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8zxl

Structure of a hierarchical intermediate region (spindlefirbil) of human collagen type

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 200.2 Å Quality: SUSPICIOUS

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8zxl

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8zxl
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id8zxl
沉积日期 deposition_date2024-06-14
结构标题 titleStructure of a hierarchical intermediate region (spindlefirbil) of human collagen type
关键词 keywordscollagen, hierarchical intermediate, PROTEIN FIBRIL; PROTEIN FIBRIL
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier51.67 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron53.54 Å
零角强度 I(0) i0140024000.00
分子量 molecular_weight87511.0 kDa
排除体积 excluded_volume105820 ų
包络体积 envelope_volume143170 ų
水化壳体积 shell_volume28916 ų
包络直径 envelope_diameter196.4 Å
壳层 Rg shell_rg39.19 Å
包络 Rg envelope_rg54.65 Å
形状 Rg shape_rg53.52 Å
总 Rg total_rg53.02 Å
总原子数 total_atoms7370
残基数 n_residues1052
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax200.2 Å
Rg (实空间) rg_real52.71 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error3.78 Å
I(0) (实空间) i0_real1.4000e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.2550e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal50.80 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal139700000.0000
解质量估计 total_estimate0.3850
解质量评级 solution_quality SUSPICIOUS a SUSPICIOUS solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary26.7 Å
偏度 Skewness skewness0.680
峰度 Kurtosis kurtosis-0.390
角度范围 angular_range— – 0.1500 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha3870000.0000
实空间数据点数 n_real_points31
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.069; Stabil: 0.999; Sysdev: 0.062; Positv: 1.000; Valcen: 0.048; Smooth: 0.561
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合体信息 (1)

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7. 引用文献 (1)

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8. 文件与曲线 (10)