9f5y

Structure of the Chlamydomonas reinhardtii respiratory complex I from respiratory supercomplex

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 218.8 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id	9f5y
沉积日期 deposition_date	2024-04-30
结构标题 title	Structure of the Chlamydomonas reinhardtii respiratory complex I from respiratory supercomplex
关键词 keywords	Mitochondria, respiratory complex, respiration, alga, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	80.27 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	80.20 Å
零角强度 I(0) i0	13856600000.00
分子量 molecular_weight	1043300.0 kDa
排除体积 excluded_volume	1321600 Å³
包络体积 envelope_volume	1840700 Å³
水化壳体积 shell_volume	194380 Å³
包络直径 envelope_diameter	304.3 Å
壳层 Rg shell_rg	76.22 Å
包络 Rg envelope_rg	79.48 Å
形状 Rg shape_rg	80.19 Å
总 Rg total_rg	80.21 Å
总原子数 total_atoms	73290
残基数 n_residues	9058
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	218.8 Å
Rg (实空间) rg_real	76.71 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.95 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.3460e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.4810e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal	78.37 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	13780000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8877
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	80.6 Å
偏度 Skewness skewness	0.345
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.595
角度范围 angular_range	— – 0.0950 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.1261
最高正则化参数 α highest_alpha	733300000.0000
实空间数据点数 n_real_points	20
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.973; Stabil: 0.985; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.994; Smooth: 0.002

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合体信息 (64)

Entity 1 polymer

描述 description	NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit
分子量 formula_weight	30644.0 kDa
EC 编号 ec_number	1.6.5.3
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	75117

MLSRALLLAGRLAATGQQQAASTSSRAVQPLGSLLQRCNFATNSTDIFNIHKDTPENNAATSFEFSEATLKVVNDIIARYPPNYKQSAIIPVLDVTQQENGGWLSLAAMNRVAKLLDMAPIRVYEVATFYTMFNRTKIGKYHVQICGTTPCRLQGSQKIEEAITKHLGIGIGQTTQDGLFTLGEMECMGACVNAPMVAIADYTKGVSGFEYIYYEDLTPKDIVNILDTIKKGGKPKPGSQYRLKAEPAGAVHGGEKWVPKDGETTLTGAPRAPYCRDLNATA

Entity 2 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial
分子量 formula_weight	52303.1 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MQRTGGLVSQLAGAQLTGALQELKTGVLLAFSTAAPAAGAPPPPPPPPAKTSFGGLKDEDRIFQNIYGRHDLSIKGAMSRGDWYMTKEIIGKGRDWIIDQMKKSGLRGRGGAGFPSGLKWSFMPKASDGRPSYLVVNGDESEPGTCKDREIMRHEPHKLVEGCLMAGVAMGARAGYIYIRGEFVQERRAVERAISEAYAKGFLGKNACGSGVDFDLMVHYGAGAYICGEETALIESLEGKQGKPRLKPPFPAGVGLYGCPTTVTNVETVAVSPTILRRGPEWFSSFGRKNNAGTKLFCISGHVNRPVTVEEEMSIPLKELIERHAGGVRGGWDNLLAIIPGGSSVPLLPKKICDGVLMDFDALKEAQSGLGTAAVIVMDKSTDVIDAIARLSYFYKHESCGQCTPCREGTGWLYDIMTRMKKGDARLEEIDMLWEITKQIEGHTICALGDAAAWPVQGLIRHFRGEMEERIKSAGGKKKLAATA

Entity 3 polymer

描述 description	NADH:ubiquinone oxidoreductase 78 kDa subunit
分子量 formula_weight	78432.7 kDa
EC 编号 ec_number	1.6.5.3,1.6.99.3
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MSARRALTLAQPLTGLWPGAQEFARSISTSVGALSGPPPPPPPPPPPSDHLEVFVNEQPVKIPKGSSVLQACDAAGIDIPRFCYHQRLSIAGNCRMCLVEVEKVPKPVASCAMPAGPGMKIKTETPMVKKAREGVMEFLLINHPLDCPICDQGGECDLQDQAMIFGSDRSRFVEAKRAVEDKNLGPLVKTVMTRCIQCTRCVRFASEVAGTAELGVTGRGRDSEIGTYVEKLMGSELSGNVVDLCPVGALTSKPYAFTARSWELKGTESIDVSDGLGANIRVDARGTEVMRILPRLNEAVNEEWLSDKGRYQYDGLKHQRLDKPMVKGPKGLQVATWQDALGAAAAALTSAAPGEVRGIAGKLADAESMVALMDLLRGLGAGDLAHEGGFSDMPADVRSTYTANTTVQGLEQSDLVLLVGTNPRWESPVFNARLRKMFLDGTQVGLVGAPVDLTYKYEHVGSDPAALAALAAGQHPFLERLKKAARPAVVVGPGVLRRADREAVMKAVHELCGKAGVVKEGWNGFNVIHDTASRVAALDMGFGPSAAARARRAQGAQPKVVYLLGSDDYSEEDVPEGAFVIYQGHHGDRGASRANVVLPGAAYTEKSGLYVNFEGRVQQTRAAVPLVGDAREDWAILRALSEVVGKRLPYDSHAAVRARLAGIAPHFANIDAVQTPVWLNGEYVKGVEALAKAAPLQPSAPLTSTISNFYMTDAISRASRTMAKCIQARQQTK

