9mog

Structure of the distal part of the bacteriophage T4 tail

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 498.0 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9mog

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9mog
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id9mog
沉积日期 deposition_date2024-12-26
结构标题 titleStructure of the distal part of the bacteriophage T4 tail
关键词 keywordsbacteriophage T4, contractile tail, baseplate, VIRAL PROTEIN; VIRAL PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier
回转半径 Rg (电子) rg_electron181.40
零角强度 I(0) i01182310000000.00
分子量 molecular_weight9247700.0 kDa
排除体积 excluded_volume11524000 ų
包络体积 envelope_volume23296000 ų
水化壳体积 shell_volume1057500 ų
包络直径 envelope_diameter592.2
壳层 Rg shell_rg168.50
包络 Rg envelope_rg178.70
形状 Rg shape_rg181.40
总 Rg total_rg181.40
总原子数 total_atoms652117
残基数 n_residues84090
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax498.0
Rg (实空间) rg_real175.40
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.84
I(0) (实空间) i0_real1.1200e+12
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.0030e+10
Rg (倒空间) rg_reciprocal155.50
I(0) (倒空间) i0_reciprocal1017000000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8973
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary186.7
偏度 Skewness skewness0.206
峰度 Kurtosis kurtosis-0.684
角度范围 angular_range— – 0.0400 −1
当前正则化参数 α current_alpha1.8550
最高正则化参数 α highest_alpha37350000000.0000
实空间数据点数 n_real_points9
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.233; Oscil: 0.999; Stabil: 0.906; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.961; Smooth: 0.000

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (23)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)