9doa

Membrane-bound OlyA/PlyB (Hinge-Lock) prepore

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 205.7 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9doa

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9doa
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id9doa
沉积日期 deposition_date2024-09-18
结构标题 titleMembrane-bound OlyA/PlyB (Hinge-Lock) prepore
关键词 keywordsmembrane, pore formation, lipid interaction, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier79.07
回转半径 Rg (电子) rg_electron78.66
零角强度 I(0) i014559800000.00
分子量 molecular_weight1022400.0 kDa
排除体积 excluded_volume1276700 ų
包络体积 envelope_volume2194300 ų
水化壳体积 shell_volume221490 ų
包络直径 envelope_diameter213.4
壳层 Rg shell_rg92.44
包络 Rg envelope_rg72.72
形状 Rg shape_rg78.68
总 Rg total_rg78.69
总原子数 total_atoms143117
残基数 n_residues9308
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax205.7
Rg (实空间) rg_real78.59
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.75
I(0) (实空间) i0_real1.4560e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.5490e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal80.50
I(0) (倒空间) i0_reciprocal14620000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8435
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary133.7
偏度 Skewness skewness-0.149
峰度 Kurtosis kurtosis-0.866
角度范围 angular_range— – 0.1000 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0005
最高正则化参数 α highest_alpha1163000000.0000
实空间数据点数 n_real_points21
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.992; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.984; Smooth: 0.000

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (2)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)