9gb2

Extended phiCD508 baseplate

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 295.5 Å Quality: EXCELLENT

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9gb2

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9gb2
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id9gb2
沉积日期 deposition_date2024-07-29
结构标题 titleExtended phiCD508 baseplate
关键词 keywordsBacteriophage, virus, needle, baseplate; VIRUS
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier81.73
回转半径 Rg (电子) rg_electron80.97
零角强度 I(0) i019592600000.00
分子量 molecular_weight1226300.0 kDa
排除体积 excluded_volume1548500 ų
包络体积 envelope_volume2838400 ų
水化壳体积 shell_volume281220 ų
包络直径 envelope_diameter233.9
壳层 Rg shell_rg91.54
包络 Rg envelope_rg75.74
形状 Rg shape_rg80.96
总 Rg total_rg81.14
总原子数 total_atoms173292
残基数 n_residues10974
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax295.5
Rg (实空间) rg_real84.48
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.88
I(0) (实空间) i0_real1.9530e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error4.5370e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal83.54
I(0) (倒空间) i0_reciprocal19690000000.0000
解质量估计 total_estimate0.9000
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary108.9
偏度 Skewness skewness0.362
峰度 Kurtosis kurtosis0.306
角度范围 angular_range— – 0.0950 −1
当前正则化参数 α current_alpha1.0330
最高正则化参数 α highest_alpha3162000000.0000
实空间数据点数 n_real_points20
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.691; Stabil: 0.899; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.964; Smooth: 0.976

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (6)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)