9bcz

;Chicken 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase zeta-1 (PLCZ1) in complex with calcium and phosphorylated threonine ;

Method: X-RAY DIFFRACTION

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

暂无 SAXS 图

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

暂无 P(r) 图

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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id	9bcz
沉积日期 deposition_date	2024-04-10
结构标题 title	;Chicken 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase zeta-1 (PLCZ1) in complex with calcium and phosphorylated threonine ;
关键词 keywords	;Phospholipase-C, lipid-metabolism, calcium-binding, oocyte-activation, Structural Genomics, PSI-2, Protein Structure Initiative, Structural Genomics Consortium, SGC, HYDROLASE ;; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

该条目暂无 SAXS 数据。

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3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

该条目暂无 P(r) 分析数据。

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合体信息 (8)

Entity 1 polymer

描述 description	1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase zeta-1
分子量 formula_weight	73660.6 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.4.11
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	5097

MEENRWFLNIIQDGFMNGKIDFDSTVKLLEKLHMPFNLAHVKHVFKKTVDKRKIHTINIEDFRAIYRAIVHRNEFHEIFCAYSENRKNLADTELTAFLKKEQFKTEGAETTALEVILKYEPIDEVRKRRQLSFEGFIRYMSSEDCTIFKKEHRTVYQDMNHPLCDYFISSSHNTYLVSDQLIGPSDLNGYISALLKGCRCLEIDCWDGSNNDPVVYHGHTLTSKITFCSVIHVVDKYAFAASDYPVVLSLENHCSTKQQERIAQYLLNILGDKLLTSPIGDIEVTQLPSPEALKFKILVKNKKCGTIEETMLRKGRDSHGETGEVSEEEITSSDEETDEKTPLYPKSGSSKRKSEGRSSPPPRKKAKVKKMKIAMGLSDLVIYTKSEKFVSFEHSLAHQKCYENNSIGELKAQKFVKHAANQFVSHTSRFITRIYPKGTRAGSSNYNPQEFWNVGCQMVALNFQTSGTPMELQNGKFLDNGGCGYILKPEFLRNRNSTFNPHNVGRYSNPLSLSIRLISGHQLPPSNLSKSNKADPLVQLEIYGVPEDQAKRKSSVIKSNALSPRWDETFSFTVQVPELALIRFCVQDEISLVANDFLGQYTLPLLSLSKGYCTVPLFSKSGGKLEPASLFVYVWYYAENLYFQ

来源 Source

来源生物 organism	Gallus gallus
通用名 common_name	chicken
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9031
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

Entity 2 non-polymer

描述 description	DI(HYDROXYETHYL)ETHER
分子量 formula_weight	106.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

Entity 3 non-polymer

描述 description	4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID
分子量 formula_weight	238.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

Entity 4 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

Entity 5 non-polymer

描述 description	SODIUM ION
分子量 formula_weight	23.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

Entity 6 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

Entity 7 non-polymer

描述 description	UNKNOWN ATOM OR ION
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

Entity 8 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	156

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7. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	122.182 Å
晶胞边长 b length_b	85.539 Å
晶胞边长 c length_c	98.433 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	112.04 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.990 Å
最低分辨率 resolution_low	49.590 Å
R 因子 r_factor	0.1744
R_work r_work	0.1729
R_free r_free	0.2041