Entity 4 polymer

描述 description	NADH:ubiquinone oxidoreductase 30kDa subunit domain-containing protein
分子量 formula_weight	32178.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MKSAQSLLMKLQAPIKGCLQQGTSEGLRSFAARALGSAMETSLIPEANSASTSASSASQLQQTRSMGYAYARKTTDKDYIASEHMQAFGNTQLTDYIIKTVPKFVKMAVTGPAQSSVLYQEPTIYTTPESLVPLMVFLRDHTNTQFKCLLDVTAVDFPERAARFEVVYHLLSPRWNNRIRVKVCVDEVTAVPTLCKVFNTANWFERETWDMFGVFFSGHPDLRRILTDYGFTGHPLRKDFPMTGYQEVRYDYGKKRVVSEPLELTQEFRYFDFNSPWETLNR

Entity 5 polymer

描述 description	NADH:ubiquinone oxidoreductase 49 kD subunit
分子量 formula_weight	52672.5 kDa
EC 编号 ec_number	1.6.5.3
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MRRQAVTCLRGLWRAGSASQEVANQAGASSFALQGLLAQTERGLRTSVDAKDAKIAPLSAMPWSLQAARSATAEALTPAKVNNFTLNFGPQHPAAHGVLRLVLEMQGEIIMRADPHIGLLHRGTEKLLEYKTYLQGLPYFDRLDYVSMMCMEHSYVLAIEQLLNVSVPLRGQYIRVLFSEITRVLNHLLAITCHSMDVGALTPFLWAFEEREKLFEFYERVSGARMHAAYFRVGGVSQDLPIGLLRDVYDWARQFASRLDEMEELLTGNRIWKERTVDVGTITAQMAWDWGCSGPILRASGIDWDLRKTQPYDAYGKMQFNVPIAGHGDCYDRYLVRLQEMRESLRIIYQCLNEMPDGLYKSPDGKVCPPSRSTMKQSMEALIHHFKLYTEGFHVPAGETYRAVEAPKGEFGVYLVSRGGNRPYRCKIRSPGYAHLQMTDVISRGAMLADVVTIIGTLDVVFGEIDR

Entity 6 polymer

描述 description	NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 10
分子量 formula_weight	18144.2 kDa
EC 编号 ec_number	1.6.5.3
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MSKPAAAAKGLEFVVSKVDNVVNWARAGSIWPMTFGLACCAVEMMHAGASRYDLDRYGIIFRPSPRQSDAMIVAGTLTNKMAPALRKVYDQMPEPKWVVSMGSCANGGGYYHYSYAVVRGCDRVVPVDVYVPGCPPTAEGLLYGLLQLQKKIYRSKTTQIWYKK

Entity 7 polymer

描述 description	NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 8
分子量 formula_weight	26530.2 kDa
EC 编号 ec_number	1.6.5.3
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MPLLRRAAQSLLTSWAPVATNCGAMSELVRCMGTERRPGESGAWKQIERQRYASDWENDPTFKRTPKNLAEVLDDSASMLLLTDVWRGMAYTLGAFFDKKVTIMYPFEKGQLSPRFRGEHALRRYPTGEERCIACKLCEAICPAQAITIEAEEREDGSRRTTRYDIDMTKCIYCGFCQEACPVDAIVEGPNFEFSTETREELLYDKQKLLENGDKWETEIATNLRTESLYR

Entity 8 polymer

描述 description	B14.5a
分子量 formula_weight	13790.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MAEALKALEKVLLRIAPWRMTGVRSIPEFEHYLPMGLEYRKFSPGTQPVKAVVPHDSPKLVYDIKYFVRDYRRNNKYTARTVDAKTTFDFDKLYAGMPTKPEQVKNVTRPLIMPTRGY

