9gb7

Extended phiCD508 neck

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 312.8 Å Quality: EXCELLENT

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9gb7

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9gb7
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id9gb7
沉积日期 deposition_date2024-07-29
结构标题 titleExtended phiCD508 neck
关键词 keywordsBacteriophage, virus, needle, baseplate; VIRUS
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier
回转半径 Rg (电子) rg_electron118.60
零角强度 I(0) i025418100000.00
分子量 molecular_weight1381700.0 kDa
排除体积 excluded_volume1737700 ų
包络体积 envelope_volume3210200 ų
水化壳体积 shell_volume236460 ų
包络直径 envelope_diameter349.8
壳层 Rg shell_rg82.08
包络 Rg envelope_rg118.50
形状 Rg shape_rg118.60
总 Rg total_rg118.10
总原子数 total_atoms193656
残基数 n_residues12252
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax312.8
Rg (实空间) rg_real113.30
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.57
I(0) (实空间) i0_real2.4670e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error5.8630e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal101.00
I(0) (倒空间) i0_reciprocal24060000000.0000
解质量估计 total_estimate0.9065
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary96.3
偏度 Skewness skewness0.426
峰度 Kurtosis kurtosis-0.916
角度范围 angular_range— – 0.0650 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.3339
最高正则化参数 α highest_alpha1008000000.0000
实空间数据点数 n_real_points14
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.752; Stabil: 0.945; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.912; Smooth: 0.809

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (6)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)