9l5v

cryo-EM structure of PSII-ACPII from Rhodomonas sp. NIES-2332

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 251.2 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id	9l5v
沉积日期 deposition_date	2024-12-23
结构标题 title	cryo-EM structure of PSII-ACPII from Rhodomonas sp. NIES-2332
关键词 keywords	photosynthesis complex, PHOTOSYNTHESIS; PHOTOSYNTHESIS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	73.15 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	73.96 Å
零角强度 I(0) i0	7641270000.00
分子量 molecular_weight	960440.0 kDa
排除体积 excluded_volume	1282100 Å³
包络体积 envelope_volume	1663900 Å³
水化壳体积 shell_volume	184640 Å³
包络直径 envelope_diameter	261.5 Å
壳层 Rg shell_rg	72.74 Å
包络 Rg envelope_rg	74.22 Å
形状 Rg shape_rg	74.01 Å
总 Rg total_rg	73.70 Å
总原子数 total_atoms	68506
残基数 n_residues	6430
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	251.2 Å
Rg (实空间) rg_real	76.32 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.30 Å
I(0) (实空间) i0_real	7.6490e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.5440e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal	72.63 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	7631000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8861
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	83.7 Å
偏度 Skewness skewness	0.561
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.025
角度范围 angular_range	— – 0.1050 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	1.2220
最高正则化参数 α highest_alpha	1426000000.0000
实空间数据点数 n_real_points	22
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.856; Stabil: 0.887; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.981; Smooth: 0.332

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合体信息 (41)

Entity 1 polymer

描述 description	Photosystem II protein D1
分子量 formula_weight	41541.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,a
原子数 atom_count	69223

TSTIVAWEVIYYNLYKNKKMTATLERRESASLWERFCSWITSTENRLYIGWFGVLMIPTLLTATTVYIIAFIAAPPVDIDGIREPVAGSLLYGNNIISGAVIPSSASIGIHFYPIWEAASLDEWLYNGGPYQLIVDHFLLGVCGWIGREWEFSYRLGMRPWISVAFTAPVAAASAVFLVYPIGQGSFSDGMPLGISGTFNFMLVFQAEHNILMHPFHQLGVAGVFGGSLFSAMHGSLVTSSLIRETTENESANYGYKFGQEEETYNIVAAHGYFGRLIFQYASFNNSRALHFFLGLWPVVGIWFTALGIMTMAFNLNGFNFNQSVVDSQGRVINTWADILNRANLGMEVMHERNAHNFPLDLAAGESLPVALTA

Entity 2 polymer

描述 description	Photosystem II CP47 reaction center protein
分子量 formula_weight	56199.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,b

GLPWYRVHTVVLNDPGRLIAVHLMHTALVAGWAGSMALYELAVFDPSDPVLNPMWRQGMFVMPFMARIGVTDSWGGWSITGESVANPGFWSFEGVALAHIGLSGLLFLAAVWHWVYWDLELFRDPRTGNPALDLPKIFGIHLLLSGVLCFGFGAFHVTGAWGPGIWVSDAYGITGKVQPVAPAWGPEGFNPFNPSGVASHHIAAGILGFAAGIFHIAVRPPQRLYRALRMGNIETVLSSSIAAVFWSAFITTGTMWYGSATTPIELFGPTRYQWDSGYFQQEIERRVENSLNEGLSLSEAWSRIPDKLAFYDYVGNNPAKGGLFRAGPMNKGDGIAEAWLGHPIFQDKEGRELTVRRMPAFFETFPVILVDKDGIIRADIPFRRAESKYSIEQVGVTTSFYGGKLNGQVFTDAPTVKKYARKAQLGEVMEFDRTTLESDGVFRSSPRGWYTFGHANFALLFFLGHLWHGSRTLFRDVFSGIGAEVTEQVEFGAFQKLGDRSTKKQGAV

Entity 3 polymer

描述 description	Photosystem II CP43 reaction center protein
分子量 formula_weight	53468.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,c

