8zo8

Respirasome open state 3 in presence of metformin (SC-MetO3)

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 248.7 Å Quality: EXCELLENT

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8zo8

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8zo8
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id8zo8
沉积日期 deposition_date2024-05-28
结构标题 titleRespirasome open state 3 in presence of metformin (SC-MetO3)
关键词 keywordsMetformin, electron transport chain, Respirasome, mammalia, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier93.87
回转半径 Rg (电子) rg_electron93.91
零角强度 I(0) i071760200000.00
分子量 molecular_weight1542700.0 kDa
排除体积 excluded_volume1508700 ų
包络体积 envelope_volume3171300 ų
水化壳体积 shell_volume281230 ų
包络直径 envelope_diameter351.7
壳层 Rg shell_rg94.08
包络 Rg envelope_rg91.11
形状 Rg shape_rg93.85
总 Rg total_rg94.01
总原子数 total_atoms116743
残基数 n_residues14079
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax248.7
Rg (实空间) rg_real88.88
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.77
I(0) (实空间) i0_real6.8510e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.2720e+09
Rg (倒空间) rg_reciprocal92.36
I(0) (倒空间) i0_reciprocal71410000000.0000
解质量估计 total_estimate0.9173
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary117.0
偏度 Skewness skewness0.227
峰度 Kurtosis kurtosis-0.493
角度范围 angular_range— – 0.0850 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.5482
最高正则化参数 α highest_alpha1579000000.0000
实空间数据点数 n_real_points18
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.001; Oscil: 0.996; Stabil: 0.980; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.997; Smooth: 0.002

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (87)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)