9hl4

TRPML1 in complex with compound 3

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 124.9 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9hl4

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9hl4
下载 Download

1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id9hl4
沉积日期 deposition_date2024-12-04
结构标题 titleTRPML1 in complex with compound 3
关键词 keywordsIon channel, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier40.43
回转半径 Rg (电子) rg_electron39.60
零角强度 I(0) i01247310000.00
分子量 molecular_weight201950.0 kDa
排除体积 excluded_volume200180 ų
包络体积 envelope_volume372510 ų
水化壳体积 shell_volume74741 ų
包络直径 envelope_diameter124.7
壳层 Rg shell_rg48.16
包络 Rg envelope_rg39.44
形状 Rg shape_rg39.52
总 Rg total_rg40.08
总原子数 total_atoms15416
残基数 n_residues1820
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax124.9
Rg (实空间) rg_real40.19
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.74
I(0) (实空间) i0_real1.2470e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.9920e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal40.43
I(0) (倒空间) i0_reciprocal1248000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8822
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary54.4
偏度 Skewness skewness0.070
峰度 Kurtosis kurtosis-0.414
角度范围 angular_range— – 0.1950 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha70200000.0000
实空间数据点数 n_real_points40
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.877; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.971; Smooth: 0.863

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (8)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)