← 返回搜索

9dna

CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF AN A-DNA FRAGMENT AT 1.8 ANGSTROMS RESOLUTION. D(GCCCGGGC)

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 36.1 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9dna

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

▼

1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id	9dna
沉积日期 deposition_date	1987-07-10
结构标题 title	CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF AN A-DNA FRAGMENT AT 1.8 ANGSTROMS RESOLUTION. D(GCCCGGGC)
关键词 keywords	A-DNA, DOUBLE HELIX, DNA; DNA
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	10.78 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	10.38 Å
零角强度 I(0) i0	370616.00
分子量 molecular_weight	2418.0 kDa
排除体积 excluded_volume	2321 Å³
包络体积 envelope_volume	3299 Å³
水化壳体积 shell_volume	3413 Å³
包络直径 envelope_diameter	33.4 Å
壳层 Rg shell_rg	13.58 Å
包络 Rg envelope_rg	10.35 Å
形状 Rg shape_rg	10.29 Å
总 Rg total_rg	11.24 Å
总原子数 total_atoms	161
残基数 n_residues	8
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	36.1 Å
Rg (实空间) rg_real	10.89 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.31 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.7060e+05
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.9030e+03
Rg (倒空间) rg_reciprocal	10.89 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	370600.0000
解质量估计 total_estimate	0.8382
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	8.7 Å
偏度 Skewness skewness	0.386
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.626
角度范围 angular_range	— – 0.5000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	9500.0000
实空间数据点数 n_real_points	80
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.851; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.454; Smooth: 0.886

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合体信息 (2)

▶

7. 引用文献 (1)

▶

8. 文件与曲线 (10)