Entity 9 polymer

描述 description	Mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase 18 kDa subunit
分子量 formula_weight	17977.6 kDa
EC 编号 ec_number	1.6.5.3
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MLRQLATLLPGALRSASGVNSLALNRGFKAVADVEIDFNNREVLKKYVGIRDHLSKEPGTRGKLIEALTEVLSSIKAAPEGSDYRKAVEASCIYRLKVCKENESDAAIEEVLDAHLEELIKEAKEEARLVPLIAGNAPWDVPADYAVPVVDYTDAATILDAPPKK

Entity 10 polymer

描述 description	Acyl carrier protein
分子量 formula_weight	13682.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J,r

MALSSAANVVRSAVLQHLRVTVTSSLQSSSLPTFTNIISRGFGGGFLDKDSVTERVLHVTKHFEKIDASKVSPAASFEKDLGLDSLDVVELVMALEEEFGLEIPDAEADKIASVGDAINYICSNPMAK

Entity 11 polymer

描述 description	NADH:ubiquinone oxidoreductase B14 subunit
分子量 formula_weight	16135.9 kDa
EC 编号 ec_number	1.6.5.3,1.6.99.3
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MSSRLAQKAVEVAHQDKRLFGGAARHFYFEICRCLPFIQRLHKMEEMVSLKELRAIVKEKFKEYKDVKDGRVVDLLIFKGREEIETYLLMHKQRHHVVTEVVEPYYAKQRAVKKVTTNSPFLDSFLSSGYAAIGVRNS

Entity 12 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial
分子量 formula_weight	20648.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

MQRSILSALLPRLPLGVREFATASADYSIAMKKAAEITGAAESAMGPKEGGFTAGVPLDTFTRKARIYAPARTASQSGLARTVDFATTTPAWKIEFEPTAKWQNPLMGWTSSADPLENVGRSALVFYTKEEAMRFCEKLGWEYEVTEPNKRRTQRTKRYMQYGDNFGTKRAGVPDLSTLPSNRAAAK

Entity 13 polymer

描述 description	NADH:ubiquinone oxidoreductase 13 kD-like subunit
分子量 formula_weight	16306.5 kDa
EC 编号 ec_number	1.6.5.3,1.6.99.3
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

MALQATSQLARHVISKTLGGAFATKAADVVPTFDWKKVPVPSTTAKDIPVTVKGATPAGDLRATSGLGLGDGIKNHTDKWLDGDKKSPMEYINEVAPIKVKGLVVASYGSDDPALGCPVEYINLKGTSLENPAVCKYTGNRYYSDDWKGGAAHH

Entity 14 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12
分子量 formula_weight	18034.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N

MSLSGYFSRLLEASGKKSVGSFFASWEFGKMLVDGNLAHNVLVRATGAGRLVGTDYNGNRYYENEEAAYGRRRWIVYKDKFDYNPTTIPPEWHGWLNYINDYNPTNTQFKQPTYQIEASMTKTGTQTCYNPKGSWFSAKPRNWRKYESWTPANKSA

Entity 15 polymer

描述 description	NADH:ubiquinone oxidoreductase B8 subunit
分子量 formula_weight	11012.5 kDa
EC 编号 ec_number	1.6.5.3
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O

MAWRNSLSKSMQELRIHLCQTSAGSKGVRDFIVANYAEMKKANPHFPILIRECAGTEASLTARYDFGAEKSVNVQGATTGAVQQQLEQLILAGQSMPKSGE

Entity 16 polymer

描述 description	Putative NADH:ubiquinone oxidoreductase 39 kDa subunit
分子量 formula_weight	43709.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P

MLPILGRNAAGSALARLAGLRWAAAASQSSRDYSSTLMTADKLGPGGRSSVSGITATVFGANGFLGSYIVNELAKRGSQVVCPFRSTENEAMHLKQMGDLGQIVLLPELDIRNDDDIKRAISRSNVIINCVGMRLQTKNWSFEDVHVDFPKRLAKLAAETGQVQRLIHFSDMGADENHKSLRMRTKAVGDKEVLDAFPDATIVRPGDIVGIEDHFYNYLIYQLTLTVFAPVVESGSNKIQPTYVLDVADAVAALLRKPDTAGKTLYLGGPEVLTMREVYDLLLKTLRIYRDDTVHLPAWAVKAMYKPFDSVRRMLPGLPMTSPLATEDYVEEMLRDKVVPAGALGYADLGIVPQKVTDGLAIEPVRHARVGGYRWGDMSAVAKDIPESVRKYYNIKQ

