYPEFKNIPLHKMPNLFDPLGLSKGLSAEQRETKLCAEINNGRLAMLGVFGFYCAEKIPGSVPLLSFIKPYAGEIMGPF

Entity 18 polymer

描述 description	iFCPI-2
分子量 formula_weight	21908.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U

MLSFALSPLALNVAPMGAVASPRATVAMMAKSKSMPMMDAKEHLQGMVGNVDFDPLGLSTPENIKWMREAELKHGRMAQLAWAGYVAVDLGLRFPGEKYAGLTSLSAHDATVGYELFLLLLLVGTFETIGGKQIYDMQMSGANREAGDFGFDPLMLLKSPNAEKYKLAELTHGRAAMIAFSGVVTHSALPDAFGYGKATFPYF

Entity 19 polymer

描述 description	L-iFP
分子量 formula_weight	12567.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	V

MAKLLFLLIGVLASVVSGLVVGTAARSAVRAEQPAMSESRRSVLAAALFLAPAAASAMTIPGVNAPGLVPATKKSVGPKPEWDSFRDTSHFWSSEGIMNSVPKVKGIVTPKTPVGYGAPPKN

Entity 20 polymer

描述 description	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1
分子量 formula_weight	83558.2 kDa
EC 编号 ec_number	1.97.1.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	a

MKVGSKELEASKVRVIVDKDPVATSFEKWAQPGHFSRTLAKGPKTTTWIWNLHADAHDFDSQTSSLEDISRKIFSAHFGQLAIIFLWVSQAYFHGARFSNYSAWLQNPTAIKPSAQVVWPIVGQEILNGDVGGGFSGVQITSGVFQMWRASGITNETELYWTAMGGLVMSALMVFAGWFHYHKAAPKLEWFQNVESMMNHHLAGLLGLGCLSWSGHQIHISLPINKLLDAGVAPQEIPLPHELLFNQDLMAQLYPSFKKGLLPFFTLNWSEYSDFLTFKGGLNPITGSLWLSDTAHHHLALAVLFIFAGHMYRTNWGIGHSMKEILEAHKGPLTGEGHKGLYEILTTSWHAQLAINLAMMGSLSIIVAHHMYAMPPYPYIGVDYPTQLSLFTHHMWIGGFCICGAAAHGAIFMVRDYSPVQSYNNLLDRVLRHRDAIISHLNWVCIFLGTHSFGFYIHNDTMRALGRPQDMFSDKAIQLQPIFAKWVQSLHTLAPGSTAPNALATSSYAFGGDVVAVNGKIAMMPITLGTADFMVHHIHAFTIHVTVLILLKGVLFARSSRLIPDKANLGFRFPCDGPGRGGTCQVSAWDHIFLGLFWMYNCISVVIFHFSWKMQSDVWGTISSSGKISHVTGGNFANSALTINGWLRDFLWSQASQVIQSYGSALSAYGLIFLGAHFIWAFSLMFLFSGRGYWQELIESIVWAHNKLKLAPAIQPRALSITQGRAVGLAHYLLGGIGTTWSFFLARIISVG

Entity 21 polymer

描述 description	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2
分子量 formula_weight	82181.1 kDa
EC 编号 ec_number	1.97.1.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	b

