SAXSdb — 11tv

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

alpha/beta-hydrolase macrolide esterase EstX

Escherichia coli

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白单体	单体	蛋白 1	;(3~{R},4~{S},5~{S},6~{R},8~{R},10~{E},12~{E},14~{R},15~{R})-14-[[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R},6~{R})-3,4-dimethoxy-6-methyl-5-oxidanyl-oxan-2-yl]oxymethyl]-5-[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-4-(dimethylamino)-5-[(2~{S},4~{R},5~{S},6~{S})-4,6-dimethyl-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-6-methyl-3-oxidanyl-oxan-2-yl]oxy-4,8,12-trimethyl-3,15-bis(oxidanyl)-9-oxidanylidene-6-(2-oxidanylideneethyl)heptadeca-10,12-dienoic acid ; × 1 water × 1	与蛋白数一致
2	蛋白单体	单体	蛋白 1	;(3~{R},4~{S},5~{S},6~{R},8~{R},10~{E},12~{E},14~{R},15~{R})-14-[[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R},6~{R})-3,4-dimethoxy-6-methyl-5-oxidanyl-oxan-2-yl]oxymethyl]-5-[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-4-(dimethylamino)-5-[(2~{S},4~{R},5~{S},6~{S})-4,6-dimethyl-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-6-methyl-3-oxidanyl-oxan-2-yl]oxy-4,8,12-trimethyl-3,15-bis(oxidanyl)-9-oxidanylidene-6-(2-oxidanylideneethyl)heptadeca-10,12-dienoic acid ; × 1 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q75WM3_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–280； UniProt 1–280 作者链 D； PDB构建体 1–280； UniProt 1–280

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	11tv
沉积日期 deposition_date	2026-03-12
最后修订 last_revision	2026-04-08
结构标题 title	Crystal structure of alpha/beta-hydrolase macrolide esterase EstX from Escherichia coli (S102A mutant) in complex with linearized tylosin
关键词 keywords	alpha/beta-hydrolase, esterase, macrolide resistance, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

11tv__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

11tv__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

11tv__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	18.64 Å
Rg（电子密度）	17.34 Å
总 Rg	18.37 Å
原子数	2312
残基数	280
排除体积	39278 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`11tv__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`11tv__assembly_2__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	alpha/beta-hydrolase macrolide esterase EstX
分子量 formula_weight	31058.2 kDa
突变 mutation	S102A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,A
原子数 atom_count	4933

MKEKVVVDKAISLYTESFGDPAHEPIILIMGAMSSAVWWPDEFCSQLAKMGRYVIRYDHRDTGKSTSYEPGQAPYSVEELADDVVRVIDGYGLEAAHLVGMALGGFLSQLVALKYPKRVKSLTLIASERLADADPDMPAFDPAIIEYHQRAESLDWSDRDAVVAYQVGAWRINSGTAHAFDAEKIQNIAELNFDRTPNILTTFNHTTLGGGERWLGRLNEIAVPTLIIHGTEDPVLPYVHGLALKDAIRGSKMLTLEGTGHELHHEDWPRIIQAIKGQTS

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	;(3~{R},4~{S},5~{S},6~{R},8~{R},10~{E},12~{E},14~{R},15~{R})-14-[[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R},6~{R})-3,4-dimethoxy-6-methyl-5-oxidanyl-oxan-2-yl]oxymethyl]-5-[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-4-(dimethylamino)-5-[(2~{S},4~{R},5~{S},6~{S})-4,6-dimethyl-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-6-methyl-3-oxidanyl-oxan-2-yl]oxy-4,8,12-trimethyl-3,15-bis(oxidanyl)-9-oxidanylidene-6-(2-oxidanylideneethyl)heptadeca-10,12-dienoic acid ;
分子量 formula_weight	934.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	324

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晶胞边长 a length_a	44.594 Å
晶胞边长 b length_b	72.691 Å
晶胞边长 c length_c	82.051 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	95.73 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.650 Å
最低分辨率 resolution_low	29.020 Å
R 因子 r_factor	0.1654
R_work r_work	0.1642
R_free r_free	0.1988

Crystal structure of alpha/beta-hydrolase macrolide esterase EstX from Escherichia coli (S102A mutant) in complex with linearized tylosin

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

alpha/beta-hydrolase macrolide esterase EstX

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

11tv__assembly_1__model_1

11tv__assembly_1__model_1 | I(q)

11tv__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 water

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of alpha/beta-hydrolase macrolide esterase EstX from Escherichia coli (S102A mutant) in complex with linearized tylosin

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

alpha/beta-hydrolase macrolide esterase EstX

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

11tv__assembly_1__model_1

11tv__assembly_1__model_1 | I(q)

11tv__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 water

7. 引用文献 (1)