Entity 17 polymer

描述 description	NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1
分子量 formula_weight	31606.4 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q

MIVASILILIVPVLLSVAMFTLAERTVMASMQRRFGPQVSGISGLLQPFWDGLKLGVKEPVLPDSSSAGAFAASPMISFVLSQVAWVGICISDASFQGLVIMAISSLAVYGVMLAGWASNSKYAFLGCLRSVALMVSYELSLGAALLSIGLFVTDGTGMKCLNFAEMPTTPQYAMLPLCLIFLVCILAETKRDPFDLPEAELVAGYNVEYSSLGFALFFIAEYANMAVMSAIASIYFLGGFSALKITALFFAFVWTRGTLPRYRYDQFMRLGWKAFLPLTLAFFALHASVAI

Entity 18 polymer

描述 description	NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2
分子量 formula_weight	42763.9 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R

AAAAAMIELDLCFGLLLLILFGLLSLRNGHVSLAHIRFICQCWLVMITPLEVQDFALCILTVVLLQSFHSFEALLFLLLAYIGQLYMMHSCNLVSFYVCLEAQTLCVVVLCGLLARGASTSFSVEAALKFLLLSAMVSGMALFWFSAMYQRTGSLDMVGQETFWILLVMLFKLGVAPMHMWSVDLYGSIPKSLLLYLSTAPKLSLFTFWASSWHHDFSVGVFILFSMFIGSIGAYGQPALRSLFAYSTINEIGLLLLAVETAGFHTLYQHLGIYIITQLLLWNLTDKRLFALCAVSLAGLPPFAGFFGKAWIFWHAMSVQAFSLLAAALFCTLLSLVYYLRVIRLFWTAPVHTAASFTGAPNQTTLTSACAVALAFAPVMLVKPFVI

Entity 19 polymer

描述 description	NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3
分子量 formula_weight	30207.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S

MALRSASGLSLGVGRLLPCLNAQLSRELQAFAAPSREEQQGDVSAKSPAQLQQYVREHANAATCNKLGLGFAAQLLGTAAQQPSTSAVAAATAAKASCGPVLPARPTRRPLLPGMHRTPGFALPMQQSVRGYNAWSPAQRYFVEGDHVVTAEASRTFQFTGLDSGSFYPYVIATVIATAISTVFIVAPLVIAPSRVDLDKSSAYECGFDAFGEARQTFSVSFYLVSIMYLLFDIEIAYLFPYAMTHASLPMYWTMNLFLAILVAGFAYEWGMGALEWRE

Entity 20 polymer

描述 description	NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4
分子量 formula_weight	48766.7 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	T

MFISVLLILFALCVTLIPEAHYHMVRVWSFVATIIPMWVVTWMWWNFDASGHGLQMLVILGRSHLAFGIDGVALSLMLLTTVLFPICMMLLRTVAGFMTFILLEVLVLSALCVLDLLGFYILFEASLILLFLLIGRAPYGSLEAAYKIVLYTMAGSLVLLPTLFMIYSECGTTNVLYMTCAYNHQTVLGWGLLAVLAVKIPLMPVHLWLPEAHVAAPTAGSVLLAGVLLKLGGIGFLRFMLPVVPEFCVSVFPLVSTLCLVSFLFSTLSTLRQIDLKKIVAYSSIAHMSMVTLAIFSQSEFSAYSSSFLMIAHGLISPALFLIVGILYDRAHTKFILYFSGLGASMPIGSTLFFLFTLGNLAFPLFPNFIAEVLCMVSIFAVHELLAYVFCVCQVLGAAYGFWAFNRVVHGLPRGPADVTRTEFHTVLPLLIGAVWLGIKPMA

Entity 21 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase subunit 4L
分子量 formula_weight	24258.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U

MSRTQLLRRLLPGVPGTPGLFSQSCTAVPNGLQQCGFFSSHEEEQKQQSSLQPASSSLVQFANIVNRPMPVPLATAAGFAASPLMAMPARRGAGVMGVRRPALPMLPGMGPTTTPSAALARSYYTEGEIFGTTFMYTTNMMFWAGIVGAVAFRRNLIILLLSAETVMLACNMNFLFTAAYLNDITGAIMSITITTIAACETAIGLALCVAYFHMRSATDVEALNMLK

Entity 22 polymer

描述 description	NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5
分子量 formula_weight	59087.4 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	V