MKVFALGWLLKISLMKTLYSLRRFYHVETPFNSNIGIAGRDIESTGFAWWSGNSRLINVSGKLLGAHVAHAGLMVFWCGAMTLFEVAHYIPEKPLYEQGLILLPHLASLGWGVGPGGEIVDIYPYFVVGILHIISSAVLGFGGVYHSLIGPDTLEESFPAFGYDWRDKNKITTILGIHLVILGFGALLLVVKAMYLGGLYDTWAPGGGDVRIIDNPTLNPAVIIGYVLKSPWGGDGWICSVNNMEDIVGGHIWIGFTCIAGGFWHILTKPFAWARRAYVWSGEAYLSYSLVAVSLMGFIASQYSWYNNTAYPSEFYGPTGPEASQSQAFTFLVRDQRLGASVASAQGPTGLGKYLMRSPSGEIILGGETQRFWDLRAPWIEPLRGPNGLDLNKIKNDIQPWQERRAAEYMTHAPLGSLNSVGGVATEINSVNFVSPRSWLTCAHFLLGFVFYIGHLWHAGRARAAAAGFEKGINRENEPVLSLRPI

Entity 4 polymer

描述 description	Photosystem II D2 protein
分子量 formula_weight	39160.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,d

MTIAIGQEEGRGWFDLADDWLKRDRFVFVGWSGLLLFPTSYLSIGGWFTGTTFVTSWYTHGLASSYLEGCNFFTAAVSTPANSMGHSLLLLWGPEAQGDFTRWCQIGGLWAFCALHGSFGLIGFCLRQFEIARLVGIRPYNAIAFSGPIAIFVSVFLMYPLGQASWFFAPSLGVAAIFRFLLFIQGFHNFTLNPFHMMGVAGILGAALLCAIHGATVQNTIFEDGDAANTFRAFTPTQAEETYSMVTANRFWSQIFGVAFSNKRWLHFFMLFVPLAGLWTSAIGIVGLALNLRAYDFVSQELRAAEDPEFETFYTKNILLNEGIRSWMAAQDQPHENFIFPEEVLPRGNAL

Entity 5 polymer

描述 description	Cytochrome b559 subunit alpha
分子量 formula_weight	9503.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,e

MSGGSTGERPFSDIITSIRYWIIHSITIPALFVAGWLFVSTGLAYDIFGTPRPNEYFTQERQQVPLVNDRFSAKQELEDLTKGL

Entity 6 polymer

描述 description	Cytochrome b559 subunit beta
分子量 formula_weight	4860.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,f

MSKIKQPISYPIFTFRWLAIHGLAVPTVFFLGAITSMQFIQR

Entity 7 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein H
分子量 formula_weight	7429.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,h

MALRTRLGELLRPLNSEYGKVAPGWGTTPIMGFVMLLFAVFLLIILQIYNSSLIIENVDVDWASLGS

Entity 8 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein I
分子量 formula_weight	4390.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,i

MFTLKIVVYTTVTLFVSLFTFGFLSNDASRNPNRKDLE

Entity 9 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein K
分子量 formula_weight	5025.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K,k

MEGIFLLAKLPEAYAVFKPIIDVAPVIPVFFLLLAFVWQAAVGFR

Entity 10 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein L
分子量 formula_weight	4363.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,l

MSGPNPNKQPVELNRTSLFWGLLLIFVLAVLFSSYFFN

Entity 11 polymer

描述 description	Photosystem II protein M
分子量 formula_weight	11851.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M,m

TPFAMHASSAALLVLACAAGAAAFAPSTPALTGLKTTAFCQGPKLSAACRTPRAAKATAPSMSLMETANQAVLLAEGGMNVSVAAYLAVLLGTFVPVVFLITLFIQSEARKAAESGTE

Entity 12 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein T
分子量 formula_weight	3708.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	T,t

METLVYTFLLIGTLGVLFFAVFFRDPPRIAKK

Entity 13 polymer

描述 description	Photosystem II protein W
分子量 formula_weight	12592.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	W,w

DLIMLRTAVLCALIATAAAFSAAPMSGLQLRSGKTAMTMKSEGPMAAMNANVAKALAPAVAAFSVAAPAFAEGTGEALGVDDGRLLVPLVLIPVFVALLYGNFASTQDNEDFFDTYDQRRK

Entity 14 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center X protein
分子量 formula_weight	4193.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X,x

MTPSFSAFINSLLAGLFIVIIPIGTALLIVSQSDRLTRN

Entity 15 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein Psb30
分子量 formula_weight	3662.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Y,y

MPNLQTVAQLISLFLILTSGPAIIVLIALRRGNL

Entity 16 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein Z
分子量 formula_weight	6656.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Z,z

MVAILQLLVSMLILLSFALVVSVPVILVSPGEWEKSKGLVYTGAGLWFGLVIMTAAFNSFVI

Entity 17 polymer

描述 description	ACPII-1
分子量 formula_weight	25355.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	1,N

