Escherichia coli
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 | 链 A； UniProt 3–292 | 未记录 | 无其他共同聚合物 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件 | 分辨率 2.50 Å R-free 0.287 |
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。
数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。
| UniProt名称 | XERD_ECOLI |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–290； UniProt 3–292 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
| 条目编号 entry_id | 1a0p |
| 沉积日期 deposition_date | 1997-12-05 |
| 结构标题 title | SITE-SPECIFIC RECOMBINASE, XERD |
| 关键词 keywords | XERD, RECOMBINASE, DNA BINDING, DNA RECOMBINATION; DNA RECOMBINATION |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
| 回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier | 21.10 Å |
| 回转半径 Rg (电子) rg_electron | 20.01 Å |
| 零角强度 I(0) i0 | 17018600.00 |
| 分子量 molecular_weight | 31252.0 kDa |
| 排除体积 excluded_volume | 39274 ų |
| 包络体积 envelope_volume | 46339 ų |
| 水化壳体积 shell_volume | 19844 ų |
| 包络直径 envelope_diameter | 72.5 Å |
| 壳层 Rg shell_rg | 25.90 Å |
| 包络 Rg envelope_rg | 20.10 Å |
| 形状 Rg shape_rg | 20.00 Å |
| 总 Rg total_rg | 20.88 Å |
| 总原子数 total_atoms | 2205 |
| 残基数 n_residues | 271 |
| 球谐函数阶数 n_harmonics | 20 |
| q 范围 q_range | — – 0.5000 Å−1 |
| 数据点数 n_points | 101 |
| 壳层类型 shell_type | directional |
| 溶剂电子密度 solvent_density | 0.3340 e/ų |
| 壳层衬度 contrast_shell | 0.0300 e/ų |
| CRYSOL 版本 crysol_version | 4.1.3 |
| 最大尺寸 Dmax dmax | 68.4 Å |
| Rg (实空间) rg_real | 21.06 Å |
| Rg 误差 (实空间) rg_real_error | 0.45 Å |
| I(0) (实空间) i0_real | 1.7020e+07 |
| I(0) 误差 (实空间) i0_real_error | 2.4600e+05 |
| Rg (倒空间) rg_reciprocal | 21.07 Å |
| I(0) (倒空间) i0_reciprocal | 17020000.0000 |
| 解质量估计 total_estimate | 0.8136 |
| 解质量评级 solution_quality | GOOD a GOOD solution |
| P(r) 峰数 n_peaks | 2 |
| 主峰位置 r_peak_primary | 26.1 Å |
| 偏度 Skewness skewness | 0.319 |
| 峰度 Kurtosis kurtosis | -0.289 |
| 角度范围 angular_range | — – 0.3750 Å−1 |
| 当前正则化参数 α current_alpha | 0.0000 |
| 最高正则化参数 α highest_alpha | 4828000.0000 |
| 实空间数据点数 n_real_points | 69 |
| GNOM 版本 gnom_version | 4.1.3 |
| 质量判据 quality_criteria | AN1: 0.000; Oscil: 0.860; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.995; Smooth: 0.000 |
| 结构域编号 domain_id | d1a0pa1 |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.60 — SAM domain-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.60.9 — lambda integrase-like, N-terminal domain |
| 家族 Family family | a.60.9.1 — lambda integrase-like, N-terminal domain |
| 结构域编号 domain_id | d1a0pa2 |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.163 — DNA breaking-rejoining enzymes |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.163.1 — DNA breaking-rejoining enzymes |
| 家族 Family family | d.163.1.1 — Lambda integrase-like, catalytic core |
| 结构域编号 domain_id | 1a0pA01 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 150 — DNA polymerase; domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 130 — Tyrosine recombinase, N-terminal domain |
| 结构域编号 domain_id | 1a0pA02 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 443 — hpI Integrase; Chain A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Intergrase catalytic core |