MFLLSVFFPLLGGLVNTSPIARFLGHRGSSIIAIGCMVVAFISSVVIYYEVVFMGCAVSVDVFGTWFSVGTFHAGWTFNFDLLTANMLFTVTGVSMAVHMYACDYMRQDPHLNLFLGYLSYFTGFMCVLVAADNLLVMLVGWEGIGVCSYLLIGYWSHRLSAVKSAQKAILVNRVSDGLLMWGVLWVWYHLGSLEYDLLNVYSASGFVGLSILIGAMGKSAQILFHVWLADAMEGPTPVSALIHAATLVTAGVYLLVRLHIHDEMFVIIVGSLTAFMAGVFGATQSDLKRVIAYSTCSQLGYMMVSLGLGETGGEASMGHLMTHASFKAALFLAAGMVISGNGGNQHIARYGGSAHSAMFTMLTLMVASLSLIGWPELSGFYSKETILNLAAICADPIADVAHTLLLLTAMLTSAYTTKLFYQCFMVDFSGSSVTPVRNVLPILAMAILLLDIMLKVWVGTNLLSGMLFFLPWGVKTLPFGLMVAGILTATAAVGSERFTLIRFCGSRWGFDQLFARSPVNPIFDLGRITWAIGDRGLLSVGNLRA

Entity 23 polymer

描述 description	NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6
分子量 formula_weight	17756.3 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	W

MFFENSAILLCALLSIAVGYTKSPFMSLMYSVMLFINSSFVLMMLGFEFLALVNLLVYVGALAVLFLFVIMLLEIPATELRAYSRGWSTLGIFVFIINGVFQITPSMGPRGIITGLPGAESITNLGHALYLYFADLLILNSLVLTVALFGRFAIAPVRTTGR

Entity 24 polymer

描述 description	ASHI
分子量 formula_weight	17110.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X

MSLNSLRGLARSALQAKNALPAKAGAGAPVKLAPRPDKPLPTWYELWWDNGYYPGQPAADFMFGAWPGNMTETYYLRFWSVFGLALAAPFYYVANFTDETRMPMVPQQYPAEVRDVLVQRRNSMLKHDFSAPDFKEVKDRAKIYWTPMY

Entity 25 polymer

描述 description	P9
分子量 formula_weight	6764.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Y

MGLIRNIATFATAVVGWSVGIPFVVQARMNGYVERNLATYDAAQRQKAEEAAIGGPITSSGGHH

Entity 26 polymer

描述 description	KFYI
分子量 formula_weight	13848.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Z

MGGGHHHAPAGPEPSWAKQLAPKSGLCPPEFHYNREIWYPHGGFYCDPKGWRKNTLLTLGGIGVLLYMTFSYSTANEVRHMPPKGWIPSIMWNSNVPDPVDFRGRKLNRDGTLPEGESSGHGHH

Entity 27 polymer

描述 description	AGGG
分子量 formula_weight	14270.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	a

MLRRAATLAASTLKGASNSVAEAGSQQVRRMAGGGANAYHRTYNGKPVPPELQGADYITYAGVTMKKEFHLFDTVLSKLIGAGATFTCLYHFYLNAEEHWHGDIYFFEKDVQQNGWDDEHGHGHGHAKH

Entity 28 polymer

描述 description	ESSS
分子量 formula_weight	19630.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	b

MSNALRGLARRVGAQYLRNQRVRGGGGEYPGGSFWSEGTQTGKNGFLFGEVPINGQPRKTLWWEPYWYAGFGGMGVGVYLIYHAKPLEALDIKYWAAPRAAKELETEMRMLDKLNERPDLKERLVAVCKDLNMIEDEAYDLVLMRNEYKVKLGMHTGRVPEDLKAIYEELEA

Entity 29 polymer

描述 description	B9
分子量 formula_weight	7334.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	c

MSLGEAFRTAVYKEPVMVWSLMIYGVGISYAAFVKPSMIEPHSKDLPSAPPSLKEVMAGIQAKLNNK

Entity 30 polymer

描述 description	Mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase 10 kDa subunit
分子量 formula_weight	9994.4 kDa
EC 编号 ec_number	1.6.5.3,1.6.99.3
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	d

MGWAYSGEWGMLAGFCFGTLKNVQEGKAWFRRPYIHGAGMIAGYYLFKAAADWEDEALKRIITRYERKGYAIPEDRKELFAANQYK

Entity 31 polymer

描述 description	Mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kDa subunit
分子量 formula_weight	23390.8 kDa
EC 编号 ec_number	1.6.5.3,1.6.99.3
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	e

