9l8r

Dihydroxyacid dehydratase (DHAD)

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 89.7 Å Quality: REASONABLE

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9l8r

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9l8r
下载 Download

1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id9l8r
沉积日期 deposition_date2024-12-28
最后修订 last_revision2025-06-04
结构标题 titleDihydroxyacid dehydratase (DHAD)
关键词 keywords[2Fe-2S] cluster, mutant, BCAA biosynthetic pathway, LYASE; LYASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier24.80
回转半径 Rg (电子) rg_electron24.13
零角强度 I(0) i0119951000.00
分子量 molecular_weight56711.0 kDa
排除体积 excluded_volume54267 ų
包络体积 envelope_volume89044 ų
水化壳体积 shell_volume30421 ų
包络直径 envelope_diameter87.6
壳层 Rg shell_rg31.80
包络 Rg envelope_rg24.50
形状 Rg shape_rg24.18
总 Rg total_rg24.64
总原子数 total_atoms4255
残基数 n_residues569
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax89.7
Rg (实空间) rg_real25.88
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.30
I(0) (实空间) i0_real1.2020e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.4250e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal24.77
I(0) (倒空间) i0_reciprocal120000000.0000
解质量估计 total_estimate0.6454
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary29.9
偏度 Skewness skewness0.567
峰度 Kurtosis kurtosis0.185
角度范围 angular_range— – 0.3200 −1
当前正则化参数 α current_alpha3.9490
最高正则化参数 α highest_alpha22270000.0000
实空间数据点数 n_real_points64
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.714; Stabil: 0.885; Sysdev: 0.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.922; Smooth: 0.711

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (5)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)