1ava

AMY2/BASI PROTEIN-PROTEIN COMPLEX FROM BARLEY SEED

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

BARLEY ALPHA-AMYLASE 2(CV MENUET)

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	BARLEY ALPHA-AMYLASE/SUBTILISIN INHIBITOR × 1 （P07596） CALCIUM ION × 4 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	BARLEY ALPHA-AMYLASE/SUBTILISIN INHIBITOR × 1 （P07596） CALCIUM ION × 4 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	AMY2_HORVU
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–403； UniProt 25–427 作者链 B； PDB构建体 1–403； UniProt 25–427

BARLEY ALPHA-AMYLASE/SUBTILISIN INHIBITOR

物种未注明

UniProt P07596

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	BARLEY ALPHA-AMYLASE 2(CV MENUET) × 1 （P04063） CALCIUM ION × 4 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	BARLEY ALPHA-AMYLASE 2(CV MENUET) × 1 （P04063） CALCIUM ION × 4 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	IAAS_HORVU
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–181； UniProt 23–203 作者链 D； PDB构建体 1–181； UniProt 23–203

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1ava
沉积日期 deposition_date	1997-09-15
结构标题 title	AMY2/BASI PROTEIN-PROTEIN COMPLEX FROM BARLEY SEED
关键词 keywords	HYDROLASE INHIBITION, ENZYME INHIBITOR COMPLEX; HYDROLASE INHIBITION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1ava__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1ava__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1ava__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	25.38 Å
Rg（电子密度）	24.39 Å
总 Rg	25.31 Å
原子数	4592
残基数	584
排除体积	80922 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1ava__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`1ava__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	BARLEY ALPHA-AMYLASE 2(CV MENUET)
分子量 formula_weight	44986.4 kDa
EC 编号 ec_number	3.2.1.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	9932

QVLFQGFNWESWKHNGGWYNFLMGKVDDIAAAGITHVWLPPASQSVAEQGYMPGRLYDLDASKYGNKAQLKSLIGALHGKGVKAIADIVINHRTAEHKDGRGIYCIFEGGTPDARLDWGPHMICRDDRPYADGTGNPDTGADFGAAPDIDHLNLRVQKELVEWLNWLKADIGFDGWRFDFAKGYSADVAKIYIDRSEPSFAVAEIWTSLAYGGDGKPNLNQDQHRQELVNWVDKVGGKGPATTFDFTTKGILNVAVEGELWRLRGTDGKAPGMIGWWPAKAVTFVDNHDTGSTQHMWPFPSDRVMQGYAYILTHPGTPCIFYDHFFDWGLKEEIDRLVSVRTRHGIHNESKLQIIEADADLYLAEIDGKVIVKLGPRYDVGNLIPGGFKVAAHGNDYAVWEKI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	BARLEY ALPHA-AMYLASE/SUBTILISIN INHIBITOR
分子量 formula_weight	19908.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

ADPPPVHDTDGHELRADANYYVLSANRAHGGGLTMAPGHGRHCPLFVSQDPNGQHDGFPVRITPYGVAPSDKIIRLSTDVRISFRAYTTCLQSTEWHIDSELAAGRRHVITGPVKDPSPSGRENAFRIEKYSGAEVHEYKLMSCGDWCQDLGVFRDLKGGAWFLGATEPYHVVVFKKAPPA

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	748

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_id	d1avaa1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.71 — Glycosyl hydrolase domain
超家族 Superfamily superfamily	b.71.1 — Glycosyl hydrolase domain
家族 Family family	b.71.1.1 — alpha-Amylases, C-terminal beta-sheet domain

结构域编号 domain_id	d1avaa2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.8 — (Trans)glycosidases
家族 Family family	c.1.8.1 — Amylase, catalytic domain

结构域编号 domain_id	d1avab1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.71 — Glycosyl hydrolase domain
超家族 Superfamily superfamily	b.71.1 — Glycosyl hydrolase domain
家族 Family family	b.71.1.1 — alpha-Amylases, C-terminal beta-sheet domain

结构域编号 domain_id	d1avab2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.8 — (Trans)glycosidases
家族 Family family	c.1.8.1 — Amylase, catalytic domain

结构域编号 domain_id	d1avac_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.42 — beta-Trefoil
超家族 Superfamily superfamily	b.42.4 — STI-like
家族 Family family	b.42.4.1 — Kunitz (STI) inhibitors

结构域编号 domain_id	d1avad_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.42 — beta-Trefoil
超家族 Superfamily superfamily	b.42.4 — STI-like
家族 Family family	b.42.4.1 — Kunitz (STI) inhibitors

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	1avaA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	80 — Glycosidases

结构域编号 domain_id	1avaA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1180 — Golgi alpha-mannosidase II

结构域编号 domain_id	1avaB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	80 — Glycosidases

结构域编号 domain_id	1avaB02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1180 — Golgi alpha-mannosidase II

结构域编号 domain_id	1avaC00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	80 — Trefoil
拓扑 Topology topology	10 — Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 —

结构域编号 domain_id	1avaD00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	80 — Trefoil
拓扑 Topology topology	10 — Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 —

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晶胞边长 a length_a	74.500 Å
晶胞边长 b length_b	96.180 Å
晶胞边长 c length_c	170.150 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.900 Å
最低分辨率 resolution_low	8.000 Å
R 因子 r_factor	0.2080
R_work r_work	0.2080
R_free r_free	0.2690

AMY2/BASI PROTEIN-PROTEIN COMPLEX FROM BARLEY SEED

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

BARLEY ALPHA-AMYLASE 2(CV MENUET)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

BARLEY ALPHA-AMYLASE/SUBTILISIN INHIBITOR

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1ava__assembly_1__model_1

1ava__assembly_1__model_1 | I(q)

1ava__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (2)

AMY2/BASI PROTEIN-PROTEIN COMPLEX FROM BARLEY SEED

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

BARLEY ALPHA-AMYLASE 2(CV MENUET)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

BARLEY ALPHA-AMYLASE/SUBTILISIN INHIBITOR

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1ava__assembly_1__model_1

1ava__assembly_1__model_1 | I(q)

1ava__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (2)