9h3x

50S subunit precursor C-CP_H68_L35

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 254.8 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9h3x

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9h3x
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id9h3x
沉积日期 deposition_date2024-10-17
最后修订 last_revision2025-01-29
结构标题 title50S subunit precursor C-CP_H68_L35
关键词 keywordsribosome, antimicrobial peptide, RNA, ribosomal protein, PrAMP, proline-rich peptide, antibiotics, 50S, Api137; RIBOSOME
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier69.84
回转半径 Rg (电子) rg_electron70.44
零角强度 I(0) i049267800000.00
分子量 molecular_weight1197800.0 kDa
排除体积 excluded_volume1213200 ų
包络体积 envelope_volume2147900 ų
水化壳体积 shell_volume236910 ų
包络直径 envelope_diameter244.2
壳层 Rg shell_rg81.57
包络 Rg envelope_rg69.45
形状 Rg shape_rg70.47
总 Rg total_rg70.47
总原子数 total_atoms80353
残基数 n_residues5464
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax254.8
Rg (实空间) rg_real72.52
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.46
I(0) (实空间) i0_real4.9270e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error9.5040e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal70.42
I(0) (倒空间) i0_reciprocal49340000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8875
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary92.7
偏度 Skewness skewness0.505
峰度 Kurtosis kurtosis0.275
角度范围 angular_range— – 0.1100 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.9271
最高正则化参数 α highest_alpha5866000000.0000
实空间数据点数 n_real_points23
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.699; Stabil: 0.902; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.939; Smooth: 0.865

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (27)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)