9bwg

Homomeric alpha3 glycine receptor in the presence of 0.1 mM glycine and 0.1 mM zinc in a desensitized state

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 129.4 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9bwg

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9bwg
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id9bwg
沉积日期 deposition_date2024-05-21
结构标题 titleHomomeric alpha3 glycine receptor in the presence of 0.1 mM glycine and 0.1 mM zinc in a desensitized state
关键词 keywordsGlycine, Ion Channel, Ligand-Gated, Pentameric, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier39.52
回转半径 Rg (电子) rg_electron39.16
零角强度 I(0) i0573839000.00
分子量 molecular_weight210660.0 kDa
排除体积 excluded_volume269510 ų
包络体积 envelope_volume352370 ų
水化壳体积 shell_volume72743 ų
包络直径 envelope_diameter130.2
壳层 Rg shell_rg46.65
包络 Rg envelope_rg38.71
形状 Rg shape_rg39.19
总 Rg total_rg39.49
总原子数 total_atoms14795
残基数 n_residues1730
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax129.4
Rg (实空间) rg_real39.39
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.93
I(0) (实空间) i0_real5.7380e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error9.4650e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal39.47
I(0) (倒空间) i0_reciprocal573900000.0000
解质量估计 total_estimate0.8743
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary48.5
偏度 Skewness skewness0.313
峰度 Kurtosis kurtosis-0.275
角度范围 angular_range— – 0.2000 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha81340000.0000
实空间数据点数 n_real_points41
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.823; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.994; Smooth: 0.899

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (7)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)