MLRSAVLATVAVSASAFTSPALFTRTSTRPAVSTAPTMQLYREGVLQGLGTDAIPGTDRPKNLDGALVGDVGFDPLGFSNWLDLRWAREAEIKHGRVAMLAATGMIVQDVYKFPGVQKTFGDASMMKLHNVAVDQGAMQQLFLWITVLETLTGIPAIIQTLNGSERQPGDFGFDPLGCGRNPETLARRQLVELKNGRLAMIAVGGMVHHYLLVGRGPIEFVKNIPNFKNPLPPF

Entity 18 polymer

描述 description	ACPII-2
分子量 formula_weight	23785.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	2,O

MLRTALIAACVASASAFAPGFAPMAMKSRSSAVSSMRMQEGDFSAAVPFLKRPTNLDGQYIGDVGFDPLGFSDVFDLRVLREAELKHGRFAMLATLGFIVQELYTFPFFPKMAPVDAHDYFVKQGGGSQIIFWISFVELFGVVALFETLQGKREPGDFAFDPLGLAKDEATLERYRLAEVKHARLAMIAIGGFIHQYWVTKQTVLEQLGNFKSLA

Entity 19 polymer

描述 description	ACPII-3
分子量 formula_weight	19900.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	3,P

DRSYSMPFLERPPALDGSLAGDVGFDPLGFSNYFDLKWLREAELKHGRVCMLGCTGFITQEKIQLPLPGFDNKVATEAFFSVPAGGLWQIFFTLGAIEILSNGGKLAPGDMFADGRAPGDLGFDPLNLSGDDAALRRFILAELKHCRLAMIGLGGMLHQMLITKQGPLDQLANFQPIQYYGL

Entity 20 polymer

描述 description	ACPII-4
分子量 formula_weight	21802.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	4,Q

LPRTANRAAAKTSPTMQLYKEGVLQGITVNAIPKSERPFGLDGTYVGDVGFDPLGFSSIIDMRWLREAELKHGRVCMLAATGMIVQDVYQFPGVTKSFGDAKMTTLHDVAVKQGSMQQLLVWLGLLEIFGFVAIVQMLQGSDRQPGDFGFDPLNCAANPDTLARRQLVELKNGRLAMIATAGMLHHFFITGKGPIQLITG

Entity 21 polymer

描述 description	ACPII-5
分子量 formula_weight	24844.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	5,R

MFRTTLALAAVAGAAAFAPAPAFAPKASIRAATNTAPRMAVFQGDFSESVPFLKTPTNLDGSLPGDVGFDPLGFSEVFDIRVLREAELKHGRIAMLATLGYLVQEAYVFPFFDKVPPIQAHDVLVKSGGMSQILLWTSFLEIFGGIALFQTIQGRRYPGDFAFDPLGLSQGKNAEKLERYQLAEIKHSRLAMLAFSGFVHQGFITKQGVLEQLGNFKPIPGFPEATFF

Entity 22 polymer

描述 description	ACPII-6
分子量 formula_weight	18970.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	6,S

NAMPFLERPPKLDGSLAGDVGFDPVGFSNYFDIRWLREAELKHGRVCMLGVTGLLVQEAICLPQFANGKTPVDDFFVVPAAGLWQVFFTIGAVEFFSNGFKLTPGDMFSEGREAGDLGFDPLGCGKNPDALARRRLVEVKNGRLAMIAFGGMLHQQLLTGQGTLEQLANFKAIN

Entity 23 polymer

描述 description	Psb-gama_linker
分子量 formula_weight	31784.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

LTTRIMARTVAVLACSLLLFAPSSHAFAPAGVARVGMPLRSNAVSARSARVTPAKMAMDPSQISHIADGAQTFLSTLDTVPFIDEVTGEAQGFTAPKNHFASVIGLWVLFALPVWSAAYKQAGASNPEWFGVSQVSEDAPGIGLLAKAAPEYNGPSFREGLEYVFSFVWKPPILIAWKPRTVYDRDAMDPARDTVVSKLYKGLGGALDKTAVYDEEDQLLILSDLVTFEETDLGRRREKIAEQAGWYTGNPSFGRSLIEYSEQTRKGKKDMGTVTISTEELAKLRAEAAKKE

Entity 24 polymer

描述 description	Psb-gama_linker
分子量 formula_weight	31815.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	g

