9g4m

Crystal structure of monoacylglycerol lipase with BODIPY labeled probe

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 61.1 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9g4m

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9g4m
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id9g4m
沉积日期 deposition_date2024-07-15
最后修订 last_revision2025-06-11
结构标题 titleCrystal structure of monoacylglycerol lipase with BODIPY labeled probe
关键词 keywordsHydrolase, Serine Esterase; HYDROLASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier18.97
回转半径 Rg (电子) rg_electron18.06
零角强度 I(0) i034822800.00
分子量 molecular_weight30682.0 kDa
排除体积 excluded_volume29747 ų
包络体积 envelope_volume45599 ų
水化壳体积 shell_volume20549 ų
包络直径 envelope_diameter61.7
壳层 Rg shell_rg25.10
包络 Rg envelope_rg18.42
形状 Rg shape_rg18.03
总 Rg total_rg18.81
总原子数 total_atoms2325
残基数 n_residues290
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax61.1
Rg (实空间) rg_real18.83
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.31
I(0) (实空间) i0_real3.4820e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.9690e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal18.85
I(0) (倒空间) i0_reciprocal34820000.0000
解质量估计 total_estimate0.8822
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary24.6
偏度 Skewness skewness0.146
峰度 Kurtosis kurtosis-0.376
角度范围 angular_range— – 0.4200 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha9042000.0000
实空间数据点数 n_real_points73
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.832; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.994; Smooth: 0.975

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (4)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)