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9gos

CryoEM structure of the native Chlamydomonas reinhardtii Flagella Membrane Glycoprotein 1B.

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 229.3 Å Quality: EXCELLENT

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9gos

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9gos
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id9gos
沉积日期 deposition_date2024-09-06
结构标题 titleCryoEM structure of the native Chlamydomonas reinhardtii Flagella Membrane Glycoprotein 1B.
关键词 keywordsMucin, Glycoprotein, Glycocalyx, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier87.40 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron87.96 Å
零角强度 I(0) i02005930000.00
分子量 molecular_weight382850.0 kDa
排除体积 excluded_volume481470 ų
包络体积 envelope_volume991780 ų
水化壳体积 shell_volume101360 ų
包络直径 envelope_diameter278.6 Å
壳层 Rg shell_rg73.46 Å
包络 Rg envelope_rg81.98 Å
形状 Rg shape_rg87.97 Å
总 Rg total_rg87.74 Å
总原子数 total_atoms54175
残基数 n_residues3878
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax229.3 Å
Rg (实空间) rg_real83.78 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.77 Å
I(0) (实空间) i0_real1.9260e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.5430e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal85.09 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal1992000000.0000
解质量估计 total_estimate0.9020
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary76.4 Å
偏度 Skewness skewness0.210
峰度 Kurtosis kurtosis-0.788
角度范围 angular_range— – 0.0900 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.7759
最高正则化参数 α highest_alpha87060000.0000
实空间数据点数 n_real_points19
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.999; Stabil: 0.969; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.825; Smooth: 0.000
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合体信息 (1)

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7. 引用文献 (1)

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8. 文件与曲线 (10)