9hxc

CryoEM structure of Asgard AtubA/B2 microtubule

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 287.4 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9hxc

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9hxc
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id9hxc
沉积日期 deposition_date2025-01-07
结构标题 titleCryoEM structure of Asgard AtubA/B2 microtubule
关键词 keywordsAsgard archaea, microtubule, cryoEM, cytomotive filaments, cytoskeleton, STRUCTURAL PROTEIN; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier81.78
回转半径 Rg (电子) rg_electron81.22
零角强度 I(0) i023219400000.00
分子量 molecular_weight1324600.0 kDa
排除体积 excluded_volume1666900 ų
包络体积 envelope_volume2679400 ų
水化壳体积 shell_volume268360 ų
包络直径 envelope_diameter259.9
壳层 Rg shell_rg90.84
包络 Rg envelope_rg75.84
形状 Rg shape_rg81.25
总 Rg total_rg81.22
总原子数 total_atoms93142
残基数 n_residues11886
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax287.4
Rg (实空间) rg_real84.63
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.53
I(0) (实空间) i0_real2.3160e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error4.6470e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal83.33
I(0) (倒空间) i0_reciprocal23320000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8476
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary121.0
偏度 Skewness skewness0.425
峰度 Kurtosis kurtosis0.529
角度范围 angular_range— – 0.0950 −1
当前正则化参数 α current_alpha1.0390
最高正则化参数 α highest_alpha3589000000.0000
实空间数据点数 n_real_points20
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.490; Stabil: 0.919; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.963; Smooth: 0.835

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (3)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)