MVFSGAFNTPSSTTAREPYAKTKSSEAEYGVDTPVPASALKAADKHDALAYAVANAPLIGLAGLAAGAQEAYMTFERLPPTLSRQHFKQAQLLLGIIGKKTAYATLLGAVFSFTDATVENMRGKHDMTSGMVAGAVTGFLFGMGRPMPQPVAWPLAFAGAAVAADFIGELMPKYMKDYRIYGPVVHRENWGDPVPPRPPILDTGAAVRPSDPGQFWRGY

Entity 32 polymer

描述 description	Mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase 7.5 kDa subunit
分子量 formula_weight	7651.8 kDa
EC 编号 ec_number	1.6.5.3,1.6.99.3
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	f

MGWNALPSLVIITGIWTAGLFALDKVQMFRENKPAWANNKDGWQKALYRRDWYLQREEETLAMAK

Entity 33 polymer

描述 description	Mitochondrial putative NADH:ubiquinone oxidoreductase 6.5 kDa subunit
分子量 formula_weight	6497.4 kDa
EC 编号 ec_number	1.6.5.3,1.6.99.3
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	g

MPKVVGFQWERYEAWRHHPLLQFNKRNAFPGVGIGFAAFLAYVAYDKSQPKEDHH

Entity 34 polymer

描述 description	Mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase 13 kDa subunit
分子量 formula_weight	16187.2 kDa
EC 编号 ec_number	1.6.5.3,1.6.99.3
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	h

MAGSARNLGGLLRRTLAGEAGNAITQAGSRGFAAEAKQFTPDGKYMPGIFSKAKPLDRSTQWVHKNPYIEAWYYRRDHFENEFVWNYRTTIEALWFLGGFTAAAYALSVFAFRQADRRSGYPKRQILGDEPAMVLPDERQFY

Entity 35 polymer

描述 description	NADH:ubiquinone oxidoreductase 15 kDa subunit-like
分子量 formula_weight	9566.0 kDa
EC 编号 ec_number	1.6.5.3,1.6.99.3
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	i

MAGMGLSTGTARCYDWYMDYLKCMDERKEPMIALRREHCLEWLEDYNECLHREKERTRRQVIERERRAQLAGGSKPAGGGH

Entity 36 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7
分子量 formula_weight	10295.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	j

MADRFPPPPMKATQEQMDAADVPYHYRDYCAHMYIDYKECRLTSGFSWRTKCAHELHAYNKCEYKEFKRRVAIAIEEKRRRGLIAA

Entity 37 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9
分子量 formula_weight	13951.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	k

MASEVVLALPHKLRVMRMYRTGLKELINWSANRHEWYPRAYALRQEFEDSKALTDREEIRKKLEHGEELLARFRHWEPLIKPEFVGGTAYSINPAQPKLKFIPNYDAMDEYKKGDHL

Entity 38 polymer

描述 description	NADH:ubiquinone oxidoreductase 20,9 kD-like subunit
分子量 formula_weight	13461.3 kDa
EC 编号 ec_number	1.6.5.3,1.6.99.3
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	l

MTWPEPPNYYEAPKHGFKVTLENPTFPIINPDPNITDAVTNMRSENWGVVAGLAGLGYVAGYYFGAKVHWAKPTALFTSIFLGKSGLLWGMSDSAHRLMGFKENSKEVAANLPHVMQRESY

Entity 39 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13
分子量 formula_weight	16400.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	m

MTEVLKRGFPGMKSVKDMPIVQDAPPPGGFPTIRIERRLPSTGPTGVAIFAGLAAIMGYGFYKLHEQRQEKRFEADEILTVRKIVHPVLQAEWDLRYLEHLKREREEEAKVMKNVPGWKVGESTTRHRWLAPLESWDKRPLV

Entity 40 polymer

描述 description	Putative NADH:ubiquinone oxidoreductase 12.5 kDa subunit
分子量 formula_weight	12542.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	n

MTSNTVRVPYSHELYAMSRHVVFRAEKEHKAAVECKGKHDWPEDCKPESEALVRATNKLYKEIMEKSPEEFKEYAQCLDWYGLRFSRCRDKQTAFEKAFPIVDAKK

Entity 41 polymer

描述 description	Putative NADH:ubiquinone oxidoreductase 17.8 kDa subunit
分子量 formula_weight	17907.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	o

MSASVEERQSFHDKVNDVFKNLTGEAGKRWARPDEPILHTLNDEKEEPHIFFHNTNYRTSRKYINVEKTKILREQALECVRAAGTARYHKCTEVMKRLQAAVRVASNVDRGPLARKRDVGFIYHNNRLRELQQQAAELEIENPFPAPAKQATGGY

