9cdy

Crystal structure of DLK with inhibitor bound

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 65.0 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9cdy

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9cdy
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id9cdy
沉积日期 deposition_date2024-06-25
结构标题 titleCrystal structure of DLK with inhibitor bound
关键词 keywordsInhibitor, Complex, Dual Leucine Zipper Bearing Kinase, TRANSFERASE, TRANSFERASE-INHIBITOR complex; TRANSFERASE/INHIBITOR
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier20.44
回转半径 Rg (电子) rg_electron19.41
零角强度 I(0) i016314500.00
分子量 molecular_weight31576.0 kDa
排除体积 excluded_volume40006 ų
包络体积 envelope_volume46853 ų
水化壳体积 shell_volume20208 ų
包络直径 envelope_diameter65.7
壳层 Rg shell_rg25.75
包络 Rg envelope_rg19.70
形状 Rg shape_rg19.41
总 Rg total_rg20.34
总原子数 total_atoms4448
残基数 n_residues274
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax65.0
Rg (实空间) rg_real20.38
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.44
I(0) (实空间) i0_real1.6310e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.9760e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal20.40
I(0) (倒空间) i0_reciprocal16310000.0000
解质量估计 total_estimate0.8207
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary25.1
偏度 Skewness skewness0.271
峰度 Kurtosis kurtosis-0.397
角度范围 angular_range— – 0.3900 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha5308000.0000
实空间数据点数 n_real_points71
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.889; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.000

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (5)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)