9eh0

RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, 30 bp upstream

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 275.8 Å Quality: EXCELLENT

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9eh0

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9eh0
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id9eh0
沉积日期 deposition_date2024-11-21
结构标题 titleRNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, 30 bp upstream
关键词 keywordsSETD2, Transcription, H3K36me3, TRANSFERASE-RNA-DNA complex; TRANSCRIPTION, TRANSFERASE/RNA/DNA
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier99.42
回转半径 Rg (电子) rg_electron98.24
零角强度 I(0) i018950700000.00
分子量 molecular_weight1051000.0 kDa
排除体积 excluded_volume1265300 ų
包络体积 envelope_volume2432000 ų
水化壳体积 shell_volume224120 ų
包络直径 envelope_diameter360.6
壳层 Rg shell_rg82.24
包络 Rg envelope_rg96.99
形状 Rg shape_rg98.05
总 Rg total_rg98.67
总原子数 total_atoms73438
残基数 n_residues9182
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax275.8
Rg (实空间) rg_real94.30
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.45
I(0) (实空间) i0_real1.8180e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error4.1220e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal92.51
I(0) (倒空间) i0_reciprocal18520000000.0000
解质量估计 total_estimate0.9080
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary86.2
偏度 Skewness skewness0.441
峰度 Kurtosis kurtosis-0.626
角度范围 angular_range— – 0.0800 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.5522
最高正则化参数 α highest_alpha1054000000.0000
实空间数据点数 n_real_points17
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.003; Oscil: 0.945; Stabil: 0.988; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.999; Smooth: 0.005

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (33)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)