MATKFPKFSQALAQDPATRRIWYGIATAHDLESHDGMTEENLYQKIFASHFGHLAIIFLWTSGNLFHVAWQGNFQQWVLNPLKVKPIAHAIWDPHFGQSAIKAFTRGGVSYPVNIATSGVYHWWYTIGMRTNEDLYFGALGLLILSTALLFAGWLHLQPKFRPGIAWFKNNESRLNHHLSGLFGVSSLAWAGHLIHVAIPESRGQHIRWNNFTSTLPHPEGLTPFFTGNWGLYAENPDTAQHIFGTSEGAGTAILTFLGGFHPQTQSMWLTDIAHHHLAIAVVFIFAGHMYRTNWGIGHSMKEILDAHVPPKGRLGSGHRGLFETITDSLHMQLGLALASLGVATSLVAQHMYALPSYAFMAKDYVTQAALYTHHQYIAGFLMVGAFAHGAIFFVRDYDPEVNKDNVLARMLQHKEAIISHLSWVSLFLGFHTLGLYIHNDVCVAFGTPEKQILFEPVFAQFIQAASGKALYGFDVLLSSPTSVATVAGSKIWLPGWVEAINSGKNSLFLTIGPGDFLIHHAIALALHTTTLILVKGALDARGSKLMPDKKDFGYSFPCDGPGRGGTCDISAWDAFYLAMFWMLNTIGWVTFYWHWKHMTIWGGNAAAFNESSTYIMGWLRDYLWLNSSPLINGYNAFGMNAQAVWAWMFLFGHLIWATGFMFLISWRGYWQELIETLVWAHERTPIANLVKWRDKPVALSIVQARLVGLAHFTIGYIFTYAPFVIASTTGKFS

Entity 22 polymer

描述 description	Photosystem I iron-sulfur center
分子量 formula_weight	8795.1 kDa
EC 编号 ec_number	1.97.1.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	c

MSHSVRVYDTCIGCTQCVRACPCDVLEMVPWDGCKAGQIASAPRAEDCIGCKRCETACPTDFLSVRVYLGSETTRSLGLSY

Entity 23 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit II
分子量 formula_weight	15882.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	d

MTTDLLNLQIPSPTFGGSTGGWLRAAEIEEKYAITWTSKKEQIFEMPTSGAAIMQKGENLLYLAKKEQCLALGTQLRTLFKISDYKIYRIFPNSEVQYLHPKDGVFPEKLNEGRVGVGNIGYSIGKNPNPVNVKFTGKNTFD

Entity 24 polymer

描述 description	PsaE
分子量 formula_weight	12835.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	e

MLRSIALFALAGSASALAPSAIGSSRVATRAGSPEMISRGSVVRIMRPESYWFQECGSVATIAKGGDRYPVVVRFEKVNYAGVATNNFAMDELVEVEAPPAKAAPAKAEAPAKEAAEAAPPAEA

Entity 25 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit III
分子量 formula_weight	20218.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	f

MKTFFNWFLAISIFTTAPTLVSADVSGLTPCKDSAVFKRRLDGSVKKLNSRLANYTEGTPAYIALEQQIEQTKARFAKYGEKGLLCGADGLPHLIADGRLDHAGEFIIPGFGFLYIAGWIGWAGRSYLQFSKKTDKPNENEIIINVPVALGMMAGAFIWPLAAWKELIDGKLLVPGDEITVSPR

Entity 26 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit VIII
分子量 formula_weight	3943.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	i

MSASFLPSILTPLVTLVFPGLCFALFFVLIEQDEIA

Entity 27 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit IX
分子量 formula_weight	4506.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	j

MSNDLLKYLSTAPVLLTAWMSITAGIIIEIQRFFPDSLSF

Entity 28 polymer

描述 description	PsaK
分子量 formula_weight	9484.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	k

MLDAGHAVDTASQLMAMSLPIPAYSIPKAFIMMFCNVLVISTMTIQGKGLAKGTPHDEMVESFGITWLLAGTALGHIVGAGTILGCSTAGIL

Entity 29 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit XI
分子量 formula_weight	15477.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	l

MSEFVKPFNNDPFVGNLSTPVTTSTATKLYLGNLPIYRKGLSPLMRGLEVGMAHGYFLIGPFYILGPLRNSPNALLVGLFSAYGLIIILTLALTIYGLASFQDNSTGSNLESSKGWRSFTSGFTVGALGGASVAYVLLNNVSFFA

Entity 30 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit XII
分子量 formula_weight	3149.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	m

MITDGQIFVALCIALTAAILAIGLGRQLYV

Entity 31 polymer

描述 description	PsaR
分子量 formula_weight	13750.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	r