Entity 42 polymer

描述 description	Mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase 16 kDa subunit
分子量 formula_weight	15292.0 kDa
EC 编号 ec_number	1.6.5.3,1.6.99.3
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	p

MAYILDFLSYMWEKNNDDSASYKEWQDFLDVAEKDRRRDRIIAWRERTMYDDYAANAEEPIIYKRTAGFVWREVDPTGQAKNRNHTYMYNLKTFGHRSYTRRDPSELQAAATSVEARVKSGELGGLSPLA

Entity 43 polymer

描述 description	Mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase 19 kDa subunit
分子量 formula_weight	22349.1 kDa
EC 编号 ec_number	1.6.5.3,1.6.99.3
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	q

MALRALGRQLRSLNLLPAVQPARFFGAGAHHDDEHEEEEHGPAQTPTVFDKLVEVTVVDMNGIRHRVRGLQGQSLAQALVEYGFPDTYFFPNMGFYTQHIVDAHVFVPKEFWGKVQNVDPESDDGLAVKRMFRDIVQDYQRDTSFFASYITLGAEHNGMTVGIGPIKPWILHSEWAFAGVHDSRNKQFDKPTVEIWG

Entity 44 polymer

描述 description	Mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase 32 kDa subunit
分子量 formula_weight	32729.1 kDa
EC 编号 ec_number	1.6.5.3,1.6.99.3
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	s

MSLFKSSLPAGFLFPYRHPKAKGLVEGTLYGLGSLFRGVGAALDELGSMVQGPQGSVKDHVQPNLAFAPVHRKPDVPVNAGQVVPAPPAAARTLKIKEVVVPNKHSTAFVAANANVLGNVKLGAGSSVWYGAVLRGDVNGIEVGANSNIQDNAIVHVSKYSMDGTARPTVIGNNVTIGHAATVHACTIEDNCLVGMGATVLDGATVKSGSIVAAGAVVPPNTTIPSGQVWAGSPAKFLRHLEPEEASFIGKSASCYAELSAIHKFEQSKTFEEQYTESCIIKDRAALADPSNSVHQMWEYDSQTALVARAKR

Entity 45 polymer

描述 description	CAG2 - CA-like
分子量 formula_weight	31209.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	t

MLKRVGQSLVPFARAGLTQTAESFRGVSSQFFDAPNGPSVKQVLIEDEWYNRQRSIFPLLDKEPYYPVDVFVAPNAVVCGDVDIYGGASVFFGAVLRGDLNKIRLGNRSAILDRAVVHAARAVPTGLNAATLIGEKVTVEPYAVLRSCRVEPKVIIGARSVVCEGAVVESESILAPNSVVPPARRIPSGELWGGSPAKFIRKLTDHERDRVLDDVSTHYHNLATMFRREALEPGTAWRDVEAWRQKLVDQGEYEWINFREQKYLMRLQHEAEALEKLTH

Entity 46 polymer

描述 description	CAG1
分子量 formula_weight	24319.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	u

MNPINGLKTILHRVGFAMRESGQALERVGCRLQGVYSFEEKLNRHATVLPMRHNVPSLDKTSWVAPSGMVSGSVTLGENSSVWYGAIVRGDFQPVVVGSNSNIQDAAYVGATSEFSGPVTIGDNVSVGHGAVLKGCTVGDNVLIGMNSIISEHAEIQSGAVIAAGSYVEEGTTVPSGEVWAGSPAKKLRDVRAGEAEYLKSLPGRYTELAGEHKGIMKVLKMKQAEYFA

Entity 47 polymer

描述 description	P10
分子量 formula_weight	5122.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	v

GVFSRYYNTGLLCGVAVASGISIWWYNRESIYVRVKSDLEKEGKT

Entity 48 polymer

描述 description	Mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase 9 kDa subunit
分子量 formula_weight	12159.1 kDa
EC 编号 ec_number	1.6.5.3,1.6.99.3
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	w

MASVLRQLGLQALRSVQPQAQQQTQLALRRGMGGYAKPKVDTSLDHVFGDNSNKLNYNFEPMGMGSLFIRTMVMVGVFFFPVFIMINDDYKYTSFLDKVAAAKAAKSSE

Entity 49 polymer

描述 description	NUOP8
分子量 formula_weight	17157.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	x