LTTRIMARTVAVLACSLLLFAPSSHAFAPAGVARVGMPLRSNAVSARSARVTPAKMAMDPSQISHIADGAQTFLSTLDTVPFIDEVTGEPQGFTSPKNHFASVIGLWVLFALPVWSAAYKQAGCTTPDWFGVSQVAEDAPGVGLLAKAAPEYNGPSFREGLEYVFSFVWKPPILIAWKPRTVYDRDAMDPARDTVVSKLYKGLGGALDKTAVYDEEDQLLILSDLVTFEETDLGRRREKIAEQAGWYTGNPSFGRSLIEYSEQTRKGKKDMGTVTISTEELAKLRAEAAKKE

Entity 25 non-polymer

描述 description	FE (II) ION
分子量 formula_weight	55.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

Entity 26 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL A
分子量 formula_weight	893.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	194

Entity 27 non-polymer

描述 description	PHEOPHYTIN A
分子量 formula_weight	871.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

Entity 28 non-polymer

描述 description	;1,3,3-trimethyl-2-[(1E,3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(1R)-2,6,6-trimethylcyclohex-2-en-1-yl]octadeca-1,3,5,7,9,11,13,15,17-nonaenyl]cyclohexene ;
分子量 formula_weight	536.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	24

Entity 29 non-polymer

描述 description	;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ;
分子量 formula_weight	749.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

Entity 30 non-polymer

描述 description	1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL
分子量 formula_weight	795.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

Entity 31 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

Entity 32 non-polymer

描述 description	MANGANESE (II) ION
分子量 formula_weight	54.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

Entity 33 non-polymer

描述 description	1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE
分子量 formula_weight	787.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	22

Entity 34 non-polymer

描述 description	1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE
分子量 formula_weight	723.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	18

Entity 35 non-polymer

描述 description	DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)
分子量 formula_weight	949.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

Entity 36 non-polymer

描述 description	BICARBONATE ION
分子量 formula_weight	61.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

Entity 37 non-polymer

描述 description	PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE
分子量 formula_weight	616.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

Entity 38 non-polymer

描述 description	Chlorophyll c2
分子量 formula_weight	608.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	22

Entity 39 non-polymer

描述 description	;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(4~{R})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohexen-1-yl]octadeca-3,5,7,9,11,13,15-heptaen-1,17-diynyl]cyclohex-3-en-1-ol ;
分子量 formula_weight	564.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	46

Entity 40 non-polymer

描述 description	;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-(2,6,6-trimethylcyclohexen-1-yl)octadeca-3,5,7,9,11,13,15,17-octaen-1-ynyl]cyclohex-3-en-1-ol ;
分子量 formula_weight	550.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

Entity 41 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	676

▶

7. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.170 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	2.17 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	28657

fit	/app/data/saxs_computation/l5/9l5v/9l5v.fit
pddf	/app/data/pr_computation/l5/9l5v/9l5v.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/l5/9l5v/9l5v.dat

cryo-EM structure of PSII-ACPII from Rhodomonas sp. NIES-2332

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

1. 结构基本信息 1. Structure Basics

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合体信息 (41)

Entity 1 polymer

聚合体 Polymer

Entity 2 polymer

聚合体 Polymer

Entity 3 polymer

聚合体 Polymer

Entity 4 polymer

聚合体 Polymer

Entity 5 polymer

聚合体 Polymer

Entity 6 polymer

聚合体 Polymer

Entity 7 polymer

聚合体 Polymer

Entity 8 polymer

聚合体 Polymer

Entity 9 polymer

聚合体 Polymer

Entity 10 polymer

聚合体 Polymer

Entity 11 polymer

聚合体 Polymer

Entity 12 polymer

聚合体 Polymer

Entity 13 polymer

聚合体 Polymer

Entity 14 polymer

聚合体 Polymer

Entity 15 polymer

聚合体 Polymer

Entity 16 polymer

聚合体 Polymer

Entity 17 polymer

聚合体 Polymer

Entity 18 polymer

聚合体 Polymer

Entity 19 polymer

聚合体 Polymer

Entity 20 polymer

聚合体 Polymer

Entity 21 polymer

聚合体 Polymer

Entity 22 polymer

聚合体 Polymer

Entity 23 polymer

聚合体 Polymer

Entity 24 polymer

聚合体 Polymer

Entity 25 non-polymer

Entity 26 non-polymer

Entity 27 non-polymer

Entity 28 non-polymer

Entity 29 non-polymer

Entity 30 non-polymer

Entity 31 non-polymer

Entity 32 non-polymer

Entity 33 non-polymer

Entity 34 non-polymer

Entity 35 non-polymer

Entity 36 non-polymer

Entity 37 non-polymer

Entity 38 non-polymer

Entity 39 non-polymer

Entity 40 non-polymer

Entity 41 water

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)

Files (7)