SAXSdb — 1a7i

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

QCRP2 (LIM1)

Coturnix japonica

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–80	片段：N-TERMINAL LIM DOMAIN	ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 7.2；299 K	分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1A7I	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1CXX MUTANT R122A OF QUAIL CYSTEINE AND GLYCINE-RICH PROTEIN, NMR, MINIMIZED STRUCTURE 提交 1999-08-31	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 82–194（113 aa）片段：CARBOXYL-TERMINAL LIM-DOMAIN	突变：R122A	ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；299 K；压力 AMBIENT NMR样品组成 1.1MM QCRP2(LIM2)R122A 15N; 20MM POTASSIUM PHOSPHATE; 50MM POTASSIUM CHLORIDE; 0.5MM DTT;	分辨率未提供
1IBI QUAIL CYSTEINE AND GLYCINE-RICH PROTEIN, NMR, 15 MINIMIZED MODEL STRUCTURES 提交 2001-03-28	构建体不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 81–193（113 aa）片段：C-TERMINAL LIM DOMAIN, RESIDUES 82-194	未记录	ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.2；299 K；离子强度（mmCIF原始值）20mM potassium phosphate; 50mM KCl；压力 ambient NMR样品组成 1-2mM qCRP2(LIM2) U-15N,13C; 20 mM potassium phosphate, 50mM KCl, 0.5mM dithiothreitol, 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1-2mM qCRP2(LIM2) U-15N; 20 mM potassium phosphate, 50mM KCl, 0.5mM dithiothreitol, 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1QLI QUAIL CYSTEINE AND GLYCINE-RICH PROTEIN, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1997-02-17	构建体不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 81–193（113 aa）片段：C-TERMINAL LIM DOMAIN RESIDUES 82 - 194	未记录	ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.2；299 K	分辨率未提供

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CSRP2_COTJA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–81； UniProt 1–80

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1a7i
沉积日期 deposition_date	1998-03-15
结构标题 title	AMINO-TERMINAL LIM DOMAIN FROM QUAIL CYSTEINE AND GLYCINE-RICH PROTEIN, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE
关键词 keywords	LIM DOMAIN CONTAINING PROTEINS, METAL-BINDING PROTEIN, ZINC FINGER; LIM DOMAIN CONTAINING PROTEINS
实验方法 method	SOLUTION NMR

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	12.45 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	11.42 Å
零角强度 I(0) i0	1328650.00
分子量 molecular_weight	6877.0 kDa
排除体积 excluded_volume	8225 Å³
包络体积 envelope_volume	9527 Å³
水化壳体积 shell_volume	7569 Å³
包络直径 envelope_diameter	41.4 Å
壳层 Rg shell_rg	16.34 Å
包络 Rg envelope_rg	11.97 Å
形状 Rg shape_rg	11.46 Å
总 Rg total_rg	12.56 Å
总原子数 total_atoms	905
残基数 n_residues	60
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	43.6 Å
Rg (实空间) rg_real	12.46 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.34 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.3290e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.5000e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal	12.46 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	1329000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8514
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	14.3 Å
偏度 Skewness skewness	0.402
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.044
角度范围 angular_range	— – 0.5000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	222000.0000
实空间数据点数 n_real_points	80
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.725; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.949; Smooth: 0.940

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d1a7ia1
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.39 — Glucocorticoid receptor-like (DNA-binding domain)
超家族 Superfamily superfamily	g.39.1 — Glucocorticoid receptor-like (DNA-binding domain)
家族 Family family	g.39.1.3 — LIM domain

结构域编号 domain_id	d1a7ia2
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.39 — Glucocorticoid receptor-like (DNA-binding domain)
超家族 Superfamily superfamily	g.39.1 — Glucocorticoid receptor-like (DNA-binding domain)
家族 Family family	g.39.1.3 — LIM domain

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	1a7iA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	110 — Cysteine Rich Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cysteine Rich Protein

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8. 引用文献 (2)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

描述 description	QCRP2 (LIM1)
分子量 formula_weight	8837.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	905

来源生物 organism	Coturnix japonica
通用名 common_name	Japanese quail
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	93934
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

AMINO-TERMINAL LIM DOMAIN FROM QUAIL CYSTEINE AND GLYCINE-RICH PROTEIN, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

QCRP2 (LIM1)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

8. 引用文献 (2)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

fit	/app/data/saxs_computation/a7/1a7i/1a7i.fit
pddf	/app/data/pr_computation/a7/1a7i/1a7i.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/a7/1a7i/1a7i.dat