MQRASLSLLKNCVGGASLLETSLQRALASSYTTLSSSTGSSSSSLPTPAVRPGLLSSLSSSGPCGVKGIRFAGDYKPEVPGNTVDNWTELRASWNKERASSLGTNYYLNVAVMGFAYWLNEAYYFPPRTLYVGALVFFALYVRKAYFSTPYAFKHEY

Entity 50 polymer

描述 description	NUOP7
分子量 formula_weight	13655.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	y

MSMKTLADYIRWRNKEPIKASVEEWRPPVPVINYDKPQNDVLSALDKDPIVRRVLINPKVKPPRVFPILGSPGYQFFAGLWTGAMLTFIFTSKPLGRKEVEDLVKYDPAYFPEYAKSH

Entity 51 non-polymer

描述 description	FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER
分子量 formula_weight	175.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

Entity 52 non-polymer

描述 description	FLAVIN MONONUCLEOTIDE
分子量 formula_weight	456.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

Entity 53 non-polymer

描述 description	IRON/SULFUR CLUSTER
分子量 formula_weight	351.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

Entity 54 non-polymer

描述 description	PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE
分子量 formula_weight	734.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	15

Entity 55 non-polymer

描述 description	S-[2-({N-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] dodecanethioate
分子量 formula_weight	540.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

Entity 56 non-polymer

描述 description	NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE
分子量 formula_weight	745.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

Entity 57 non-polymer

描述 description	2,3-DIMETHOXY-5-METHYL-6-(3,11,15,19-TETRAMETHYL-EICOSA-2,6,10,14,18-PENTAENYL)-[1,4]BENZOQUINONE
分子量 formula_weight	522.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

Entity 58 non-polymer

描述 description	(7S)-4-HYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-9-OXO-7-[(PALMITOYLOXY)METHYL]-3,5,8-TRIOXA-4-PHOSPHAHEXACOSAN-1-AMINIUM 4-OXIDE
分子量 formula_weight	763.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

Entity 59 non-polymer

描述 description	1,2-DIACYL-GLYCEROL-3-SN-PHOSPHATE
分子量 formula_weight	705.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

Entity 60 non-polymer

描述 description	CARDIOLIPIN
分子量 formula_weight	1464.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

Entity 61 non-polymer

描述 description	(1S)-2-{[{[(2R)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE
分子量 formula_weight	751.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

Entity 62 non-polymer

描述 description	CROTONYL COENZYME A
分子量 formula_weight	835.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

Entity 63 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

Entity 64 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1827

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7. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.51 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	83443

fit	/app/data/saxs_computation/f5/9f5y/9f5y.fit
pddf	/app/data/pr_computation/f5/9f5y/9f5y.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/f5/9f5y/9f5y.dat

Structure of the Chlamydomonas reinhardtii respiratory complex I from respiratory supercomplex

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

1. 结构基本信息 1. Structure Basics

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合体信息 (64)

Entity 1 polymer

聚合体 Polymer

Entity 2 polymer

聚合体 Polymer

Entity 3 polymer

聚合体 Polymer

Entity 4 polymer

聚合体 Polymer

Entity 5 polymer

聚合体 Polymer

Entity 6 polymer

聚合体 Polymer

Entity 7 polymer

聚合体 Polymer

Entity 8 polymer

聚合体 Polymer

Entity 9 polymer

聚合体 Polymer

Entity 10 polymer

聚合体 Polymer

Entity 11 polymer

聚合体 Polymer

Entity 12 polymer

聚合体 Polymer

Entity 13 polymer

聚合体 Polymer

Entity 14 polymer

聚合体 Polymer

Entity 15 polymer

聚合体 Polymer

Entity 16 polymer

聚合体 Polymer

Entity 17 polymer

聚合体 Polymer

Entity 18 polymer

聚合体 Polymer

Entity 19 polymer

聚合体 Polymer

Entity 20 polymer

聚合体 Polymer

Entity 21 polymer

聚合体 Polymer

Entity 22 polymer

聚合体 Polymer

Entity 23 polymer

聚合体 Polymer

Entity 24 polymer

聚合体 Polymer

Entity 25 polymer

聚合体 Polymer

Entity 26 polymer

聚合体 Polymer

Entity 27 polymer

聚合体 Polymer

Entity 28 polymer

聚合体 Polymer

Entity 29 polymer

聚合体 Polymer

Entity 30 polymer

聚合体 Polymer

Entity 31 polymer

聚合体 Polymer

Entity 32 polymer

聚合体 Polymer

Entity 33 polymer

聚合体 Polymer

Entity 34 polymer

聚合体 Polymer

Entity 35 polymer