MHTVAALLCLIGSASALAPAARVVPVVQRAVAPAVRVAPAAMLDRSEAADTWWGDKDYPSSVVLGIGKDVPSSIYGVTSAIAFSVGAYCIAQSNIINILSGSTVNGFYVAGALLVPYSWGLHVAAWIQKQNGK

Entity 32 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL A
分子量 formula_weight	893.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	280

Entity 33 non-polymer

描述 description	Chlorophyll c2
分子量 formula_weight	608.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	62

Entity 34 non-polymer

描述 description	(3S,3'R,5R,6S,7cis)-7',8'-didehydro-5,6-dihydro-5,6-epoxy-beta,beta-carotene-3,3'-diol
分子量 formula_weight	582.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	51

Entity 35 non-polymer

描述 description	1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE
分子量 formula_weight	723.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	16

Entity 36 non-polymer

描述 description	1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE
分子量 formula_weight	787.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	20

Entity 37 non-polymer

描述 description	;(3S,3'S,5R,5'R,6S,6'R,8'R)-3,5'-dihydroxy-8-oxo-6',7'-didehydro-5,5',6,6',7,8-hexahydro-5,6-epoxy-beta,beta-caroten-3'- yl acetate ;
分子量 formula_weight	658.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	54

Entity 38 non-polymer

描述 description	DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE
分子量 formula_weight	510.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

Entity 39 non-polymer

描述 description	1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL
分子量 formula_weight	795.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

Entity 40 non-polymer

描述 description	DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)
分子量 formula_weight	949.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

Entity 41 non-polymer

描述 description	BETA-CAROTENE
分子量 formula_weight	536.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	20

Entity 42 non-polymer

描述 description	IRON/SULFUR CLUSTER
分子量 formula_weight	351.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

Entity 43 non-polymer

描述 description	PHYLLOQUINONE
分子量 formula_weight	450.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

▶

7. 引用文献 (1)

▶

分辨率 resolution	2.74 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	148236

fit	/app/data/saxs_computation/z1/8z11/8z11.fit
pddf	/app/data/pr_computation/z1/8z11/8z11.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/z1/8z11/8z11.dat

Cryo-EM structure of haptophyte photosystem I

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

1. 结构基本信息 1. Structure Basics

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合体信息 (43)

Entity 1 polymer

聚合体 Polymer

Entity 2 polymer

聚合体 Polymer

Entity 3 polymer

聚合体 Polymer

Entity 4 polymer

聚合体 Polymer

Entity 5 polymer

聚合体 Polymer

Entity 6 polymer

聚合体 Polymer

Entity 7 polymer

聚合体 Polymer

Entity 8 polymer

聚合体 Polymer

Entity 9 polymer

聚合体 Polymer

Entity 10 polymer

聚合体 Polymer

Entity 11 polymer

聚合体 Polymer

Entity 12 polymer

聚合体 Polymer

Entity 13 polymer

聚合体 Polymer

Entity 14 polymer

聚合体 Polymer

Entity 15 polymer

聚合体 Polymer

Entity 16 polymer

聚合体 Polymer

Entity 17 polymer

聚合体 Polymer

Entity 18 polymer

聚合体 Polymer

Entity 19 polymer

聚合体 Polymer

Entity 20 polymer

聚合体 Polymer

Entity 21 polymer

聚合体 Polymer

Entity 22 polymer

聚合体 Polymer

Entity 23 polymer

聚合体 Polymer

Entity 24 polymer

聚合体 Polymer

Entity 25 polymer

聚合体 Polymer

Entity 26 polymer

聚合体 Polymer

Entity 27 polymer

聚合体 Polymer

Entity 28 polymer

聚合体 Polymer

Entity 29 polymer

聚合体 Polymer

Entity 30 polymer

聚合体 Polymer

Entity 31 polymer

聚合体 Polymer

Entity 32 non-polymer

Entity 33 non-polymer

Entity 34 non-polymer

Entity 35 non-polymer

Entity 36 non-polymer

Entity 37 non-polymer

Entity 38 non-polymer

Entity 39 non-polymer

Entity 40 non-polymer