9o0b

X-ray Crystal Structure of Fission Yeast Fsc1 protein in P43212

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 151.3 Å Quality: REASONABLE

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id	9o0b
沉积日期 deposition_date	2025-04-02
结构标题 title	X-ray Crystal Structure of Fission Yeast Fsc1 protein in P43212
关键词 keywords	Fasciclin, Fission Yeast, Autophagy, CELL ADHESION; CELL ADHESION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	43.10 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	43.86 Å
零角强度 I(0) i0	66911500.00
分子量 molecular_weight	68691.0 kDa
排除体积 excluded_volume	86941 Å³
包络体积 envelope_volume	125640 Å³
水化壳体积 shell_volume	27063 Å³
包络直径 envelope_diameter	149.9 Å
壳层 Rg shell_rg	41.55 Å
包络 Rg envelope_rg	43.51 Å
形状 Rg shape_rg	43.85 Å
总 Rg total_rg	43.76 Å
总原子数 total_atoms	4846
残基数 n_residues	606
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	151.3 Å
Rg (实空间) rg_real	43.81 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	2.03 Å
I(0) (实空间) i0_real	6.6910e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.2140e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	43.11 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	66860000.0000
解质量估计 total_estimate	0.6120
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	24.5 Å
偏度 Skewness skewness	0.511
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.701
角度范围 angular_range	— – 0.1850 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	3553000.0000
实空间数据点数 n_real_points	38
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.274; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.131; Smooth: 0.000

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合体信息 (2)

Entity 1 polymer

描述 description	FAS1 domain-containing protein fsc1
分子量 formula_weight	73788.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	5002

KNEYEDKSTSIIDLLSSKSQFSKLIRRLQRNRLVPYLNRNKGLTLFAPLNEAFPDDSIEPNLLYYIVNTTELDRSVLRTQLKSSDGQQIALKIHYKAETGRAYDKVNNAQIVQSNWRADSGVVQVIDNIIDLPPPALEILSSEKDFSIFHRLSVAWVGEYSSVTMLVPDSSAFLNVYTNTELAYLYSMYAAEDVKTLIHQHILVNQRVYAEDVIEPKTFHYKNGISISMKFDKDQKKLFINDVSTTKYDLLTFSGAIHTVSSLINPEIISFTPAKYLIGIGAAWFSEKLSRERKSISVDKTSKRAILAPTNWAYREIIDIDYHIIENFDLPAPNKYALYVTNIKSGNSVGEDTNALVRIATGSAGEMYVNVETRSIQSENIGNVSLYVLDKDIEPPQPLLSQLILVDEISFSVRYLASLGLGDYTKVTWFLVKNSAWTQLGLVHLVLQQNLELLESVMLDYAFEGIAFYGSSDEAWASGNYTTLSNKEFLIEGVYEDSNSRNKRDLLRINNEIYEVQTRDLLVKDGVVHLVDKVKLPFSVSQKDMIIAGGRKEFLELLDKFEMLDMLDSGYPVVVPSLTGSDVNTKDSSFAERHIIDPEKRNFVISGSRLSVDSSPWISIQDYGYSELGNVYFVQNAIPTKRQNRWRIT

来源 Source

来源生物 organism	Schizosaccharomyces pombe
通用名 common_name	fission yeast
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4896
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

Entity 2 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	148

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7. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	58.003 Å
晶胞边长 b length_b	58.003 Å
晶胞边长 c length_c	488.271 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 43 21 2
空间群编号 int_tables_number	96
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.504 Å
最低分辨率 resolution_low	41.010 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2439
R_free r_free	0.2983

fit	/app/data/saxs_computation/o0/9o0b/9o0b.fit
pddf	/app/data/pr_computation/o0/9o0b/9o0b.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/o0/9o0b/9o0b.dat

X-ray Crystal Structure of Fission Yeast Fsc1 protein in P43212

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

1. 结构基本信息 1. Structure Basics

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合体信息 (2)

Entity 1 polymer

聚合体 Polymer

来源 Source

Entity 2 water

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)