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1aqt

EPSILON SUBUNIT OF F1F0-ATP SYNTHASE FROM ESCHERICHIA COLI

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 60.9 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP SYNTHASE

Escherichia coli

UniProt P0A6E6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 3–138 片段：EPSILON CHAIN 突变：A1G, M2S 无其他共同聚合物 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 7.5；PROTEIN (4 MG/ML)IN 50 MM HEPES BUFFER, PH 7.5, 200 MM (NH2)2SO4, 2 M (NA/K)PO4 分辨率 2.30 Å R-free 0.288

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 1AQT Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1BSH SOLUTION STRUCTURE OF THE EPSILON SUBUNIT OF THE F1-ATPSYNTHASE FROM ESCHERICHIA COLI AND ORIENTATION OF THE SUBUNIT RELATIVE TO THE BETA SUBUNITS OF THE COMPLEX 提交 1998-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–138（138 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4；295 K；离子强度（mmCIF原始值）0.03；压力 10000
分辨率未提供
1BSN SOLUTION STRUCTURE OF THE EPSILON SUBUNIT OF THE F1-ATPSYNTHASE FROM ESCHERICHIA COLI AND ORIENTATION OF THE SUBUNIT RELATIVE TO THE BETA SUBUNITS OF THE COMPLEX 提交 1998-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–138（138 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4；295 K；离子强度（mmCIF原始值）0.03；压力 10000
分辨率未提供
1FS0 COMPLEX OF GAMMA/EPSILON ATP SYNTHASE FROM E.COLI 提交 2000-09-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–138（138 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；298 K；0.5M tartrate, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.10 Å R-free 0.269
1FS0 COMPLEX OF GAMMA/EPSILON ATP SYNTHASE FROM E.COLI 提交 2000-09-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–138（138 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；298 K；0.5M tartrate, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.10 Å R-free 0.269

共 3 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ATPE_ECOLI
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 3–138； UniProt 3–138

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1aqt

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1aqt
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1aqt
沉积日期 deposition_date1997-07-31
结构标题 titleEPSILON SUBUNIT OF F1F0-ATP SYNTHASE FROM ESCHERICHIA COLI
关键词 keywordsHYDROLASE, ATPASE, ATP SYNTHASE, EPSILON SUBUNIT; HYDROLASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier17.33 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron16.16 Å
零角强度 I(0) i04225180.00
分子量 molecular_weight14597.0 kDa
排除体积 excluded_volume18267 ų
包络体积 envelope_volume21646 ų
水化壳体积 shell_volume12162 ų
包络直径 envelope_diameter61.6 Å
壳层 Rg shell_rg20.90 Å
包络 Rg envelope_rg16.46 Å
形状 Rg shape_rg16.20 Å
总 Rg total_rg16.96 Å
总原子数 total_atoms1027
残基数 n_residues135
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax60.9 Å
Rg (实空间) rg_real17.39 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.51 Å
I(0) (实空间) i0_real4.2250e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error5.7280e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal17.38 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal4225000.0000
解质量估计 total_estimate0.7705
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks3
主峰位置 r_peak_primary20.0 Å
偏度 Skewness skewness0.449
峰度 Kurtosis kurtosis-0.150
角度范围 angular_range— – 0.4600 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha615400.0000
实空间数据点数 n_real_points77
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.706; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.899; Smooth: 0.000
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd1aqta1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.2 — Long alpha-hairpin
超家族 Superfamily superfamilya.2.10 — Epsilon subunit of F1F0-ATP synthase C-terminal domain
家族 Family familya.2.10.1 — Epsilon subunit of F1F0-ATP synthase C-terminal domain
结构域编号 domain_idd1aqta2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.93 — Epsilon subunit of F1F0-ATP synthase N-terminal domain
超家族 Superfamily superfamilyb.93.1 — Epsilon subunit of F1F0-ATP synthase N-terminal domain
家族 Family familyb.93.1.1 — Epsilon subunit of F1F0-ATP synthase N-terminal domain

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id1aqtA01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology15 — ATP Synthase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F0F1 ATP synthase delta/epsilon subunit, N-terminal
结构域编号 domain_id1aqtA02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily440 — ATP synthase delta/epsilon subunit, C-terminal domain
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8. 引用文献 (2)

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9. 文件与曲线 (10)