Enterobacteria phage P22
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–RNA 单体 蛋白 × 1 RNA 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物数一致 | 链 B； UniProt 14–32 | 未记录 | BOXB RNA × 1 | SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 5.7；297 K | 分辨率未提供 |
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。
数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。
| UniProt名称 | REGN_BPP22 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 B； PDB构建体 1–19； UniProt 14–32 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
| 条目编号 entry_id | 1a4t |
| 沉积日期 deposition_date | 1998-02-04 |
| 结构标题 title | SOLUTION STRUCTURE OF PHAGE P22 N PEPTIDE-BOX B RNA COMPLEX, NMR, 20 STRUCTURES |
| 关键词 keywords | ;BACTERIOPHAGE TRANSCRIPTIONAL ANTITERMINATION, PEPTIDE-RNA RECOGNITION, GNRA LOOP, BENT ALPHA-HELICAL PEPTIDE, TRANSCRIPTION REGULATION, TRANSCRIPTION-RNA COMPLEX ;; TRANSCRIPTION/RNA |
| 实验方法 method | SOLUTION NMR |
| 回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier | 11.05 Å |
| 回转半径 Rg (电子) rg_electron | 11.29 Å |
| 零角强度 I(0) i0 | 705725000.00 |
| 分子量 molecular_weight | 144760.0 kDa |
| 排除体积 excluded_volume | 148510 ų |
| 包络体积 envelope_volume | 12351 ų |
| 水化壳体积 shell_volume | 8999 ų |
| 包络直径 envelope_diameter | 44.0 Å |
| 壳层 Rg shell_rg | 17.40 Å |
| 包络 Rg envelope_rg | 12.63 Å |
| 形状 Rg shape_rg | 11.25 Å |
| 总 Rg total_rg | 11.45 Å |
| 总原子数 total_atoms | 16720 |
| 残基数 n_residues | 680 |
| 球谐函数阶数 n_harmonics | 20 |
| q 范围 q_range | — – 0.5000 Å−1 |
| 数据点数 n_points | 101 |
| 壳层类型 shell_type | directional |
| 溶剂电子密度 solvent_density | 0.3340 e/ų |
| 壳层衬度 contrast_shell | 0.0300 e/ų |
| CRYSOL 版本 crysol_version | 4.1.3 |
| 最大尺寸 Dmax dmax | 38.9 Å |
| Rg (实空间) rg_real | 11.06 Å |
| Rg 误差 (实空间) rg_real_error | 0.34 Å |
| I(0) (实空间) i0_real | 7.0570e+08 |
| I(0) 误差 (实空间) i0_real_error | 7.0710e+06 |
| Rg (倒空间) rg_reciprocal | 11.06 Å |
| I(0) (倒空间) i0_reciprocal | 705700000.0000 |
| 解质量估计 total_estimate | 0.8473 |
| 解质量评级 solution_quality | GOOD a GOOD solution |
| P(r) 峰数 n_peaks | 2 |
| 主峰位置 r_peak_primary | 13.8 Å |
| 偏度 Skewness skewness | 0.427 |
| 峰度 Kurtosis kurtosis | 0.102 |
| 角度范围 angular_range | — – 0.5000 Å−1 |
| 当前正则化参数 α current_alpha | 0.0000 |
| 最高正则化参数 α highest_alpha | 85910.0000 |
| 实空间数据点数 n_real_points | 80 |
| GNOM 版本 gnom_version | 4.1.3 |
| 质量判据 quality_criteria | AN1: 0.000; Oscil: 0.713; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.938; Smooth: 0.933 |
| 结构域编号 domain_id | d1a4tb_ |
| 类 Class class | j — Peptides |
| 折叠类型 Fold fold | j.9 — Arg-rich RNA binding peptides |
| 超家族 Superfamily superfamily | j.9.5 — Box B RNA-binding N peptide |
| 家族 Family family | j.9.5.1 — Box B RNA-binding N peptide |