1afc

STRUCTURAL STUDIES OF THE BINDING OF THE ANTI-ULCER DRUG SUCROSE OCTASULFATE TO ACIDIC FIBROBLAST GROWTH FACTOR

Method: X-RAY DIFFRACTION

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ACIDIC FIBROBLAST GROWTH FACTOR

Bos taurus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	1,3,4,6-tetra-O-sulfo-beta-D-fructofuranose-(2-1)-2,3,4,6-tetra-O-sulfonato-alpha-D-glucopyranose × 1	与蛋白数一致
2	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	1,3,4,6-tetra-O-sulfo-beta-D-fructofuranose-(2-1)-2,3,4,6-tetra-O-sulfonato-alpha-D-glucopyranose × 1	与蛋白数一致
3	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	1,3,4,6-tetra-O-sulfo-beta-D-fructofuranose-(2-1)-2,3,4,6-tetra-O-sulfonato-alpha-D-glucopyranose × 1	与蛋白数一致
4	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	1,3,4,6-tetra-O-sulfo-beta-D-fructofuranose-(2-1)-2,3,4,6-tetra-O-sulfonato-alpha-D-glucopyranose × 1	与蛋白数一致
5	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	1,3,4,6-tetra-O-sulfo-beta-D-fructofuranose-(2-1)-2,3,4,6-tetra-O-sulfonato-alpha-D-glucopyranose × 1	与蛋白数一致
6	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	1,3,4,6-tetra-O-sulfo-beta-D-fructofuranose-(2-1)-2,3,4,6-tetra-O-sulfonato-alpha-D-glucopyranose × 1	与蛋白数一致
7	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	1,3,4,6-tetra-O-sulfo-beta-D-fructofuranose-(2-1)-2,3,4,6-tetra-O-sulfonato-alpha-D-glucopyranose × 1	与蛋白数一致
8	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	1,3,4,6-tetra-O-sulfo-beta-D-fructofuranose-(2-1)-2,3,4,6-tetra-O-sulfonato-alpha-D-glucopyranose × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FGF1_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–140； UniProt 16–155 作者链 B； PDB构建体 1–140； UniProt 16–155 作者链 C； PDB构建体 1–140； UniProt 16–155 作者链 D； PDB构建体 1–140； UniProt 16–155 作者链 E； PDB构建体 1–140； UniProt 16–155 作者链 F； PDB构建体 1–140； UniProt 16–155 作者链 G； PDB构建体 1–140； UniProt 16–155 作者链 H； PDB构建体 1–140； UniProt 16–155

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1afc
沉积日期 deposition_date	1993-07-13
结构标题 title	STRUCTURAL STUDIES OF THE BINDING OF THE ANTI-ULCER DRUG SUCROSE OCTASULFATE TO ACIDIC FIBROBLAST GROWTH FACTOR
关键词 keywords	GROWTH FACTOR; GROWTH FACTOR
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1afc__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1afc__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1afc__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	14.95 Å
Rg（电子密度）	13.48 Å
总 Rg	14.76 Å
原子数	1038
残基数	127
排除体积	18262 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1afc__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`1afc__assembly_2__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`1afc__assembly_3__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`1afc__assembly_4__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
5	1	`1afc__assembly_5__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
6	1	`1afc__assembly_6__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
7	1	`1afc__assembly_7__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
8	1	`1afc__assembly_8__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

结构域编号 domain_id	d1afca_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.42 — beta-Trefoil
超家族 Superfamily superfamily	b.42.1 — Cytokine
家族 Family family	b.42.1.1 — Fibroblast growth factors (FGF)

结构域编号 domain_id	d1afcb_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.42 — beta-Trefoil
超家族 Superfamily superfamily	b.42.1 — Cytokine
家族 Family family	b.42.1.1 — Fibroblast growth factors (FGF)

结构域编号 domain_id	d1afcc_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.42 — beta-Trefoil
超家族 Superfamily superfamily	b.42.1 — Cytokine
家族 Family family	b.42.1.1 — Fibroblast growth factors (FGF)

结构域编号 domain_id	d1afcd_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.42 — beta-Trefoil
超家族 Superfamily superfamily	b.42.1 — Cytokine
家族 Family family	b.42.1.1 — Fibroblast growth factors (FGF)

结构域编号 domain_id	d1afce_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.42 — beta-Trefoil
超家族 Superfamily superfamily	b.42.1 — Cytokine
家族 Family family	b.42.1.1 — Fibroblast growth factors (FGF)

结构域编号 domain_id	d1afcf_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.42 — beta-Trefoil
超家族 Superfamily superfamily	b.42.1 — Cytokine
家族 Family family	b.42.1.1 — Fibroblast growth factors (FGF)

结构域编号 domain_id	d1afcg_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.42 — beta-Trefoil
超家族 Superfamily superfamily	b.42.1 — Cytokine
家族 Family family	b.42.1.1 — Fibroblast growth factors (FGF)

结构域编号 domain_id	d1afch_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.42 — beta-Trefoil
超家族 Superfamily superfamily	b.42.1 — Cytokine
家族 Family family	b.42.1.1 — Fibroblast growth factors (FGF)

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	1afcA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	80 — Trefoil
拓扑 Topology topology	10 — Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 —

结构域编号 domain_id	1afcB00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	80 — Trefoil
拓扑 Topology topology	10 — Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 —

结构域编号 domain_id	1afcC00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	80 — Trefoil
拓扑 Topology topology	10 — Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 —

结构域编号 domain_id	1afcD00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	80 — Trefoil
拓扑 Topology topology	10 — Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 —

结构域编号 domain_id	1afcE00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	80 — Trefoil
拓扑 Topology topology	10 — Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 —

结构域编号 domain_id	1afcF00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	80 — Trefoil
拓扑 Topology topology	10 — Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 —

结构域编号 domain_id	1afcG00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	80 — Trefoil
拓扑 Topology topology	10 — Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 —

结构域编号 domain_id	1afcH00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	80 — Trefoil
拓扑 Topology topology	10 — Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 —

▶

晶胞边长 a length_a	110.600 Å
晶胞边长 b length_b	110.600 Å
晶胞边长 c length_c	172.200 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	48

空间群 space_group	P 32 2 1
空间群编号 int_tables_number	154
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.700 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	0.2040
R_work r_work	0.2040
R_free r_free	—

描述 description	ACIDIC FIBROBLAST GROWTH FACTOR
分子量 formula_weight	15871.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H
原子数 atom_count	8304

STRUCTURAL STUDIES OF THE BINDING OF THE ANTI-ULCER DRUG SUCROSE OCTASULFATE TO ACIDIC FIBROBLAST GROWTH FACTOR

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ACIDIC FIBROBLAST GROWTH FACTOR

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1afc__assembly_2__model_1

1afc__assembly_2__model_1 | I(q)

1afc__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 branched

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (2)

来源生物 organism	Bos taurus
通用名 common_name	cattle
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9913
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

STRUCTURAL STUDIES OF THE BINDING OF THE ANTI-ULCER DRUG SUCROSE OCTASULFATE TO ACIDIC FIBROBLAST GROWTH FACTOR

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ACIDIC FIBROBLAST GROWTH FACTOR

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1afc__assembly_2__model_1

1afc__assembly_2__model_1 | I(q)

1afc__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 branched

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (2)