9cpk

D8 symmetry reconstruction of MmCPn in closed state

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 166.2 Å Quality: REASONABLE

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9cpk

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9cpk
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id9cpk
沉积日期 deposition_date2024-07-18
结构标题 titleD8 symmetry reconstruction of MmCPn in closed state
关键词 keywordsArchaea chaperonin in closed state with ATP/AlFx, CHAPERONE; CHAPERONE
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier66.80
回转半径 Rg (电子) rg_electron66.19
零角强度 I(0) i011453200000.00
分子量 molecular_weight893560.0 kDa
排除体积 excluded_volume1115900 ų
包络体积 envelope_volume1958300 ų
水化壳体积 shell_volume233970 ų
包络直径 envelope_diameter175.1
壳层 Rg shell_rg80.06
包络 Rg envelope_rg61.11
形状 Rg shape_rg66.21
总 Rg total_rg66.33
总原子数 total_atoms62240
残基数 n_residues8208
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax166.2
Rg (实空间) rg_real66.32
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.14
I(0) (实空间) i0_real1.1100e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.4340e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal68.15
I(0) (倒空间) i0_reciprocal11490000000.0000
解质量估计 total_estimate0.6739
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary101.2
偏度 Skewness skewness-0.251
峰度 Kurtosis kurtosis-0.624
角度范围 angular_range— – 0.1150 −1
当前正则化参数 α current_alpha2.7560
最高正则化参数 α highest_alpha14860000000.0000
实空间数据点数 n_real_points24
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.987; Stabil: 0.938; Sysdev: 0.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.993; Smooth: 0.000

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (6)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)