9m8p

GPR3 dimer with antagonist AF64394

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 86.2 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9m8p

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9m8p
下载 Download

1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id9m8p
沉积日期 deposition_date2025-03-12
结构标题 titleGPR3 dimer with antagonist AF64394
关键词 keywordsGPCR, dimer, antagonist, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier25.95
回转半径 Rg (电子) rg_electron25.07
零角强度 I(0) i083714600.00
分子量 molecular_weight51463.0 kDa
排除体积 excluded_volume51772 ų
包络体积 envelope_volume88852 ų
水化壳体积 shell_volume29315 ų
包络直径 envelope_diameter89.2
壳层 Rg shell_rg32.54
包络 Rg envelope_rg25.29
形状 Rg shape_rg25.04
总 Rg total_rg25.80
总原子数 total_atoms3921
残基数 n_residues508
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax86.2
Rg (实空间) rg_real25.90
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.73
I(0) (实空间) i0_real8.3710e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.2400e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal25.92
I(0) (倒空间) i0_reciprocal83720000.0000
解质量估计 total_estimate0.8883
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary28.3
偏度 Skewness skewness0.272
峰度 Kurtosis kurtosis-0.426
角度范围 angular_range— – 0.3050 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha16590000.0000
实空间数据点数 n_real_points62
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.864; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.991; Smooth: 0.961

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (5)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)