data_SASDDQ4_MAIN # _sas_result.id 855 _sas_result.SASBDB_code SASDDQ4 _sas_result.experimental_MW 15.000 _sas_result.experimental_MW_error . _sas_result.MW_standard 18.000 _sas_result.MW_standard_error . _sas_result.MW_Porod . _sas_result.MW_Porod_error . _sas_result.I0_from_PR 0.0343400000 _sas_result.I0_from_PR_error 0.0000600000 _sas_result.I0_from_Guinier 0.0341250000 _sas_result.I0_from_Guinier_error 0.0060000000 _sas_result.Rg_from_PR 2.310 _sas_result.Rg_from_PR_error 0.006 _sas_result.Rg_from_Guinier 2.220 _sas_result.Rg_from_Guinier_error 0.006 _sas_result.D_max 8.00 _sas_result.Porod_volume 20.00 _sas_result.Porod_volume_error . _sas_result.estimated_volume . _sas_result.estimated_volume_error . _sas_result.estimated_volume_method . _sas_result.Guinier_point_min 23 _sas_result.Guinier_point_max 128 _sas_result.type_of_curve extrapolated _sas_result.standard . _sas_result.Dmax_error . _sas_result.comments "The protein analysed consists of a fusion of two interacting partner proteins: the LIM domains of Lhx4 and the LID of Isl2. The ab initio bead models presented in this entry include: 1) The best-fit individual reconstruction (top) and; 2) The spatially aligned and volume/bead occupancy-corrected averaged representation of the protein in solution (bottom) calculated from twenty individual reconstructions (NSD = 0.68; resolution estimate = 2.8 nm). Five concentrations of protein were subjected to SAXS as static samples (96-well plate) at the Australian Synchrotron. Subtle concentration dependent effects were noted. All data and additional information relating to the concentration series is included in the full-entry zip archive. The protein was subjected to SEC (off line) as the last purification step just prior to data collection. Also refer to the related SASBDB entry SASDDR4." # _sas_scan.title "LIM/homeobox protein Lhx4 LIM domains fused to the LIM interaction domain (LID) of Insulin gene enhancer protein ISL-2" _sas_scan.detc_id 16 _sas_scan.id 855 _sas_scan.measurement_date 2015-11-19 _sas_scan.storage_temperature . _sas_scan.cell_temperature 13.5 _sas_scan.exposure_time 1.000 _sas_scan.number_of_frames 24 _sas_scan.unit 1/A _sas_scan.qmin 0.0064 _sas_scan.qmax 0.3277 _sas_scan.sample_id 815 _sas_scan.result_id 855 _sas_scan.beam_id 17 # _sas_beam.id 17 _sas_beam.instrument_name "Australian Synchrotron SAXS/WAXS" _sas_beam.instrument_city Melbourne _sas_beam.instrument_country Australia _sas_beam.shape Point _sas_beam.type_of_source "X-ray synchrotron" _sas_beam.radiation_wavelength 0.103320 _sas_beam.dist_spec_to_detc . # _sas_detc.id 16 _sas_detc.name "Pilatus 1M" _sas_detc.type Dectris _sas_detc.pixsize_x 172.000 # _sas_sample.id 815 _sas_sample.name "LIM/homeobox protein Lhx4 LIM domains fused to the LIM interaction domain (LID) of Insulin gene enhancer protein ISL-2" _sas_sample.ext_coefficient . _sas_sample.contrast . _sas_sample.specific_vol . _sas_sample.purity_method . _sas_sample.dry_vol . _sas_sample.sample_MW . _sas_sample.specimen_concentration 0.12-1.90 _sas_sample.concentration_method . loop_ _sas_sample.entity_id 814 815 # _sas_buffer.id 332 _sas_buffer.name "20 mM Tris, 150 mM NaCl, 1 mM TCEP" _sas_buffer.concentration . _sas_buffer.unit . _sas_buffer.pK . _sas_buffer.pH 8.000 _sas_buffer.comment . _sas_buffer.composition . _sas_buffer.sample_id 815 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules 814 protein "LIM/homeobox protein Lhx4" 14.712 1 815 protein "Insulin gene enhancer protein ISL-2" 4.031 1 # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 814 "Lhx4-LIM domains" 815 ISL-2 # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code 814 GSMQQIPQCAGCNQHILDKFILKVLDRHWHSSCLKCADCQMQLADRCFSRAGSVYCKEDFFKRFGTKCTACQQGIPPTQVVRKAQDFVYHLHCFACIICNRQLATGDEFYLMEDGRLVCKEDYETAKQ 815 GGSGGHMGSGGGTPLVAGSPIRHENAVQGSAVEVQTYQPPW # loop_ _entity_src_gen.entity_id _entity_src_gen.gene_src_common_name 814 "Mus musculus" 815 "Mus musculus" # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.details 1 814 UniProt P53776 http://www.uniprot.org/uniprot/P53776 2 815 UniProt Q9CXV0 http://www.uniprot.org/uniprot/Q9CXV0 # _citation.id 436 _citation.title "Mutation in a flexible linker modulates binding affinity for modular complexes." _citation.year "2019 Feb 20" _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1002/prot.25675 _citation.pdbx_database_id_PubMed 30788856 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.ordinal _citation_author.name 436 1 "Stokes PH" 436 2 "Robertson NO" 436 3 "Silva AP" 436 4 "Estephan T" 436 5 "Trewhella J" 436 6 "Guss JM" # _pdbx_contact_author.id 149 _pdbx_contact_author.name_first Philippa _pdbx_contact_author.name_last Stokes _pdbx_contact_author.role . _pdbx_contact_author.address_1 . _pdbx_contact_author.address_2 "School of Life and Environmental Science, University of Sydney" _pdbx_contact_author.address_3 "Sydney, Australia" # loop_ _sas_scan_intensity.id _sas_scan_intensity.momentum_transfer _sas_scan_intensity.intensity _sas_scan_intensity.intensity_su_counting _sas_scan_intensity.scan_id 1 6.439803E-03 4.251413E-02 1.949602E-03 855 2 6.830093E-03 4.063173E-02 1.088375E-03 855 3 7.220384E-03 4.563538E-02 9.456715E-04 855 4 7.610674E-03 3.517942E-02 6.756228E-04 855 5 8.000965E-03 3.797562E-02 6.067454E-04 855 6 8.391255E-03 3.231743E-02 5.729452E-04 855 7 8.781546E-03 3.824514E-02 5.415276E-04 855 8 9.171836E-03 3.280331E-02 5.074662E-04 855 9 9.562126E-03 3.081905E-02 5.027968E-04 855 10 9.952416E-03 3.601613E-02 4.585558E-04 855 11 1.034271E-02 3.051003E-02 4.704616E-04 855 12 1.073300E-02 3.970507E-02 4.483114E-04 855 13 1.112329E-02 3.571883E-02 4.395149E-04 855 14 1.151358E-02 3.519710E-02 4.255305E-04 855 15 1.190387E-02 3.244698E-02 4.091335E-04 855 16 1.229415E-02 3.266970E-02 4.079689E-04 855 17 1.268444E-02 3.183116E-02 3.892723E-04 855 18 1.307473E-02 3.623907E-02 3.802723E-04 855 19 1.346502E-02 3.411162E-02 3.684556E-04 855 20 1.385531E-02 3.577540E-02 3.555046E-04 855 21 1.424560E-02 3.346062E-02 3.620216E-04 855 22 1.463589E-02 3.607587E-02 3.549207E-04 855 23 1.502618E-02 3.096965E-02 3.427667E-04 855 24 1.541647E-02 3.301382E-02 3.376704E-04 855 25 1.580675E-02 3.350230E-02 3.282879E-04 855 26 1.619704E-02 3.342451E-02 3.219447E-04 855 27 1.658733E-02 3.347565E-02 3.091907E-04 855 28 1.697762E-02 3.346884E-02 3.226851E-04 855 29 1.736791E-02 3.214326E-02 3.088818E-04 855 30 1.775819E-02 3.359603E-02 3.062459E-04 855 31 1.814848E-02 3.320713E-02 3.001605E-04 855 32 1.853877E-02 3.189980E-02 2.909119E-04 855 33 1.892906E-02 3.254210E-02 2.981924E-04 855 34 1.931934E-02 3.210072E-02 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CA 1525 ATOM 140 . CA . ASP . 1525 15 . 5.095 -23.305 10.238 1.00 20.00 ? ? ? ? ? . 15 ASP . CA 1525 ATOM 141 . CA . ASP . 1525 15 . 4.995 -17.385 4.857 1.00 20.00 ? ? ? ? ? . 15 ASP . CA 1525 ATOM 142 . CA . ASP . 1525 15 . 4.944 -14.425 2.167 1.00 20.00 ? ? ? ? ? . 15 ASP . CA 1525 ATOM 143 . CA . ASP . 1525 15 . 4.894 -11.466 -0.523 1.00 20.00 ? ? ? ? ? . 15 ASP . CA 1525 ATOM 144 . CA . ASP . 1525 15 . 4.843 -8.506 -3.213 1.00 20.00 ? ? ? ? ? . 15 ASP . CA 1525 ATOM 145 . CA . ASP . 1525 15 . 4.793 -5.546 -5.903 1.00 20.00 ? ? ? ? ? . 15 ASP . CA 1525 ATOM 146 . CA . ASP . 1525 15 . 4.743 -2.586 -8.593 1.00 20.00 ? ? ? ? ? . 15 ASP . CA 1525 ATOM 147 . CA . ASP . 1525 15 . 4.541 9.253 -19.354 1.00 20.00 ? ? ? ? ? . 15 ASP . CA 1525 ATOM 148 . CA . ASP . 1525 15 . 4.491 12.213 -22.044 1.00 20.00 ? ? ? ? ? . 15 ASP . CA 1525 ATOM 149 . CA . ASP . 1525 15 . 8.681 -30.512 14.136 1.00 20.00 ? ? ? ? ? . 15 ASP . CA 1525 ATOM 150 . CA . 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