9f4b

Pre-assembled baseplate cup of Klebsiella phage KP1 variant vB_Kpn_Lilla1

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 497.4 Å Quality: EXCELLENT

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9f4b

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9f4b
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id9f4b
沉积日期 deposition_date2024-04-26
结构标题 titlePre-assembled baseplate cup of Klebsiella phage KP1 variant vB_Kpn_Lilla1
关键词 keywordsBaseplate cup, baseplate wedge, fibers, VIRUS; VIRUS
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier
回转半径 Rg (电子) rg_electron164.40
零角强度 I(0) i0541724000000.00
分子量 molecular_weight6246300.0 kDa
排除体积 excluded_volume7779100 ų
包络体积 envelope_volume17237000 ų
水化壳体积 shell_volume868610 ų
包络直径 envelope_diameter488.8
壳层 Rg shell_rg153.70
包络 Rg envelope_rg153.90
形状 Rg shape_rg164.30
总 Rg total_rg164.50
总原子数 total_atoms440315
残基数 n_residues56329
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax497.4
Rg (实空间) rg_real165.50
Rg 误差 (实空间) rg_real_error2.01
I(0) (实空间) i0_real5.2650e+11
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.4030e+10
Rg (倒空间) rg_reciprocal157.80
I(0) (倒空间) i0_reciprocal505100000000.0000
解质量估计 total_estimate0.9007
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary221.1
偏度 Skewness skewness0.066
峰度 Kurtosis kurtosis-0.716
角度范围 angular_range— – 0.0450 −1
当前正则化参数 α current_alpha1.9190
最高正则化参数 α highest_alpha8365000000.0000
实空间数据点数 n_real_points10
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.001; Oscil: 0.991; Stabil: 0.919; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.991; Smooth: 0.000

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (19)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)